前沿观点——迎接临床微生物检验的大变革

摘要

Abstract

近年来,临床微生物检验面临巨大变革，其要者为:1.病毒已成为检验的主要对象。2.基因检验已成为鉴定微生物的主要依据。3.多种病原体同时检出已成为检验的主要目的。4.相应地，检验科的组织和人才结构也发生改变，为迎接此变革提出3点希望。

Abstract

Recent years there were great changes of clinical microbiology examination,mainly: 1.Viruses have been the main targets of examination. 2. Microbic genes have been the determinative basis of of them. 3.The detection of multiple pathogens  simultaneously have been the main aims of that. 4.For that, the organization and fellows of laboratory should have been some changes. For the above changes 3 hopes were put out to colleages.

临床微生物检验是检验医学的重要组成部分，在确定病原体,决定治疗药物及判定疗效，流行病学调查,医院和社区感染的诊断治疗中起着重要作用。但长期以来，它却是检验医学中的薄弱环节。以细菌培养为代表的传统检验技术，依靠人工操作和经验，需时长，效率低，难以满足临床诊断治疗的需求。

近年来，科学技术突飞猛进。在检验全自动化、智能化、智慧化大潮推动下，给它带来惊人的变革。现择其要者分述如下：

一

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病毒已成为临床微生物检验的主要对象

长期以来细菌检验是此专业的主要工作,以致许多医院至今仍称它作“细菌检验室”。但自AIDS、SARS、Ebola病毒、禽流感，尤其是至今仍在全球大流行的新冠病毒（2019-nCoV）感染证明病毒已是威胁人类健康最主要的病原体，自然应成为我们主要的检验对象；而这正是我们过去工作的短板，现实要求我们必须尽快转变检验重点,从观念,技术和组织上尽快适应。^[1]

二

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基因检验已成为鉴定微生物的决定性依据

微生物基因鉴定决定其种属和特性。微生物表型鉴定如形态，生物特性，生化反应，抗原结构，药物敏感性等，均由基因型决定。多种形式的PCR—扩增特定微生物的独特基因及其鉴别技术已广泛应用，成为强大的精准检验的技术平台，在此次抗新冠疫情中用此类技术检出病毒,在防治中发挥了关键作用。

全基因组测序（WGS），宏基因组二代测序（mNGS）^[2]等技术快速兴起,已用于感染性疾病的诊断和鉴别诊断^[3]，并可揭示各种微生物菌群与疾病的关系。人体有菌部位（胃肠道，口腔，阴道，表皮等）多种形式的菌群改变，与许多疾病密切相关，从而突破了传统的致病与“非致病”微生物间的严格界限，使菌群分布检验异军突起。

基因决定微生物的分子构成。分析分子构成的强大武器—飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）技术正在迅速普及。鉴定软件经不断充实与更新，会使此技术的结果更加精准。

微生物飞行时间质谱鉴定

成簇规律间隔短回文序列(CRISPR)/CRISPR相关蛋白(Cas)系统,近年来成为高效的分子诊断工具,多种相关技术已在感染疾病的诊断中得到应用。^[4]

三

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多种病原体同时检出成为主要的检验目的

基因和多种先进技术结合(如免疫,纳米,传感器,微流控,层流等 )，使多种病原体的同时检出和鉴别成为可能，如症候群检验,已用于人体多部位标本的多种病原体'组合检验”。

传统微生物检验技术的明显缺点是'慢’——检测报告常需数日或月余完成。即时检验技术(POCT)的应用使快速检验的目标初步实现。微生物检验向精准，快速，高效发展指日可待。

血培养

四

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微生物检验科室组织和人才结构的改变

如上变革促使传统的微生物检验各专业室的设置可融为一体。医院间，区域间的中心检验机构加速形成。检验科人才结构会吸纳流行病学，人工智能，仪器设备等专业人才进入队伍。

微生物全自动检验流水线

做为一名老的临床微生物检验人，对此变革感到欢欣鼓舞，也愿继续努力学习，做好以下几点与同道们共勉：

一、清醒地认识上述先进技术我们还是只引进，模仿，应用. 必须奋力自主创新，努力赶上并超越进口技术及产品的水平。^[6]

二、保持和发扬传统技术的精华。微生物形态学和基本特征，仍然是鉴别微生物的初步依据，还要练好基本功。要科学、合理地选择和应用适宜技术，能用传统检验手段解决的检验不必动用昂贵的仪器和技术。

三、加强科研创新。结合我国感染病，流行病的特点，采用先进技术，多出检验研究成果，才能使具有中国特色的微生物检验成果走向世界。

参考文献

[1]王金良.新传染病的快速诊断要求发展微生物检验新技术.实用检验医师杂志.2019,1(1):2-5

[2] Han D,Li Z,Li R et al. mNGS in Clinical Miciobiology laboratory.Critical Reviews in miciobiology.2019,45(3):1-8

[3]刘婷,石华,刘芳等.宏基因组测序技术在新生儿感染性疾病病原体检测中的应用.中华检验医学杂志.2020,43(6):609-613

[4]赵爽,陈鸣.CRISPR/Cas系统在感染性疾病诊断中的应用.中华检验医学杂志,2021,44(2)83-88

[5] 张洪,袁睿,罗阳.纸基微流控在检验医学中的应用和挑战.中华检验医学杂志.2019,42(10):813-820

[6]王金良.创新临床微生物检验技术的思考. 实用检验医师杂志.2015,7(1):1-4

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