鱼类的肠道与人类的肠道在消化食物上，其功能是大体相同的，都需要在微生物组的帮助下吸收食物的营养。而且科学家在研究中发现，人体生理盐水的浓度在0.9%，这与30亿年前海水中的浓度是一样的，所以科学家推测，人类很有可能是从海洋中进化走出来的。人类的健康食物中就有酸奶，其实就是通过在牛奶添加双歧杆菌发酵制得。同样，在鱼的饲料中添加鱼康肠与干酪乳杆菌，可以增强鱼类的免疫力，这些复合的微生物在鱼类肠道中定植，可以诱导巨噬细胞的吞噬和补体能力，增加血浆中免疫球蛋白含量，降低鱼的发病率。
当把饲料、菜粕、麦麸、酒糟等物料经过发酵，在物料中通过发酵生成的益生菌也是很好的免疫激活剂，可以通过提高干扰素和巨噬细胞的活性，产生非特异性免疫调节因子激发机体免疫功能，增强机体免疫力。丁酸梭菌、干酪乳杆菌在肠道黏膜表面定植后，会分泌一些抗菌物质，抑制其他微生物的入侵，增强鱼类的抗病能力。就像人体微生物组一样，细菌随着人类共同进化，正是由于微生物组增强了人的生存能力，所以提高了人的生存优势。同样，对于鱼类说，通过投喂发酵饲料，鱼体微生物组的人为增加，也是在增加鱼体对外源性病原菌的抵抗，防止外源性病原菌在鱼体内定植与扩增。
（物料发酵前后对比）
例如、鱼康肠所含的菌种丁酸梭菌含量高，是严格专性厌氧的革兰氏阳性芽孢杆菌，分类上属于梭菌属，能产生内生芽孢，容易在肠道中定植与增殖，耐高温，不受胃酸与胆汁的影响；能防止和控制肠炎、白便，本产品在虾场上试用，得到的反馈是可以防止虾的白便，在鱼上，也曾单独添加多次试验，得到了有效的反馈。
由于丁酸梭菌的稳定好，当在肠道中定植与增植后，能产生代谢产物丁酸，它是一种短链脂肪酸，具有修复肠道的上皮组织，促进上皮细胞再生的功能；而且丁酸本身也能发挥营养的作用，调节肠道中的有益微生物菌群，促进肠道中有益菌群的繁殖，抑制肠道中有害菌群的生长，调整肠道菌群紊乱。
鱼康肠在调节肠道菌群的同时，还能产生b簇维生素、维生素K等物质，调节肝脏的代谢功能，增强体质，提高抗应激能力，减少疾病发生。鱼康肠还能增强水产养殖动物对脂肪和蛋白质的消化吸收，提高饲料利用率，由于b簇维生素的生成，促进肝脏的代谢，所以还具有保肝、护肝，强化肝功能的作用，保进胆汁的分泌，减少空肠空胃。当物料经过发酵，还有大量的乳酸菌等菌种产生，也大多具有相类似的作用，只是丁酸梭菌与干酪乳菌的作用相对更加明显。
