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中医和西医只有两个区别，一个是对人与自然关系的认识，一个是对整体与局部关系的认识。西医基于观察不到就不存在的理由否定了这两种关系，才造成了中西医之间的矛盾。可研究人与自然关系，以及整体与局部关系的科学是体系是什么？它就是系统科学！事实上，科学家们很早就认识到了机械还原论的缺陷，也尝试着发展系统论来认识世界。但是，这个发展出来的系统论却是建立在还原论之上，机械地拼凑出来，用它解释不了任何物质系统秩序的存在。原因很简单，只有相信万物归一，才有可能产生真正的系统论，而西方科学一直假定了少数几个死寂不变的基本粒子的存在，这样一来，只可能产生还原论，而不是可能产生系统论。中国先人认识这个世界一开始就走上了系统论，根源就在于万物归一的假设，它就体现在气一元论之中，按照这个学说，空间中连续着不对称运动的统一物质，万物都是在反抗这种不对称运动中产生、发展、壮大、衰退、灭亡的。显然，如果万物归一，自然规律肯定不是什么可观察的东西，而只可能是一个无形无象、无所不在的组织原理，或者说系统的发展规律。相反，如果相信万物是由少数几个基本粒子组成的，那么自然规律只可能体现在那几个基本粒子的个性之上，把它们还原出来，自然规律就找到了。西方科学一直是在这个前提假设之上来认识这个世界的。现在的问题是，哪一个前提假设更符合自然的事实。因为如果前提假设与自然事实不符的话，那么这个科学体系就象建立在沙堆上，早晚会崩塌的。首先我们来看到底是否存在死寂不变的基本粒子，目前大量科学实验已经证明，所有基本粒子都可以转化为同一种更基本的东西——能量，用能量也可以造出所有基本粒子，如果把能量视为物质性的东西，那么万物归一的假设就被证明了，而西方整个科学体系就站不住脚了。其次，我们来看空间，到底是否连续着物质。哲学早就告诉我们，自然界的一切现象都是由物质的相互作用产生的，如果你相信这一点，就会相信空间中一定连续着物质，否则引力是怎样传递过来的，普遍联系是如何产生的，这些都无法想象，更无法落实到物质的相互作用之上。现在，越来越多的科学家开始相信物质在空间中的连续性，暗物质的猜测就是证明。有很多人可能会问，这两个前提假设和系统科学有什么关系呢？关系大了！如果没有物质的统一性假设，那么普遍联系就无法解释，因为我们无法想象几个死的基本粒子之间产生什么联系。只有物质统一了，普遍联系才可能通过物质之间的相互交换得以实现。同理，如果没有物质在空间中的连续性假设，生命问题就无法解释，死的基本粒子怎么可能拼凑出来就成了生命。只有象气一元论那样假定空间中连续着物质，而且它们都是在紧张地相互压迫与反抗中存在的，生命问题才能够得到合理地解释。简单地说就是动即生命，万物皆动， 万物都有生命。可以毫不夸张地说，没有物质的统一性假设和物质的连续性假设，是不可能产生真正的系统论的。中国对世界的认识走向了系统论，根源就在于气一元论假设，而西方科学对世界的认识走向了还原论，根源就在于原子说假设。在西方科学的前提假设之上，建立的一切系统理论都是对现象的一种总结，或者说是拼凑出来，没有多少实际的意义。
西医是建立在西方科学之上，它走的是一条还原论道路，中医是建立在东方科学之上，它走的是一条系统论道路。西医注重的是组成人体的基本构件，而中医注重的是人与自然的关系，以及整体与局部的关系。认识不到这些关系，西方科学是永远解释不了中医的。
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