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夏校之旅 | SSP | 线上实验怎么做?

 sk134396 2021-04-28

背景信息

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学员介绍:

Y同学,普顿学员,高三学生,生化医学脑科学爱好者
项目介绍:

SSP(The Summer Science Program ),SSP为学生提供了沉浸式实验科学的环境,项目旨在挑战和激励来自世界各地的有才华的高年级学生。麻省理工学院(MIT)是这个项目的共同协办方,许多MIT的学生也是这个项目的校友。

项目于New Mexico Tech,Univ. of Colorado Boulder和Purdue University三个营地举行,每个营地分别录取36位学生。

New Mexico Tech和Univ. of Colorado Boulder营地进行天体物理学的研究,主要研究近地小行星成像和轨道测定;Purdue University营地进行生物化学方向的研究,主要研究真菌酶抑制剂和药物的发现。在教授和助教的带领下,3人为一小组,通过做实验来获得原始数据并进行分析研究。

2019年我去美国参加了一场比赛,由此错过了学校的期中考试,导致我没有了11年级上学期的成绩,只能凭借10年级的成绩去申请SSP,庆幸的是我还是被录取了

对SSP发过来的Handbook里的课程、活动和礼仪要求,我都很感兴趣。不幸的是,因为疫情,我不能去美国;万幸SSP转成了线上,仍然可以进行。

转成线上意味着我最期待的实验部分无法完成,没有机会认识舍友,也不能参加各种Party,很遗憾。

在线上进行却有另一种不同的体验,坐在家里开视频和其他人一起做研究一起玩,在很熟悉的环境里见到这些Participants,就感觉我平常的生活中好像突然多出来几十个人

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在SSP开始的第一天,看到IU和Purdue两个Campus的学生都登入Zoom,加上导师的一通演讲,我心情瞬间变得很激动——接下来的五周,我就要和他们一起来完成这个“很有挑战性的项目”。

我们有Learning Block,Social Block和TA block:

  • Learning Block 是教授讲述新知识点,讲解作业,完成课堂任务
  • Social Block 约等于线下的Lunch Time,大家在线上吃饭(美国时间),聊天,玩游戏,或者有嘉宾做演讲
  • TA Block 是完成三人小组的Research Project

每天SSP在线八小时,学新知识都是在课后,看教授录的Lecture,完成相应的Quiz。我们每天还有QOD(Question Of The Day),是一些超纲难题或者脑筋急转弯供大家娱乐。工作日每天要用11小时在SSP,周六没有Learning Block,周日休息。

  • 我和其他35位同学是IU Campus的学员,每三人组成一个研究小组

  • 我们有两位学术指导(一位是Caltech的有化博士,另一位是IU的生化博士),一位Site Director,四位TA

  • 考虑到时差问题,又有东组和西组之分,我被分入了东组。


线上进行SSP时:

Learning Block部分是大家一起上课,TA Block部分则是和组员一起做项目。

我的课程从晚上8点开始,到凌晨一点结束,第二天早上八点继续上课。

我们小组的另外两个组员都在美国,我和他们有着12小时时差,所以能在一起做项目的时间只有三个小时的TA Block。

Learning Block时,教授会先总结我们在课后Lecture里学到的知识点,答疑,再讲解接下来我们要做的课堂任务;剩余的大部分时间以随机分组的组员一起完成课堂任务,遇到问题就请教授或者TA加入我们的Room来讨论。

TA block时,我们是和Research Team一起完成Project,每天完成的部分都是在课上学过知识点和如何操作的:比如Learning Block中我们学用一个模板蛋白质构建Homology Model,在之后的TA Block我们就用自己组要研究的目标蛋白建模。

TA Block的时候研究小组会被放到Zoom的Breakout Room里,我们组内效率很高,也很默契,在完成当天的任务之前很少聊别的。所以,我们总是第一个完成任务,然后会回到Main Room玩一些线上游戏。和他们聊天我了解到不少美国文化,其中有一个伙伴还修过三年中文,所以有时候我也教他中文。

整个研究过程中,我接触到了很多很难却也很有意思的新东西,包括一些软件和理论知识。
我们无法进行实际实验,只能自己设计实验流程,每一步加多少试剂,用离心机离多长时间等等,并让TA帮忙按照所设计的步骤去实验室操作,再把结果传回来让我们分析。
让我感到惊奇的是Labster这个软件,它是一个虚拟实验室,可以模拟一些经典实验操作,非常逼真。虽然我们不能用这个软件来直接做我们研究所需的实验,但是体验感很强。
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还有一款很炫的分析蛋白质的软件MOE,它可以用来建模,分析性质等等。我曾在教材或相关研究报告上看到的那种蛋白质二级结构、表面结构的示意图都可以用MOE做出来。

图片我们的项目是“Design An Inhibitor For FoCdc14”,FoCdc14蛋白模型和可行的Inhibitor筛选及优化,都是通过MOE来完成的。MOE本身比较复杂,加上计算机每次模拟出来的结果存在差异,所以我们往往要经过很多次重复操作才能筛选出最好的结果。

我们小组设计的Inhibitor最后被导师评为了“Best Inhibitor”,尽管一直都比较自信,在宣布结果的那一刻我们都还是很激动。
五周以来,我们不停地Trial And Error,论文被导师标注了四十多处修改,大家都在各自时区熬夜爆肝,学到很多东西,也掉了很多头发,研究感和体感却都很强,结果也很成功。
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SSP也不全是学术,我们还有Social Hours和线上的“Tea Time Table”让大家一起吃午饭,当然,处于大半夜的我只能看着他们吃。

每天Social Block时,整个IU Campus的人都在一起玩游戏,聊天,有时候会有嘉宾来演讲。嘉宾大多数都是生化领域的顶尖博士,甚至还邀请到了2018年诺奖得主;也有天文物理、建筑工程等等领域的专家来演讲。
我没有预料到参加SSP可以这么大开眼界,除了这种令人憧憬的前沿研究分享之外,几大学校的招生官和往届已经读大学的SSP校友也给我们分享了申请大学的经验和心得,可以说是非常有实用价值。

除此之外我们还有一个才艺表演,现在已经没有纯学习的学霸了,每个人都身藏不露之技。我们设计了一件SSP 2020 IU Campus 专属T恤,它现在正从美国漂洋过海地寄过来。

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SSP结束那天,虽然举行的是视频晚会,但每个人都穿了正装,虽然我们是在各自电脑前完成的SSP 2020项目,但我们彼此间拥有深厚的感情。

SSP is like a community. 我们像科研工作者一样一起度过了五个星期,一起讨论项目,互相帮忙解决不懂的问题,虽然远隔千里却都是惺惺相惜,我们彼此都留了联系方式,现在还都在群上聊着各自的日常生活。当然,我们最希望能线下聚一次,了结只能云端相见的遗憾。

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