分享

【2018-40期】This Week in Extracellular Vesicles

 hzangs 2020-11-06

想督促自己多读文献吗?

想在科研之余做点其他的兼职吗?

那就请加入外泌体之家的编辑团队吧。

目前编辑团队正在招募科研编辑:负责撰写科普文稿,文稿一经录用会给予50元/千字稿酬。 您只需要保证每月提供一篇高质量的文稿即可加入团队。详情请垂询外泌体君(微信号:exosomer)

本周hzangs在最新文献中选取了8篇分享给大家,其中7篇提供中文摘要。1篇文章比较有意思,文章通过形态学观察发现血小板来源的细胞外囊泡在形态发生方面存在4中不同的情况,这一发现也进一步印证了细胞外囊泡的异质性;第2篇文章介绍了一种新型的微流控芯片用于检测外泌体;第3篇和第5篇分别报道了特定的外泌体长链非编码RNA在诊断方面的作用。相关文章的原文在周一前会发布到论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载

1. Dissecting the biochemical architecture andmorphological release pathways of the human platelet extracellular vesiculome.

解析人血小板细胞外囊泡的生化结构和形态释放途径。 

[Cell Mol Life Sci] IF=6.721  PMID:29427073

摘要:血小板细胞外囊泡(PEV)已成为细胞间通讯的潜在介质。 PEV表现出几种具有病理生理学重要性的活性,可作为诊断生物标志物。在这里,采用成像和分析技术揭示源自凝血酶受体激活肽(TRAP)激活的人血小板(PLT)PEV的释放,结构,组成和表面特性的形态学途径。基于广泛的电子显微镜分析,我们提出了从TRAP活化的PLT释放PEV的四种形态学途径:(1)质膜出芽,(2)多囊α-颗粒和细胞质液泡的挤出,(3)质膜起泡和(4) PLT伪足的“珍珠”。 PLT细胞外囊泡包括胞外颗粒,外泌体,游离线粒体,含线粒体的囊泡,“podiasomes”和PLT“ghosts”。有趣的是,流式细胞仪显示TOM20 + LC3 + PEV群体,可能是血小板线粒体自噬的产物。我们发现,通过差速离心分离的小PEV(S-PEV;平均直径103nm)和大EV(L-PEVs;平均直径350nm)部分之间的脂质组学和蛋白质组学特征是不同的。此外,由活化的PLT释放的大多数PEV由S-PEV组成,其与L-PEV相比具有显着高于每单位PEV表面积的凝血酶产生活性,并且贡献了大约60%的PLT囊泡细胞促凝血效力。

PS:细胞外囊泡的形成过程中的形态学特征报道很少见,这篇文章分析了血小板来源的细胞外囊泡的形态学发生过程,根据不同的形态学发生特征将细胞外囊泡的产生分成了4种形式。进一步研究发现了血小板来源的细胞外囊泡具有不同大小的亚群,亚群之间存在着比较大的差异。

2. Detection of exosomes by ZnO nanowires coated three-dimensional scaffold chip device.

通过ZnO纳米线涂覆的三维支架芯片装置检测外泌体。 

[Biosens Bioelectron] IF=8.173  PMID:30265971

PS:外泌体检测装置的报道。这是一种新型的微流控检测系统,检测下限在22000个外泌体/微升。Hzangs对于这些技术了解不多,就不班门弄斧了,相关领域的朋友可以关注一下。

3.  Expression signatures of exosomal long non-coding RNAsin urine serve as novel non-invasive biomarkers for diagnosis and recurrence prediction of bladder cancer.

尿液外泌体长非编码RNA的表达特征作为膀胱癌诊断和复发预测的新型非侵入性生物标志物。 

[Mol Cancer] IF=7.776  PMID:30268126

摘要:最近,已经有文章提出外泌体长非编码RNA(lncRNA)的表达特征可作为癌症检测的潜在的非侵入性生物标志物。在这项研究中,我们的目的是开发一种尿液外泌体(UE)衍生的lncRNA组用于膀胱癌(BC)的诊断和复发预测。进行定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)以筛选和评估训练组(208个尿液样品)和验证组(160个尿液样品)中8个候选lncRNA的表达。建立由三种不同表达的lncRNA(MALAT1,PCAT-1和SPRY4-IT1)组成的组用于训练组中的BC诊断,结果显示(ROC)曲线下面积(AUC)为0.854。随后,在验证组中AUC为0.813,进一步验证了该组合的性能,其显着高于尿细胞学(0.619)分析。此外,Kaplan-Meier分析表明,PCAT-1和MALAT1的上调与非肌肉浸润性BC(NMIBC)的无复发生存率(RFS)有关(分别为p <0.001和p = 0.002),多变量Cox比例风险回归分析显示,外泌体PCAT-1过表达是NMIBC RFS的独立预后因素(p = 0.018)。总之,我们的研究结果表明,UE衍生的lncRNAs在BC的诊断和预后中具有相当大的临床价值。

PS:临床样本分析报道。来自山东大学的研究者们介绍了从尿液外泌体分析长链非编码RNA用于诊断膀胱癌的研究成果。文章发现可以通过检测MALAT1,PCAT-1 和 SPRY4-IT1三个lncRNA组合用于膀胱癌的诊断。研究思路比较简略,得到的结果不错。感兴趣的朋友可以关注一下。

4. Melanoma cell-secreted exosomal miR-155-5p induce proangiogenic switch of cancer-associated fibroblasts via SOCS1/JAK2/STAT3 signaling pathway.

黑素瘤细胞分泌的外泌体miR-155-5p通过SOCS1 / JAK2 / STAT3信号传导途径诱导癌相关成纤维细胞的促血管生成转换。 

[J Exp Clin Cancer Res] IF=6.217  PMID:30285793

摘要:大量的报道证明癌症相关成纤维细胞(CAF)能够促进肿瘤血管生成。然而,CAF的促血管生成表型产生的潜在机制仍然知之甚少。本研究旨在阐明CAF促血管生成功能的机制。我们用B16和B16F10衍生的外泌体处理NIH / 3T3细胞。然后通过RT-PCR和Western印迹检测CAFs标记和促血管生成因子。进行CCK-8测定,transwell迁移测定,管形成测定和体内Matrigel栓测定以确定CAF的促血管生成能力。 Western blot和AG490用于研究Janus激酶2 /信号转导和转录激活因子3(JAK2 / STAT3)信号通路在CAF促血管生成转换中的作用。使用生物信息学分析,荧光素酶报告基因测定,microRNA模拟物和抑制剂以及异种移植物模型来研究mmu-miR-155-5p(miR-155)在CAF的促血管生成转换中的作用。我们发现黑色素瘤细胞分泌的外泌体可以诱导成纤维细胞重编程为CAFs,并且外泌体miR-155可以触发CAF的促血管生成表型。机制方面,外泌体来源的miR-155递送到成纤维细胞中并促进包括血管内皮生长因子A(VEGFa),成纤维细胞生长因子2(FGF2)和基质金属蛋白酶9(MMP9)等促血管生成因子的表达。这一过程是通过直接靶向SOCS1,激活JAK2 / STAT3信号传导途径实现的。用含有过表达miR-155的外泌体处理可以促进血管生成,并且黑素瘤细胞分泌的外泌体中miR-155的减少能够在体外和体内减轻血管生成。这些结果表明,通过SOCS1 / JAK2 / STAT3信号通路促进受体成纤维细胞中促血管生成因子的表达,黑素瘤细胞分泌的外泌体miR-155可诱导CAF的促血管生成表型。尽管肿瘤血管生成受各种因素的调节,但外泌体miR-155可能是控制黑素瘤血管生成的潜在靶标,并且用于建立治疗黑素瘤的新策略。

PS:肿瘤来源的外泌体对肿瘤相关成纤维细胞具有调节作用,后者可以促进肿瘤血管生成,这其中的机制有待解决。武汉大学的研究者们发表的最新文章从外泌体miRNA的角度解释了这一过程。文章发现miR-155可以通过外泌体从肿瘤转移到肿瘤相关成纤维细胞,进而诱导成纤维细胞产生促血管生成表型。经典的外泌体miRNA研究报道,值得大家学习一下。

5. Exosome-transmitted long non-coding RNA PTENP1 suppresses bladder cancer progression.

外泌体传播长非编码RNA PTENP1抑制膀胱癌进展。 

[Mol Cancer] IF=7.776  PMID:30285771

摘要:肿瘤微环境中的细胞外通信在肿瘤进展中起关键作用。尽管外泌体可以包装长链非编码RNA(lncRNA)介导细胞外通讯,但外泌体lncRNA PTENP1在膀胱癌(BC)中的作用仍不清楚。我们在BC患者和健康对照的血浆来源的外泌体和组织中检测到PTENP1的表达。我们通过ROC曲线和曲线下面积(AUC)评估其用于诊断的准确性,并通过细胞和动物实验以确定外泌体PTENP1的作用。我们发现,BC患者的BC组织和外泌体中PTENP1显着降低(P <0.05)。我们发现PTENP1主要由外泌体包裹。外泌体PTENP1可区分BC患者与健康对照(AUC = 0.743; 95%置信区间(CI)= 0.645-0.840)。正常细胞分泌外泌体PTENP1并将其传递给BC细胞,从而通过增加细胞凋亡和降低侵袭和迁移能力来抑制BC细胞的生物学恶性行为(P <0.05)。外泌体PTENP1可抑制体内肿瘤生长。机制方面,我们发现外泌体PTENP1通过竞争性结合miRNA-17介导PTEN的表达。外泌体PTENP1是一种有前景的新型生物标志物,可用于BC的临床检测。来自正常细胞的外泌体将PTENP1转移至BC细胞,其在体外和体内均缓解BC的进展。

PS:外泌体可以传递长链非编码RNA是目前的共识,但是外泌体长链非编码RNA的研究报道比较少。这可能是受制于外泌体及长链非编码RNA的相关研究技术不完善。这篇文章报道了一个外泌体长链非编码RNA。作者发现在膀胱癌患者的血浆外泌体中长链非编码RNA PTENP1的表达是下调的,通过ROC曲线分析显示这一差异是潜在的膀胱癌诊断标志物。进一步研究发现PTENP1可以通过外泌体从正常细胞转移到膀胱癌细胞通过结合miRNA-17上调PTEN表达来抑制膀胱癌进展。

6. Milk-Derived Exosomes and Metabolic Regulation.

乳汁来源的外泌体和代谢调节。 

[Annu Rev Anim Biosci] IF=6.775  PMID:30285461

摘要:外泌体是天然纳米粒子,在细胞间通讯中发挥重要作用。通过从供体到受体细胞转移内容物(例如微小RNA)以及外泌体与细胞表面受体结合来实现通信。外泌体及其内容物也可从膳食来源获得,例如乳汁。外泌体和细胞糖蛋白对肠道摄取至关重要。大部分乳汁外泌体会在大脑中积累,而microRNA货物的组织分布在不同种类的microRNA中不同。没有被吸收的乳汁外泌体可以引起肠道微生物群落的变化。外泌体及其内容物的膳食耗竭导致循环微小RNA的丧失并引发相应表型,例如认知能力丧失,嘌呤代谢物增加,生殖力丧失和免疫应答的变化。乳汁外泌体符合生物活性食品化合物的定义。

PS:乳汁来源的外泌体相关报道也比较多。这篇综述文章从乳汁外泌体对代谢调节角度入手,汇总和回顾了目前乳汁外泌体对代谢的调控作用。

7.  BHLHE40 confers a pro-survival and pro-metastatic phenotype to breast cancer cells by modulating HBEGF secretion.

BHLHE40通过调节HBEGF分泌促进乳腺癌细胞存活和转移表型。 

[Breast Cancer Res] IF=6.142  PMID:30285805

摘要:转移是导致乳腺癌相关死亡的主要原因。缺氧是癌症转移的主要驱动力之一,它诱导转录调节因子BHLHE40的表达。本研究旨在阐明BHLHE40在乳腺癌细胞转移过程中的作用。为了确定BHLHE40在乳腺癌中的作用,BHLHE40的表达被针对BHLHE40的短发夹RNA或由CRISPR / Cas9编辑系统敲除的慢病毒抑制。原位异种移植和实验性转移(尾静脉注射)小鼠模型用于分析BHLHE40在乳腺癌肺转移中的作用。我们通过基因表达谱分析和公共数据库挖掘以鉴定BHLHE40在乳腺癌中调节的信号传导途径。通过染色质免疫沉淀(ChIP),共免疫沉淀(CoIP),外泌体分析和基于细胞的转移潜能测定检查BHLHE40的作用机制。我们发现,BHLHE40敲低显着降低了乳腺癌的原位异种移植和实验性转移模型中的原发性肿瘤生长和肺转移。基因表达分析暗示BHLHE40在肝素结合表皮生长因子(HBEGF)的转录激活中的作用。 ChIP和CoIP测定显示BHLHE40通过阻断组蛋白脱乙酰酶(HDAC)1和HDAC2的DNA结合诱导HBEGF转录。基于细胞的分析显示HBEGF通过外泌体分泌并起到促进细胞存活和迁移的作用。公共数据库提供了证据表明BHLHE40和HBEGF的高表达与三阴性乳腺癌的预后不良有关。该研究揭示了BHLHE40通过调节HBEGF分泌促进肿瘤细胞存活和迁移的新作用。

PS:外泌体在肿瘤转移过程中发挥着重要的作用,很多转移相关的分子都会通过外泌体进行传递。缺氧环境是肿瘤组织中较为常见的微环境之一,而缺氧环境通常会诱发转移相关基因的表达。这篇文章研究了BHLHE40在肿瘤转移过程中的作用,并且发现BHLHE40影响了HBEGF的表达,后者则可以通过外泌体进行传递进而影响肿瘤的行为。

8. Roles of microRNAs in T cell immunity: Implications for strategy development against infectious diseases.

microRNAs在T细胞免疫中的作用:对开发抗传染病策略的启示。 

[Med Res Rev] IF=8.29  PMID:30272819

摘要:T细胞免疫在病原体感染中起着至关重要的作用。 MicroRNA(miRNA)是小的单链非编码RNA,其通过靶向与T细胞活化,分化和功能相关的关键转录因子,信号传导蛋白和细胞因子来调节T细胞免疫。 T细胞中miRNA表达的失调可以导致特异性免疫应答,并且可以提供针对各种传染病的新治疗机会。在这里,我们总结了最近的研究,这些研究关注miRNA在T细胞免疫中的作用,并突出了miRNA在流行的传染病中的功能。此外,我们还提供了细胞外囊泡miRNA功能的见解,并试图描绘miRNA分选进入细胞外囊泡的机制及其免疫调节功能。此外,总结了针对传染病的miRNA递送的方法和策略。最后,提出了基于miRNA的疗法的潜在策略。

PS:一篇综述文章,总结回顾了miRNA在T细胞免疫调控过程中的研究进展,同时对细胞外囊泡miRNA在T细胞免疫调控先关过程中的分选、传递和调控机制进行了汇总和探讨。

hzangs建立了qq实名交流群,感兴趣的来哦~

欢迎大家来这里聊聊天,交流交流课题。同时也可以试着解决个人问题
为了保证群内部的交流信息的可靠性,避免软广告等可能影响大家科研思路的事件发生,该qq群采取实名制度。

QQ群号:450453711   

实名入群加群验证消息请注明:姓名+单位谢谢大家配合!

hzangs等着你们来哦~

今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见! 

科研学习班了解一下~ ~(点击详细了解)

英语差、零基础就和SCI没缘分吗?NoNoNo

资深润色主编手把手教你如何进行SCI写作

没有任何实验数据,这篇近3分的SCI是怎么发表的!?

芯片及测序高通量数据关键靶标基因筛选分析学习班

不做实验,不写meta分析,轻轻松松发40多篇SCI

2019国自然基金标书构思及撰写经验分享会

无实验无数据没关系,挖掘别人的数据发表自己的文章

不做实验,不写meta分析,用这个方法轻轻松松发多篇SCI论文

怎么挖别人的数据,发表自己的文章?

“万用模版” SCI英文论文写作法学习班

学术推荐 | 最接地气的【生物信息数据挖掘培训班】

回复“外泌体” 阅读外泌体最新科研进展及动态

回复“EV 阅读 2016-2018年This Week in Extracellular Vesicles

回复“盘点” 阅读 外泌体领域十大前沿进展盘点

    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章