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马来西亚卫生总监诺希山6日宣布，截止到今天中午12时，今日全马新增新冠肺炎确诊病例691例，其中，本土确诊688例（包括吉打397例，沙巴219例，雪兰莪38例），累计确诊13504例；新增死亡病例4例，累计死亡病例141例；新增治愈87例，累计治愈10427例；现存病例2936例，有31人在重症加护病房。
因曾与前一天（5日）确诊新冠肺炎的首相署部长祖基菲里出席同场会议，诺希山从今天开始居家隔离。今天诺希山在家进行了网上直播记者会，他说，所有出席当天会议并被鉴定为曾与确诊者有密切接触的人士，将居家隔离14天，并佩戴隔离手环。截止到目前，大马已经有7名部长、副部长或议员确诊新冠肺炎。包括首相署部长祖基菲里、环境部副部长马斯里查等。
马来西亚首相慕尤丁在声明中表示，他即日起开始居家隔离。慕尤丁于周六（3日）主持国家安全委员会特别会议，首相府部长祖基菲里出席了会议，随后该部长新冠病毒检测结果呈阳性。慕尤丁称，根据卫生部的建议，他将在其住所进行14天的自我隔离。他表示，卫生部已对所有与会者和星期六会议的秘书处进行了新冠病毒检测筛查测试。马来西亚卫生部总监诺希山称，参加3日会议的部长没有出现任何新冠肺炎的症状，他们都已经根据治疗方案入院隔离、观察和治疗。他补充说，与确诊的部长在会上所有亲密接触者均已获得从接触之日起14天的居家隔离命令；与该部长没有密切联系的其他参与者必须每天在家中进行自我健康监测，持续14天。此外，有关部门正在进行接触者追踪，并对他们进行筛查检测。另外，大马国防部高级部长沙比里也宣布今日起开始居家隔离，并取消了原定于今天下午召开的记者会。他说，他已经进行了核酸检测，正在等待检测结果。取消记者会是因为它不想置媒体人士的健康于危险当中。
沙比里今日宣布，鉴于新冠肺炎疫情日趋严重，大马政府决定从12日起，对沙巴州实施出入境限制。从10月12日开始至25日，禁止从西马、砂劳越和纳闽入境沙巴，以及从沙巴到西马、砂拉越和纳闽。早前沙比里曾全部封锁日起从10月12日到20日，但随后国防部发公告纠正。公告指出，一些特定人士可以被豁免，包括处理紧急事故和必须服务领域人士，但需要获得卫生部的批准。
诺希山说，目前，大马的新冠肺炎疫情出现日益恶化趋势，他呼吁全民团结抗疫，一旦基本传染指数（RO）达到2.2，届时情况会变得非常严峻，估计大马在10月底后每日确诊病例将达到4500例。他今日在面子书上载了大马新冠肺炎基本传染指数推算估计表，他说，如果大马的RO达1.5，在10月31日后每日确诊人数或超过1500人。只有RO下降至0.3，大马确诊病例在本月末才能逐渐下降。
马来西亚教育部宣布，鉴于沙巴州3个地区将在7日落实有条件行动管制令（PKPB），教育部决定，今日起，关闭沙巴州亚庇、兵南邦和必打丹3地区的122所学校。教育部称，关闭的学校包括86所小学、25所中学和11所私立学校。教育部指出，根据该部在10月3日发出的声明，在有条件行管令地区以外的学校将照常上课。文告称，教育部意识到家长和学校职员对新冠肺炎疫情爆发情况感到担忧。在这种情况下，教育部会密切关注疫情的发展，并与国家安全理事会和卫生部密切合作，致力确保学生的健康与安全。”
根据大马卫生部推出的手机应用程式MySejahtera数据，在大马所有新冠肺炎确诊患者中，有89.3%曾去过巴生谷一带的商场，更有高达94.9%去过餐厅堂食。但经过调查和密切追踪，显示新冠病毒没有因此传播，“这表明了并非所有确诊者到访的区域，都会导致传播疾病。”此外，数据也显示，如果人们遵守并执行标准作业程序（SOP），可以抑制新冠病毒的传播。MySejahtera由大马政府推出，有助于管理新冠肺炎疫情，也成功协助卫生部追踪了322名确诊病患。
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