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尖锐湿疣潜伏期从HPV感染人皮肤粘膜后到尖锐湿疣损害出现需要一段时间，将这段时间称为尖锐湿疣潜伏期。尖锐湿疣潜伏期的长短因人而异，有些人的潜伏期短，有些人的潜伏期则较长。据调查尖锐湿疣的潜伏期为3周到8个月，平均2.8个月。
决定潜伏期长短主要有两方面的因素：一、人体自身免疫力强弱，二、入侵病毒数量。
一般女性自身免疫力较于男性要弱一些，所以一般女性潜伏期是2周到三个月，而男性潜伏期则为3-4个月，极少数身体强壮的男性甚至在一年后才会发病，却很少见女性感染了病毒8个月后才发病。由此可以断定自身免疫力对于抑制病毒蔓延能够起到一定的作用。
虽然潜伏期没有长出显性疣体，没有任何症状患者一般不自觉，但是潜伏期的患者已携带病毒，具备传染性，在不自知的情况下发生性关系会传染给性伴侣。还会因为潜伏期无症状而延误病情，所以在发现自己与尖锐湿疣患者发生性关系后要及时检测自己有没有感染尖锐湿疣病毒，早发现，早治疗。 为了提高尖锐湿疣的治疗效果南京优嘉病毒疣医学研究所采用“2011101665723”号中药专利配方，无需手术、打针、输液等，只需泡洗加内服，泡洗3-5天疣体会自动脱落不留疤。
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