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Rarefaction Curves 稀释曲线

 新用户89820brR 2021-05-07

稀释曲线(Rarefaction curves)是从样品中随机抽取一定测序量的数据(序列条数),统计它们所对应的OTUs(operational taxonomic units,可操作分类单元)种类(代表物种),并以抽取的测序数据量与对应的代表OTUs来构建曲线。一般情况下,横坐标代表随机抽取的序列数量,纵标代表观测到的OTUs种类数量,样本曲线的延伸终点的横坐标位置为对应样本的测序数量,反映了Alpha多样性中的物种丰富度指数(Richness)信息。

稀释曲线可直接反映测序数据量的合理性,并间接反映样品中物种的丰富程度,当曲线趋向平坦时,说明测序数据量渐进合理,更多的数据量只会产生少量新OTUs(物种);反之表明不饱和,增加数据量可以发现更多OTUs。因此,通过作稀释性曲线,可以得出样品的取样深度情况。


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