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推荐：江舜尧 编译：jiee 编辑：小菌菌 德国马普海洋微生物学研究所的Pier Luigi Buttigieg团队和Pierre Offre团队于2020年1月27日在微生物生态学顶级期刊The ISME Journal发表题目为《Diversity and metabolism of Woeseiales bacteria,global members of marine sediment communities》的文章，该研究通过对Woeseiales细菌这一特定的微生物类群的系统发育、环境分布模式、数量和代谢潜力的研究，为特定微生物类群的系统性研究提供了参考，同时为海洋环境中蛋白物质的循环研究提供了新的思路。
文章摘要
海洋沉积物中16S rRNA基因序列的研究表明：Gammaproteobacteria纲中有一个类群分布广泛，被称为JTB255深海底类群(现在是candidateWoeseiales)，占所有获得序列的1-22%。尽管它们在海底群落中无处不在，但人们对它们在深海的分布以及构成全球最大生物群落的特定生态位知之甚少。在此，作者以深海Woeseiales细菌为代表，描述了它的系统发育、环境分布模式、数量和代谢潜力。通过对公开的16S rRNA基因序列的系统发育分析(长度大于1400bp，数量为994个)，作者确定了Woeseiales谱系在深海中比在沿海环境中更为普遍，同时这一模式得到了全球分布的28个沉积物样本中16S序列的证实。细胞计数显示：在23个全球分布的深海表层沉积物中，Woeseiales细菌占所有微生物细胞的5%左右。对基因组、宏基因组分箱和单细胞基因组的比较分析表明，相应支系的Woeseiales细菌可能可以利用蛋白质物质，而这些蛋白质可能来自于海洋沉积物中细胞膜、细胞壁和其他有机残留物的碎屑。文中重点图片说明： 
图1 | 本研究中采样点的地理位置。
图2 | Woeseiales的系统发育。
图3 | Woeseiales细菌的16SrRNA序列的系统发育与环境起源。
图4 | 海洋沉积物和水样中Woeseiales序列的分型。
图5 | 深海沉积物中Woeseiales细胞的丰度和形态。
图6 | Woeseia oceani XK5基因组中预测的分解代谢和能量守恒途径。
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