概述连锁不平衡(LD)和连锁分析已被广泛用于人类和家畜的数量性状位点(QTL)的定位。由于基因分型技术的发展,高密度的分子标记图谱可以应用于数种动物。 然后,即使基因分型成本大幅下降,大规模的全基因组关联研究仍然是昂贵的。模拟数据是一个非常有价值的工具,用于评估和验证新提出的方法以非常低的成本进行关联研究。在过去的几十年中,模拟在回答基因组学中的各种各样的问题方面起着重要的作用。目前已经开发了几种软件来模拟基因组,特别是在人类研究中。然而,大多数开发的软件工具不提供许多应用在畜牧业中所需的功能。 QMSim被开发来模拟家畜群体中的大规模基因组数据。QMSim是一个基于家系的模拟器,它也可以考虑到预先定义的进化特征,如LD、突变、瓶颈和扩展。模拟基本上分两步进行:第一步,模拟历史种群建立突变漂移平衡,第二步生成最近的种群结构,这是复杂的。QMSIM允许在模型中加入各种参数,以便产生合适的模拟数据。 特征
下载文件基于Windows和Linux的安装软件:http://animalbiosciences./~msargol/qmsim/ |
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