【原】Linux中root安装microsoft R open（MRO），普通用户如何使用？

年前，发现了Microsoft R Open更新到了4.0，就把服务器上的R版本更新了。

安装时，发现需要root权限，然后就sudo安装了。

安装之后，发现自己的R版本没有变化，RStudio server也没有变化，淡淡的忧伤。

RStudio Server重启，然后发现有线程无法正常结束，top -c也找不到任务项，使用服务器重启大法，搞定，然后就是更新R包（漫长的一下午……）

自己的R版本如何改变呢，上网一搜，差点误入歧途，要分解install.sh脚本，巴拉巴拉……

最终的解决方案是，把/opt/安装包的R建立了软链到我的目录下，就成功了。

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以下是折腾记录：

现在root下已经安装过了MRO（Microsoft R Open）4.0.2，但是普通用户怎么安装呢？

上网搜索了一下，发现可以在非root用户下安装，有两种途径：

1，conda安装

conda install -c r r-microsoftr


但是版本还是3.5，忧伤，不是最新版的

2，解析install.sh的代码，

代码来源：https://www.jianshu.com/p/5958fa98d42f

# 1.下载并解压官方安装包
wget https://mran.blob.core./install/mro/3.5.1/microsoft-r-open-3.5.1.tar.gz
tar -xf microsoft-r-open-3.5.1.tar.gz
cd microsoft-r-open/

# 2. 查看 install.sh 内容
less install.sh
# 分析发现脚本判断了当前操作系统然后依次安装(以 YUM 为例)
# ${SCRIPT_DIR}/rpm/microsoft-r-open-mro*.rpm
# ${SCRIPT_DIR}/rpm/microsoft-r-open-foreachiterators*.rpm
# ${SCRIPT_DIR}/rpm/microsoft-r-open-mkl*.rpm

# 3. 分别查看三个 rpm 包的安装脚本，重点看 postinstall scriptlet 部分的内容
rpm -qp --scripts rpm/microsoft-r-open-mro*.rpm
rpm -qp --scripts rpm/microsoft-r-open-foreachiterators*.rpm
rpm -qp --scripts rpm/microsoft-r-open-mkl*.rpm
# 分析发现 mro* 包是在往 /usr/bin/ 下面写链接文件
# foreachiterators* 没有做任何事情
# mkl* 备份了原有的 R/lib/*.so 文件，并拷贝了一套新的动态链接库文件覆盖到了安装路径中

# 4. 手工解压 rpm 包
rpm2cpio rpm/microsoft-r-open-mro*.rpm |cpio -idmv
rpm2cpio rpm/microsoft-r-open-foreachiterators*.rpm |cpio -idmv
rpm2cpio rpm/microsoft-r-open-mkl*.rpm |cpio -idmv

# 5. 手工执行 postinstall scriptlet
INSTALL_PREFIX="./opt/microsoft/ropen/3.5.1/" # 从前面解压的路径可以看出来
mkdir -p ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/backup/lib
mv ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/lib/*.so ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/backup/lib
cp ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/backup/lib/libR.so ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/lib
cp ${INSTALL_PREFIX}/stage/Linux/bin/x64/*.so ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/lib

# 6. 拷贝解压完的目录到指定安装位置
MRO_HOME="~/mro"
cp ${INSTALL_PREFIX} ${MRO_HOME}

# 7. 设置环境变量
# 注：R_HOME 会影响含 C++ 的 package 编译安装时寻找的头文件和链接库，详见 ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/etc/Makevars。
export R_HOME=${MRO_HOME}/lib64/R
export PATH=${MRO_HOME}/bin:${PATH}


上面应该可以成功，但是很复杂，我明明有root权限，为何不能直接用root下的R呢？

正确的方法

发现MRO安装的路径：

/opt/microsoft/ropen/4.0.2/lib64/R/bin


查看我自己的R路径：

$ which R
~/anaconda3/bin/R


把我的R路径，建立软链到MRO的路径下即可！

cd ~/bin/
ln -s /opt/microsoft/ropen/4.0.2/lib64/R/bin/R .


然后查看一下R的路径：

$ ll R
R -> /opt/microsoft/ropen/4.0.2/lib64/R/bin/R


搞定！

测试一下：

$ R

R version 4.0.2 (2020-06-22) -- "Taking Off Again"
Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)


Microsoft R Open 4.0.2
The enhanced R distribution from Microsoft
Microsoft packages Copyright (C) 2020 Microsoft Corporation

Using the Intel MKL for parallel mathematical computing (using 64 cores).

Default CRAN mirror snapshot taken on 2020-07-16.
See: https://mran.microsoft.com/.



测试一下radian：

$ r
R version 4.0.2 (2020-06-22) -- "Taking Off Again"
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

r$>


完美！