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第二篇：通过得分就能判断鉴定到种或鉴定到属吗？ 临床微生物行业的圣经级参考书CLSI M58，国内多篇MALDI-TOF质谱专家共识以及一些MALDI-TOF质谱厂家的技术文件，一致认为得分的高低可以判定鉴定到种水平或鉴定到属水平或无法鉴定，要了解是否是真的，需要先知晓微生物质谱建库的模式，目前市面上流行的微生物建库模式大概两类： 第一：按照种比对建库，不同来源的同一种菌（比如世界各地或全国各地不同实验室的100株ECO），进行质谱图采集（假设每一株菌采集20个峰图，该种菌共计50株），再把所有峰图（20*50=1000）叠加，后形成该种菌的标准谱图或质谱图权重表，示例图1，图中形状代表菌种，颜色代表不同来源的菌株，六角形这种菌数据库谱图是由10株不同来源六角形菌的谱图拟合叠加而成。数据库多少种菌就有多少个谱图。 数据库比对：一个未知峰图与数据库中每种菌的峰图进行比较，得出与该种属菌的匹配性（一般用百分数表示），见图2。 第二：按照株比对建库，一株菌采集不同多个峰图（假设每一株菌采集20个峰图），将这20个峰图叠加形成该株菌的峰图，示例图3，5株六角形菌谱图都在数据库里，只有1株四角形菌，数据有多少株菌，就有多少个谱图。比如某厂家质谱宣传数据库能鉴定4000种，10000株，即平均每种菌只有2.5个菌株，估计有3000种以上的菌只有1株菌。 数据库比对：一个未知峰图与数据库中每株菌的峰图进行比较，得出与该株菌的匹配性（一般用数字表示，不同质谱厂家表现形式各异），见图4。一般提示前十名或前二十名菌株信息。 综上所述，不论哪一种比对算法，从得分上都不能确定鉴定到属，得分仅能显示所测菌的峰图与建数据库时该种菌或该株菌的峰图匹配性。 第一种按种比对建库还能确定到种，第二种只能到株，如果到种还需要进一步运算。 第二种按株比对算法可能出现： （1）前十名都在规定的分数以上，但出现不同种属时，需要对结果进行复核测试。 （2）前十名都小于规定的分数，但出现同一种菌时，其结果也可能是对的，只不过该菌谱图与建库菌的谱图匹配性略低。
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