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多肽合成 采用逐步缩合定向法以得到具有特定氨基酸顺序的多肽，把不需要反应的氨基羧基用基团保护起来，再进行连接反应，保证定向反应的顺利进行。 液相法和固相法是多肽合成的主要方法。固相法具有可自动化操作，产物易分离的优势而被更加广泛地使用。分为Fmoc和tBoc法，由于前者具有更大优势，故如今多采用Fmoc法合成。
基本流程： 1. 去保护：Fmoc保护的柱子和单体必须用一种碱性溶剂（piperidine）去除氨基的保护基团。 2. 激活和交联：下一个氨基酸的羧基被一种活化剂所活化。活化的单体与游离的氨基反应交联，形成肽键。在此步骤使用大量的超浓度试剂驱使反应完成。循环：这两步反应反复循环直到合成完成。 3. 洗脱和脱保护：多肽从柱上洗脱下来，其保护基团被一种脱保护剂（TFA）洗脱和脱保护。 多肽的修饰 多肽修饰是改变肽链主链结构和侧链基团的重要手段。多肽修饰的方法主要分为液相法和固相法。常见的多肽修饰是乙酰化，烷基化，生物素修饰，磷酸化或磺酸化等。具体修饰原理以组蛋白的乙酰化为例：
组蛋白中赖氨酸的N端残基可发生乙酰化，且可逆。在乙酰基转移酶的作用下，在赖氨酸的N短引入乙酰基。 多肽的耦联 多肽的偶联有三种方式：偶联在多肽的N端的氨基酸上；偶联在多肽的C端氨基酸上；偶联在多肽序列中的半胱氨酸上。 用于与多肽耦联的载体蛋白有多种，其中最常用的是keyhole limpethemacyanin (KLH),牛血清白蛋白（bovineserumalbumin，BSA）,卵清蛋白（ovalbumin，OVA）和牛甲状腺球蛋白（bovine thyroglobulin，THY)。KLH具有更高的抗原性，是最为常用的多肽耦联载体。 EDC(1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimidehydrochloride)或carbodiimide方法是将多肽和载体耦联的常用方法。Carbodiimides能激活天冬酰胺酸及谷氨酸的侧链羧基集团及末端羧基集团，使之与主胺基发生耦联反应。激活的多肽与载体蛋白混合而产生最终的共轭体。如果载体蛋白先被激活，EDC方法则通过N－末端alpha－氨基，或者，如果序列中有赖氨酸的话，则可以通过赖氨酸的侧链氨基与载体蛋白耦联。
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