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突变远多于Delta,香港已检出;Omicron突变株,是“超级毒株”吗?

 文墨典 2021-11-27
新冠日报,只提供专业解读

关键词:COVID-19;新冠病毒;突变株

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(图源:WHO官网)

2021年11月26日世界卫生组织(WHO)正式将新冠病毒突变株B.1.1.529升级为令人担忧的突变株(Variant of Concern, VOC);系统命名定为Omicron

VOC是目前病毒监测系统中最高级别,也是最危险的突变株;上一个被纳入VOC的是给人类造成巨大危害的Delta突变株。

根据已有资料,B.1.1.529突变株有更多突变,很可能产生了比Delta突变株更强的传染性、毒性和免疫逃逸;从而成为人类新的噩梦。

该消息立即引起各大媒体巨大关注和欧美股市大幅下挫。

我们在后台也收到了很多B.1.1.529突变株的询问,所以特意请一直在美国从事病毒及新冠病毒研究的王宇歌博士做一系统解读。

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B.1.1.529突变株,顾名思义这个突变株来自于B.1.1谱系,和Alpha(B.1.1.7)属于同一谱系

B.1.1.529突变株最早于2021年11月11日在非洲南部的博兹瓦纳发现,3天后即在南非的Gauteng省迅速蔓延。在Gauteng从11月12-20日采样的77个患者样品中,经检测全部为B.1.1.529突变株。

特别需要警惕的是,中国香港已经检测到了B.1.1.529突变株,系由从南非旅行者带入,且传染了同期的另外一位隔离者。

除此之外,以色列、比利时等也都检出B.1.1.529突变株

1,B.1.1.529突变株

极可能有更强的传染性

Delta突变株最大的危害是传染性极强,基础传染值达5-9.5。

但金融时报首席数据记者发现,B.1.1.529比Delta突变株更容易传播(如下图所示)。

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(B.1.1.529的传染性超过Delta突变株!图源:ft.com)

B.1.1.529在南非Gauteng地区的传染性也证实了这一点。在进入到11月份之后的短短两周内,B.1.1.529突变株的检测阳性比例就由1%上涨到30%!

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B.1.1.529在南非的迅速蔓延。图源:nicd.ac.za)

南非的病例也开始呈指数增长,周二有868例,周三到了1275例,周四竟然达到了3500多例。

尽管这些病例尚未被鉴定为都是B.1.1.529突变株,但足够引起高度警惕。

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(南非的病例数突然出现暴涨)


B.1.1.529突变株的传染速度可能远高于之前的任何突变株,著名的疾病建模科学家Weiland估计B.1.1.529突变株的传染性比原始毒株高500%;相对比,Delta突变株的传染性可能比原始毒株高70%-200%。

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(图源:推特@JPWeiland


2,B.1.1.529突变株的

传染性为什么这么高?

B.1.1.529突变株突变株的Spike(S蛋白)有32个突变,是目前突变株中S蛋白突变最多的;相对比的是,Delta突变株在S蛋白上有9个突变。其与Delta和Alpha突变株有多处重合,因此该突变株可能有复制能力增强的特征。

它的Furin切割位点附近有H655Y + N679K + P681H突变,也可能增强病毒复制能力和感染力。

Jeffery Barrett博士列出了这些突变,其中红色意味着不好,B.1.1.529有9个,其中P681R尤其令人担忧。紫色意味着新的突变,且实验室数据显示有威胁。黄色意味着这些突变位置很重的,但科学家还不知道其生物学特征。蓝色表示需要更多证据来验证。绿色表示这些突变已被验证过,不需要担心。

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B.1.1.529的突变位点。图源:推特@jcbarret


上面这张图特别好,标记了每种突变的意义。

B.1.1.529突变株综合了几个VOC最关键的突变:
Alpha,Beta,GammaN501YAlphaP681
它还有最让人担心,也是我讲得最多的Beta免疫逃逸突变E484DeltaT478K

3,B.1.1.529突变株
毒力和免疫逃逸会更强吗?

从突变位点看,B.1.1.529突变株的RBD具有15个突变,是RBD突变最多的突变株,可能会影响抗体识别和疫苗接种

B.1.1.529具有nsp6-del105-107,可能会影响固有免疫及T细胞免疫。除此以外,它的N蛋白具有R203K/G204R,可能会提高病毒毒力

4,B.1.1.529是否会成为下一个超级毒株,

目前下结论为时尚早

我们的主要结论:B.1.1.529突变株确实非常非常值得警惕,不过B.1.1.529是否会成为下一个“超级毒株”,目前下结论为时尚早。

首先简要总结下B.1.1.529突变株有可能成为“超级毒株”的特点:

1. RBD具有15个突变,是RBD突变最多的突变株,会影响抗体识别和疫苗接种;

2. Furin切割位点附近有H655Y + N679K + P681H突变,可能增强病毒复制能力和感染力;

3. 具有nsp6-del105-107,可能会影响固有免疫及T细胞免疫;

4. N蛋白具有R203K/G204R,可能会提高病毒毒力。

而在南非也确实看到了B.1.1.529突变株正在攻城略地。

但对于突变株最重要的两个流行病学特征,传播能力免疫逃逸能力,目前还没有B.1.1.529的相关数据

更重要的是,B.1.1.529突变株如Delta一样,在NTD有大量突变;同时在RBD具有如此频繁的突变,有15个之多。从我经常讲的病毒适应性角度,RBD具有如此多的突变,会有很显著的免疫逃逸;但并不能保证病毒与宿主细胞能够结合得更有效,因此不能预测病毒传播能力更强,这需要结构生物学、病毒学和流行病学的数据来判断。
因此,这个病毒不知道会不会像Beta一样,仅引起局部传播,但无法成为全球主导突变株。

还有一个,B.1.1.529突变目前主要在南非蔓延,而与其他国家相比,南非具有特殊性。
1)南非之前疫情控制尚好,也就是说,B.1.1.529突变并未直接面对Delta突变株的竞争。
2)南非疫苗完全接种疫苗的比例只有24%,远低于全球42%的比例,属于防疫薄弱地区。所以B.1.1.529突变株在其他地区是否会如南非一样肆意蔓延还不好说。

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但是,南非出现B.1.1.529突变也再次给我们敲响警钟,整个非洲完全接种疫苗的比例仅7%。这意味着COVID-19一旦在非洲爆发,将以更迅猛的速度蔓延,且在这个过程中,很可能会产生新的“超级突变株”。

5,疫苗公司的应对

对于B.1.1.529突变株,主要的疫苗公司纷纷展示了自己的应对能力。

mRNA疫苗公司德国BioNTech表示,正在测试与辉瑞合作研发的COVID-19疫苗,将在两周内知道该疫苗是否对B.1.1.529突变株有效。并且,BioNTech和辉瑞能够在6周内完成新疫苗的设计,并在100天内完成第一批疫苗的生产

mRNA疫苗公司美国Moderna则在一份声明中说,该公司一直在推动针对更新突变株的加强针,目前已有两个候选多价加强针,包括针对B.1.1.529突变株突变株的mRNA-1273.529;并有能力在60天内把新的候选疫苗推进到临床试验阶段。

重组蛋白疫苗公司美国Novavax则宣布,已经开始研究B.1.1.529突变将在后面数周内完成疫苗测试和测试疫苗的生产。

DNA疫苗公司Inovio则说,将评估其现有疫苗对B.1.1.529突变株的有效性,2周会完成测试

小结,
1,B.1.1.529突变株确实具有“超级毒株”的潜质,需要特别重视;但目前不宜过度解读这一突变株的实际危害,更不必恐慌。
2,尽快加速全球薄弱地区的疫苗接种,才是预防再次出现“超级毒株”的关键。
3,对于我们个人来说,除了尽快完成疫苗接种及加强接种之外,减少疫区旅行、戴好口罩、注意洗手,仍然是关键而有效的防疫措施。

参考文献:

https://yourlocalepidemiologist./p/new-concerning-variant-b11529

https://www./articles/d41586-021-03552-w


本期编辑Henry,微信号healsan。
Hanson临床科研团队,由6位在美国的医生及医学科学家组成;目前在美国主要从事新药研发和临床科研。
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