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a公司是一小规模纳税人，主营信息技术服务。其办理增值税季度申报的时候，发现申报表中的“本期预缴税额”中有数据。如下图所示： 
若a公司就此申报，会导致本期需要退税。退税需要提供原缴纳记录与完税证明等相关资料，a公司又无法提供。那么，a公司本期增值税申报表中的“预缴税额”是如何产生的，a公司又该如何处理呢？
首先，a公司应该排除是否存在申请代开增值税专用发票预缴税款的行为。
正常情况下，单位在税务部门申请代开增值税专用发票，代开专票需要预缴增值税与附加税，从而会导致增值税申报表中“本期预缴税额”出现数据。若有代开增值税专用发票预缴税款的行为，则将代开的金额填至申报表第二栏“税务机关代开的增值税专用发票不含税销售额”中即可。
可通过下列方法排查是否有申请代开专票并预缴税款：
1.若是在电子税务局申请代开的，则可在电子税务局的“发票使用”功能中点击“发票代开”,选择“代开增值税专用发票”进入界面，输入日期查询。如下图所示： 
2.若是直接到办税大厅代开，则可在电子税务局的“我要查询”功能中，点击“申报征收查询”下的“已缴税款查询”，输入税款所属期进行查询。如下图所示：
其次，a公司排除是否存在其他预缴税款的行为。
若有其他预缴税款的行为，则也可在电子税务局中进项查询：在“我要查询”功能中，点击“申报征收查询”下的“预缴税款查询”，输入日期进行查询。如下图所示： 
但本案例中，a公司通过排查，发现本期并无因申请代开专票而预缴税款，也无其他预缴税款的行为。
a公司到税务部门进行确认，最终确认本次申报表中带出的“本期预缴税额”数据，是由于系统异常导致的。这种情况下，a公司可直接将申报表中的“本期预缴税额”栏次中的金额改为零，再点击“保存”，申报增值税即可。
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