线粒体DNA结构和组成

线粒体DNA的结构

线粒体的DNA（mitogenome）是独立于细胞核染色体之外的基因组，它具有独立的自我复制，转录和编码的功能。一般中的线粒体基因组较小，为10-39kb，酵母为8-80kb；都是环状；植物的线粒体基因组比动物的大许多，但也复杂的多，大小可以从200-2500kb。
以人的线粒体为例，有16,569bp组成，双链闭合的环状结构，其中外链DNA单链由于G多C少，使得整个外链的DNA分子量较大，陈伟重链（heavy chain）或者H链；内环的单链C含量高，G含量少，称为轻链（light chain）或者L链。
线粒体的基因组中没有内含子序列，编码的基因有重叠的现象。

线粒体DNA的组成

线粒体DNA有37个基因组成，其中包括两个rRNA基因（rrnL,rrnS)，13个编码蛋白质的基因，还有22个tRNA基因。
这里着重说一下CO1基因吧，也写做COX1，这个基因由于具有物种特异性，又相对的比较保守，一般被用作barcode，用于鉴定物种。

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线粒体中还有一个D loop区域，这个区域没有编码区，也是变异最大的区域，这个区域我查了很多资料，都没有特别的结构上的定义，不过好在可以将组装好的线粒体基因组上传到MITOS2网站 http://mitos.bioinf./index.py，它可以帮你分析这个D loop 区域的范围。

Reference:
https://wenku.baidu.com/view/08f89178eef9aef8941ea76e58fafab068dc441c.html
https://baike.baidu.com/item/%E7%BA%BF%E7%B2%92%E4%BD%93DNA/4101125?fr=aladdin