多模态三维影像重建的基础：数据、数据的配准，这两个基础没做好，后面的重建工作就没法进行下去。目前数据获取最大的难题就是大部分医院的影像系统仍然比较封闭，需要临床医生亲自到影像科拷贝数据，或者刻盘，甚至有些数据无法拷贝，而如果要将影像重建技术运用于临床，就必须要用到自己患者的数据进行处理，这个难题目前无法解决，建议多和影像科及信息科交流，逐步改善影像系统。我们医院的PACS影像系统很不错，在这里要赞一下这个系统，只要影像科及时把扫描原始数据上传到系统后，马上就能在科室内网电脑上直接下载保存，见图1，非常的方便
图1 这次我们先谈谈数据，就是我们要建出即漂亮、又实用的模型，到底需要用到CT、MRI哪些序列。只有搞明白了，我们才好向影像科的老师们提要求，这也是目前想学影像重建老师们问我最多的问题，比如下面这两张图，到底需要哪些序列的数据？  图2 图3 图2重建需要T1 3D、T1+3D 序列（层厚1mm），CT平扫、CTA、CTV（层厚0.625mm），图3需要加一个DTI序列，这两张图是比较完整的一个肿瘤多模态的重建病例。下面具体谈谈重建分别需要的数据序列: 脑组织:效果最好的数据是T1 3D，其它比如T1+3D，CT平扫薄层也可以，推荐有条件的医院要求影像科颅内肿瘤病人常规加扫T1 3D序列。处理软件：freesurfer，SPM12下的CAT12插件，3D slicer里的Swiss Skull Stripper模块等。Freesufer处理效果最好，但对于大脑皮层有异常信号的数据不能处理，耗时最长，几小时到几十小时不等；SPM12效果稍差，但耗时较短，一般几十分钟，对于脑压高的病人数据剥脑后重建脑回显示欠佳；Swiss Skull Stripper模块简单、快捷，但是效果最差。另外还有FSL软件里的bet也可以剥脑，虽然处理速度快，但是效果也不太令人满意。综合来看，推荐使用CAT12作为主力处理软件
 图4（freesurfer处理后重建）
 图5（cat12处理后重建）
脑血管：所需序列，MRA、MRV，CTA，CTV。MRA、MRV优势是重建出的血管效果平滑，重建快捷、简单，缺点是次级小血管部分无法显示，尤其是静脉，细节丢失较多；CTA、CTV次级血管显示较好，细节保留更多，但重建出的血管不够平滑，尤其是与颅骨相邻的血管，虽然可以利用平扫数据进行减影，但效果还是会比MRA和MRV稍差一些，重建耗时也会更多。为了更好的指导临床手术，细节保留是最重要的，所以推荐使用CTA、CTV结合CT平扫减影来重建大脑动、静脉系统 图7（MRA、MRV重建）
 图8（CTA、CTV重建）
肿瘤：所需序列，3D+T1、T2 3D、CTA 。用的最多的还是3D+T1序列，部分没有强化的肿瘤需要T2 3D序列，要求不高的时候也可以用CTA数据来重建
图9（低级别胶质瘤重建） 白质纤维束和颅神经：所需序列，DTI、FIESTA-C（GE磁共振命名，其它品牌会有不同）、T1 3D。DTI序列扫描参数一般设置为20-30个方向，层厚2mm-5mm，一般大的纤维束重建完全够用。方向数越多，层厚越小，颅神经重建出来的机率就更大，也会更精细，颅神经的重建需要结合T1 3D序列作为结构像进行重建；颅神经也可以根据FIESTA-C序列，通过影像辨别进行人工勾画分隔重建，个人观点，通过DTI重建更符合颅神经的真实走行。目前后组颅神经重建还比较困难，使用DSI数据重建，目前来看效果是最好的
 图11（部分大脑纤维束重建）以上是本人关于多模态影像三维重建数据方面的一些经验和体会，希望能够帮助到各位老师，其中会有一些不够专业和局限的观点，希望各位老师能够指出下一期准备谈谈相关序列数据的配准问题，都是大家在配准过程中容易碰到的问题。后面会陆续出关于多模态影像三维重建的教程，希望各位有兴趣的老师多多关注3DSlicer社区
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