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 骨科笔记 2021-01-06

1

两组间比较    

对于数值变量,首先进行正态性检验,如果各组均满足正态性且两组间方差相等,采用均数±标准差进行统计描述,采用t检验进行组间比较;否则采用中位数(四分位数间距)进行统计描述,采用非参数检验(Mann-whitney检验)进行组间比较。对于分类变量,采用例数(百分比)的形式描述,组间比较采用χ2检验或精确概率法。

正态性检验可参考:

OMG:我直接用t检验,竟然被拒稿了?

多组多个变量正态性检验的“一气呵成”(干货)

两独立样本t检验可参考:

独立样本t检验

两独立样本非参数检验(Mann-whitney检验)可参考:

t检验不能用,应该用非参数检验(Mann-Whitney U 检验)

中位数(四分位数间距)的计算可参考:

 数据不符合正态分布,如何统计描述

χ2检验和精确概率法可参考:

卡方检验与精确概率法

整理统计结果太麻烦,可参考

【视频教程】临床基线资料table1快速生成

论文中临床资料整理太麻烦,其实完成table1只需不到10分钟

【修订版】对中文期刊友好的,临床基线资料table快速生成,不学就OUT了

数据探索可参考:

这张统计图,强烈推荐,包括了直方图、密度曲线、散点图、趋势线、相关系数及显著性

02 

多组间比较

数值变量如果服从正态分布,采用均数±标准差进行统计描述,采用方差分析进行组间比较,如果组间差异有统计学意义,进一步采用LSD法(也可以是其它方法)进行两两比较。如果不服从正态分布,采用中位数(四分位数间距)进行统计描述,组间比较采用非参数检验(Kruskal-Wallis秩和检验),当组间总的有统计学差异,进一步采用Dunn法(也可以是其它方法)进行多重比较。

对于分类变量,采用例数(百分比)的形式描述,组间比较采用χ2检验或精确概率法,当组间总的有统计学差异,进一步采用χ2检验或精确概率法进行两两比较,两两比较的P值需采用Boferroni法进行校正。

单因素方差分析及两两比较:

 单因素方差分析及两两比较

Kruskal-Wallis秩和检验及两两比较:

方差分析不能用,那就用多组独立样本的非参数检验

卡方检验或精确概率法及两两比较:

基于SPSS软件实现多组比较的卡方检验及两两比较

卡方检验和精确概率法及两两比较

03 

Logistic回归

首先采用单因素logistic回归进行危险因素的初筛,将单因素分析中P<0.10的因素纳入多因素logistic回归,多因素分析以P<0.05认为有统计学意义。

Logistic回归:

基于多因素Logistic回归分析,筛选可能的独立危险因素

单因素logistic回归,这么多自变量,重复点菜单,太浪费时间

04 

诊断试验之ROC

金标准是二分类变量,诊断指标是数值变量,绘制ROC曲线,计算ROC曲线下面积,判断指标的诊断价值,并ROC曲线最靠近左上角的点作为cut-off值,探索最佳截断点。

如果涉及到联合诊断,则描述为:分析A法、B法及二者联合诊断结果与金标准的一致性,绘制ROC曲线,根据曲线下面积评估各种方法及联合诊断的诊断价值。

ROC曲线绘制:

ROC曲线还在用SPSS或Graphpad,就OUT了

ROC联合诊断:

ROC曲线评价多指标联合诊断的价值

ROC曲线两两比较:

【ROC曲线】哪种诊断方法的准确性更好?

联合诊断ROC分析及曲线下面积的比较

05

诊断试验之Kappa

金标准是二分类变量,诊断指标也是二分类变量,计算新诊断方法的灵敏度、特异度等指标,并计算二者的Kappa一致性系数,并进行统计学检验,如果P<0.05,认为二者的一致性具有统计学意义,并且Kappa一致性系数越高,说明二者的一致性越高。

Kappa一致性检验:

两种诊断方法比较,配对χ2检验 or Kappa?

配对卡方检验与Kappa检验:结果不一致

06

科研效率提升

读文献太慢,写文章太难,建议参考:

英文文献太难读,SCI太难写,科研达人推荐了这些

刚写完的英文文章,有不少拼写和语法错误,建议参考:

杂志编辑:你的文章有大量语法和拼写错误,我是如何应对的

浏览器用的好,可以大大提升科研效率,建议参考:

 Chrome秒变科研神器, 大佬不想告诉你的一些秘技

工作科研学习,效率太低,是因为浏览器没这么用

文献下载神器,可参考:

 听说你的Pubmed插件Scholarscope不能用了

07

临床预测模型系列

【预测模型】构建Logistic模型并绘制列线图

【预测模型】Logistic回归模型验证:绘制ROC曲线,计算AUC及95%CI,以及不同模型的比较

【预测模型】单因素logistic回归,这么多自变量,重复点菜单,太浪费时间

【预测模型】Logistic回归模型校准图(Calibration plot)绘制

【预测模型】自助法(Bootstrap法)生成1000个C统计量(C index)并计算95%可信区间

【预测模型】构建COX回归模型并绘制列线图

【预测模型】构建COX回归模型,绘制ROC曲线,计算AUC及95%可信区间

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