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推荐：江舜尧 编译：卓求 编辑：小菌菌 美国华盛顿大学医学院病理与免疫学系Emma S Winkler等人于2020年6月在Cell发表题目为《The Intestinal Microbiome Restricts AlphavirusInfection and Dissemination through a Bile Acid-Type I IFN Signaling Axis》的文章，该文章发现微生物组的扰动会抑制浆细胞样树突状细胞（pDCs）中的TLR7-MyD88反应从而使I型干扰素产生和单核细胞ISG表达减弱。补充闪烁梭菌（Clostridium scindens）或其相关的脱氧胆酸代谢物可恢复抗病毒反应以抑制奇昆古尼亚病毒（CHIKV）感染。 
文章摘要 背景与目的：奇昆古尼亚病毒是一种新兴的甲病毒，已感染了数百万的人，目前没有许可的疫苗或治疗剂，而且对影响人类宿主循环中病毒水平的获得性和遗传因素知之甚少。已有研究显示肠道微生物组可以调节I型干扰素的反应，但仍缺乏对与微生物组相关的免疫细胞和信号传导途径的系统理解，以及对影响抗病毒反应的特定微生物的鉴定。在这里，我们描述了哺乳动物肠道微生物组对甲病毒感染和传播的影响。方法：口服Abx处理或无菌小鼠的CHIKV感染导致远离接种部位的血液和组织中病毒负荷增加。CHIKV感染后，Abx处理的小鼠的RNA测序（RNA-seq）显示血液单核细胞中ISG的表达减少，这与血清中I型干扰素水平降低有关。微生物组敲除后CHIKV的向性差异取决于pDC中的TLR7和MyD88信号传导，它们在感染后数小时内调节了系统性I型IFN的产生。用转化胆汁酸（BA）的单一细菌物种闪烁梭菌（Clostridiumscindens）对Abx处理的小鼠进行定殖，导致pDC和MyD88依赖性的I型IFN反应得以控制CHIKV感染。对Abx处理的GF小鼠甚至未处理的小鼠进行次级胆汁酸的外源性给药，同样出现了用梭状芽孢杆菌定植观察到的MyD88和pDC依赖性保护的现象。结果：肠道微生物组的敲除增加了全身性CHIKV负担，Abx处理或无菌小鼠的循环单核细胞更适合CHIKV感染和传播。肠道微生物组的变化改变Ly6Chi单核细胞的抗病毒ISG反应，微生物组敲除后，细胞以内在方式削弱了pDC中的I型IFN诱导。CHIKV传播的微生物组依赖性限制取决于pDC中的MyD88信号传导，梭菌属细菌的定植可以限制CHIKV感染，微生物代谢的外源性次级胆汁酸促进全身性I型IFN反应并限制CHIKV感染。结论：共生肠道细菌在感染后数小时内通过胆汁酸-pDC-IFN信号轴调节感染后数小时内抗病毒免疫力和循环中的甲病毒水平，从而影响病毒血症，传播和潜在传播。文中重要图片说明 
图1 | 肠道微生物组的缺失增加了CHIKV负担
图2 | Abx处理或无菌小鼠的循环单核细胞更适合CHIKV
图3 | 在肠道微生物组缺失的情况下，Ly6Chi单核细胞中的ISG反应受到损害
图4 | 微生物组敲除后，pDC中的IFN-α反应受损
图5 | 通过微生物组限制CHIKV传播需要pDC中的MyD88信号传导
图6 | 梭菌属细菌定植限制了CHIKV感染
图7 | 次级胆汁酸促进I型IFN反应并限制CHIKV感染
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