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访中国科学院大学附属肿瘤医院(浙江省肿瘤医院)方美玉主任:临床医生眼中肺癌高通量基因检测的现状和发展趋势

 e药安全 2021-01-14

近日,小编有幸邀请到了中国科学院大学附属肿瘤医院(浙江省肿瘤医院)方美玉主任,为我们带来肺癌高通量领域的相关知识。

访

问:请您给我们介绍一下中国肿瘤现状?

答:首先介绍几个数据,当前中国癌症发病约占全球22%,标化发病率174.0/10万,世界平均水平为182.3/10万。中国癌症发病率位居全球癌症发病率的74位,但是发病人数高居全球第一。中国癌症死亡约占全球27%标化死亡率122.2/10万,世界平均水平为102.4/10万。中国癌症死亡率位居全球癌症死亡率的29位。整体来看是发病率和死亡率均上升。主要问题是肿瘤发病机制复杂,有效筛查技术少,早期诊断技术水平低等因素导致肿瘤发现时普遍偏晚。同时肿瘤治疗效果差、复发转移率高且肿瘤治疗副作用大等原因导致肿瘤治疗难度极大。

肺癌是我国第一大癌种,不久前,国家癌症中心赫捷院士领衔的肺癌诊疗多学科团队,在国际权威期刊《J Thorac Oncol》杂志发表的社论,介绍了中国肺癌筛查防控现状以及治疗进展,指出CT筛查诊断最有效,对I至II期肺癌,手术治疗是关键。超过三分之一的肺癌患者在确诊时即为晚期或转移性疾病,全身系统治疗是主要的治疗策略,包括化疗,靶向治疗和免疫治疗。

 

问:近年来随着肺癌驱动基因的发现和相应靶向药物的研究和应用,肺癌的治疗已经走上了以基因为导向的个体化治疗之路。您认为,肺癌个体化精准治疗中的难点有哪些?

答:2008年的IPASS研究应该说是开启了肺癌个体化精准治疗的大门,肺癌患者若存在EGFR基因敏感位点突变,就可以从吉非替尼中获得比传统化疗更长的高质量的生存获益,随后我们又发现了ALK,ROS1,RET ,NTRK等融合靶点。靶向治疗见效快,副作用小,但靶向药物存在耐药问题,因此肺癌个体化精准治疗另一个前提和难点就是“动态监测不同个体的耐药机制”,根据不同的耐药机制“拥有对应的治疗措施”。比如EGFR,经过一二代EGFR-TKI治疗发生耐药,其中50%患者发生T790M耐药突变,可以继续使用三代药物治疗,15%左右发生ERBB2或MET扩增或ALK等融合变异,剩余这部分仍未明确耐药机制,只能尝试其他手段。

问:基因融合现象在肿瘤病因及诊疗中非常重要,却是当前很多基因检测的痛点,您如何看待这一问题?

答:基因融合/重排、易位是肿瘤驱动变异中一类非常重要的形式。实体瘤中发生基因融合变异的比例约为16.5%-20%,针对ALK、ROS1、MET第14号外显子跳切、RET、FGFR2和NTRK1/2/3等融合靶点,FDA已经批准了多款相应的靶向药物。以非小细胞肺癌为例,FDA和或NMPA已经批准了克唑替尼、塞瑞替尼、阿来替尼、Brigatinib、Lorlatinib和恩沙替尼等药物治疗携带ALK融合的NSCLC患者,具有较高的反应率和持久应答,提高了患者的生存期并改善了生活质量。

多个研究表明基于RNA为模板的NGS(RNA-NGS)检测融合/重排、易位要显著优于DNA为模板的NGS(DNA-NGS)。例如:纽约纪念斯隆凯特琳癌症研究中心(MSKCC)的一项真实世界大队列研究中,经MSK-IMPACT 468基因的DNA大Panel检测为驱动基因变异阴性的232例患者,经RNA-NGS又额外检测到了36例常见可治疗的融合/重排变异,经匹配的靶向治疗后,临床获益率达80%。表明DNA-NGS融合的漏检率,即假阴性达14.2%。同时对于非经典融合及基型/相互融合,DNA-NGS检测到的非经典融合及基型/相互型融合中有12.8%在RNA-NGS/IHC检测结果为阴性,强烈支持DNA检测到的融合事件最终并没有产生融合转录本/融合蛋白,表明DNA-NGS检出的这部分非经典融合是假阳性。

问:您认为目前在临床上,NGS测序发挥了多大的作用?您怎么看NGS和传统检测技术的关系?

答:临床肿瘤学实践中,基因检测已成为精准诊治的前提和核心之一, NGS在开展精准诊治实践与试验研究中有着广阔前景,能更好的帮助临床医生在实际临床患者诊疗中,提升诊断水平,做出合理正确决策,提高患者生存质量。

突变检测有PCR,基因重排/融合有FISH,蛋白表达有IHC,每种技术都有自身的特点,但和NGS的综合性对比的话,传统的技术应用场景太专一,兼容性不足。NGS的强大的兼容性更适合对肿瘤发生发展复杂机制的探索,在明确需求和一些特定应用场景下使用传统技术进行进一步确认。病理诊断迎来了一个从形态学向功能学转化的过程。在这个过程中多技术、多维度的应用和结合是必不可少的,也是相互补充的。

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