黄元御作为尊经派的创始人，也是乾隆钦点的御医，最开始是深受皇帝的器重，不仅进了太医院，还得到了乾隆赏赐的五品顶戴。不仅如此，乾隆皇帝还给他赐号“玉揪子”、送棋、题词“妙悟岐黄”，这一连串的赏赐让黄元御一下子走向人生巅峰。但是，荣誉虽高，却也给他带来了不少的麻烦。
黄元御在进入太医院之后，面对的同事都是一些赫赫有名的名医，他们大多数都觉得自己高人一等。这突然院里来了个皇恩加身的一个人，又是赐官又是给题字，难免心中会生出不满。
放到现在来说，单位来了个新人特别受老板器重，老员工心里肯定会不舒服，这个呢是人之常情，都能理解。但是，黄元御的心直口快，可是在进太医院之前就把人得罪了。
黄元御在给乾隆看病时，说他的。这句话传进太医院，这些资深御医心里哪能服气。所以这人还没进太医院，就已经都得罪完了。
要是黄元御在进了太医院之后能稍微圆滑一点，其实这都不是什么大事，毕竟大家以后低头不见抬头见的，可偏偏这人心直口快，性格耿直，进太医院之后，发现身边的同行都平平无为，没什么高水准，所以他是很瞧不起这些医生的。
在古代，讲究“万般皆下品，惟有读书高。”读书当官才是正道，医学只能算是杂学。所以在官员中，医生是很被人瞧不起的职业，当黄元御作为医生在面对朝廷官员的时候，那种被轻视的感觉让曾经骄傲的他内心更加生出了对庸医的痛恨。
本来前途一片光明，如今被庸医所害，满腔才学从此一无是处，被官员的轻视，又想到自己眼疾毁容的自卑，造成了他自傲又自卑的性格，整个人非常的矛盾。
黄元御虽然性格不太好，但是医术是真的令人不得不服。他在中医史上有着举足轻重的地位。民国年间刻印的《黄氏医术11种》的序言中提到：黄元御被列为继黄帝、岐伯、秦越人（扁鹊）、张仲景之后的中医第五人。那我们熟悉的这四个人到底有多牛呢？
这四个人的实力和名气都不用多说，已经是家喻户晓的人物了。在此阵列内，连华佗孙思邈李时珍都要靠边站，黄元御却可以与其他四位并列排位，其实力不言而喻。但是，他却没有和其他四人一样名留青史，甚至连很多中医人都没有听过他。归根结底，还是因为他的臭脾气。
他曾在《四圣心源》中说过这么几段话：
这些话中全都表现出了他对庸医的不满，对普通医生学医不精而感到悲哀。不仅如此，黄元御在提到六气的时候说过：
从这些片段中可以看出，黄元御几乎每一个观点阐述完之后都会骂上几句，一本书得罪一波人，十一本书可不就把整个同行都给得罪完了。以致于在黄元御去世多年后，在整个中医行业内的名声都非常不好。
大家都说他哗众取宠，除了黄帝、岐伯、扁鹊、张仲景之外，天下所有的医生都给他骂了个遍，所以这就直接导致他在太医院过得非常不如意，处处被排挤，徒弟很少，书也没人出版，差点这一门手艺就绝了后。幸亏有位王爷的孙子非常钦佩他的医术，不仅拜师学医，还抄录了黄元御的多本书籍，才将这门奇术传了下来。
黄元御因为自己的臭脾气，被压制了两三百年，直到民国年间才有他的专著出版，所以放眼当今社会生存要混得开，情商非常重要。黄元御就是吃了这个亏，在太医院呆了半年，就被众人合起伙来排挤，他一怒之下，就辞官回乡。
这里又有个疑惑，黄元御既然是皇上特招进太医院的，理应受到皇上的庇护，这些人怎么敢这么明目张胆的排挤他呢？众所周知，乾隆是历史上最长寿的皇帝，89岁才驾鹤归西，黄元御给乾隆治病的时候乾隆39岁，正当壮年，生病极少，所以也就很少见御医。
久而久之乾隆就逐渐淡忘了这么一个人的存在，加上黄元御被整个太医院排挤，所以就算皇帝有心，这些事情别的人也会瞒着，不告诉皇帝。“天高皇帝远，”这宫门一道墙，就能挡住所有的消息。尽管之后皇帝知道了所有的事情，但那时黄元御已经辞官回了家，这就又是另外一个故事了。
黄元御回乡后，乡间邻里的老百姓都抱着看热闹不嫌事大的心态，在黄元御背后说三道四嚼舌根。有句话说，恨人有是笑人无，你过得好的时候，很多人会嫉妒你，你过得不好的时候，又有很多人会笑话你。
没进太医院之前，也是十里八乡受人尊敬的名医，但是现在又丢了官还是因为脾气不好，所以不可避免会有人嘲笑他。也许换做别人，听到这些忍忍就过去了，但是黄元御这个脾气火爆，还有点神经质，多疑敏感，所以这些话传到他耳朵里，肯定受不了，他在家里把自己关了半年，就又一次出门了，一是躲避现在的状况，再就是继续自己的游历，增加见识。
这次，黄元御选择往南走，因为他有个表哥姓孙，在扬州担任知府，黄元御此次南下，也是因为担心他的病情，至于他表哥的这个病，又是黄元御高超医术的一个体现。
当年他的表哥中了进士，被朝廷委任至扬州做知府，临行前亲朋好友为他送行，中医有送脉的传统，也就是免费体检，所以黄元御就给自家兄弟把了脉，这表哥向来身体健康，但是这一把脉黄元御却大惊失色，
这话要是别人说，肯定会被打，但黄元御远名在外，加之这位表哥一向信任他，所以到了扬州之后立马让人抓药按时服用，两年后果然这疮生在了腿上，但他寻遍医生，也没有人能看出来这疮是哪里转移过来的。眼看腿越来越疼，好不容易找到了一个人知道这是从别处转移过来的疮，但他也无计可施，说：
表哥一听这话，立马派人去找黄元御救命，却没想到黄元御正在赶来救他的路上。但是阴差阳错，这位江都知府没等到黄元御来就撒手人寰。
虽然故事很不幸，但黄元御这种能够提前预见疾病的例子，也就只在扁鹊张仲景这些名医身上发生过，黄元御医术到底有多好，大家应该心里都有自己的一个见解了。那黄元御后来又怎么样了呢？
