今天和大家分享的是2020年3月发表在Clinical Cancer Research(IF:8.911)上的一篇文章,“A 15-gene immune, stromal and proliferation gene signature that significantly associates with poor survival in patients with pancreatic ductal adenocarcinoma”,作者筛选了15个与胰腺导管腺癌不良预后显著关联的基因标签,并结合了一些肿瘤的临床病理特征在数据库和临床组群中验证其预测效果。 一、 文章背景胰腺导管腺癌(PDAC)是一种消化道肿瘤,恶性程度高,预后差。肿瘤免疫微环境(TME)的基质成分在介导不良预后和化疗抗性中起重要作用。其中,肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)-抗肿瘤免疫,免疫基因标签和基质表型,以及一些增殖相关基因与胰腺癌不良预后显著关联。本篇文章中,作者利用TCGA数据库分析鉴定出15个免疫,基质,增殖(ISP)相关基因标签,有助于临床PDAC患者的预测及治疗方案的选择。 二、 分析流程三、 结果解读1.鉴定PDAC不良预后的15个风险分级基因标签
2.ISP基因标签鉴定PDAC不良预后分子亚型效果显著
3.ISP基因标签可作为PDAC患者的独立风险因子和预后因子
图3. 单变量分析:ISP和其他临床病例特征的HR
图4.多变量分析:ISP和其他临床病理特征的HR 4.建立PDAC临床预测模型列线图
小结 本篇文章中,作者系统全面的筛选了PDAC不良预后的分子标志物,筛选出15个可以鉴定PDAC不良分子亚型并进行风险分级的ISP基因标签,并在验证集中验证。最后,作者又结合ISP基因标签和肿瘤重要的临床病理特征建立了一个风险列线图,为临床上鉴别高风险PDAC患者和预测不良预后提供了一个可行的方案。 LimitationTCGA数据集中ISP高表达患者5年OS比临床验证组群的5年OS差,可能是由于临床组群提供了多学科治疗(包括新辅助治疗和放化疗)。此外,公共数据组群中一些临床病理信息以及新辅助疗法信息丢失了。 |
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