声明:如果有什么疑难问题,下面内容解决不了你的问题,请直接留言第一种数据获取方式为了使扩增子和统计绘图等部分专题的数据可用,重复性好,这里我将数据上传到github上,并且直接使用 可能以后部分人打不开github或者打开缓慢,此时你可以多试几次,或者连接VPN,免费的就可以,或者使用学校网络,研究所网络等 下面直接通过网络位置的数据建一个完整的phyloseq对象,此时大家就不用找我要数据,想知道什么数据格式了,数据读取里面的https链接 直接用于下载查看数据格式即可 metadata = read.delim("https://raw./taowenmicro/R-_function/main/metadata.tsv",row.names = 1) 第二种数据获取方式其次这个示例的phyloseq对象我已经添加到ggClusterNet包中了,也可以下载安装我使用: devtools包如果没有,就可以使用install.packages安装 devtools::install_github("taowenmicro/ggClusterNet") 如果报错,一部分可能是因为网络问题,可以下载安装文件,然后使用下面方式: 下载下来的仓库文件解压后指定到这儿: install.packages("C:/Users/wentao/Desktop/ggClusterNet-master/", repos = NULL, type = "source") 第三种数据获取方式 |
|