GEO数据库：GEO2R的简单使用

利用GEO数据库的GEO2R工具分析一个GSE的study ID，操作如下：

• 登录GEO官网
  https://www.ncbi.nlm./geo/query/acc.cgi?
  

  

  登入GEO 官网.png

• 输入study ID号
  GSE24673 点击“Go”

  

  输入登录号.png

• 用GEO2R分析，翻到最底页，就会看到有蓝色图标“Analyze with GEO2R”点击运行。

  

  用GEO2R分析数据.png

• 分组，这里分两组，输入英文名字后，按enter键

  

  分组命名.png

• 分别命两个组的名字，自己命名如“tumor”，“normal”

  

  分为2个组.png

• 选中3个GSM序列放到tumor里，归为第一组。

  

  归组1.png

• 选中4个GSM序列放到normal里，归为第二组

  

  归组2.png

• 点击运行，翻到页底，点击“top 250”运行。

  

  运行比较.png

• 运行中，这过程有点慢，需要耐心等待...

  

  运行中.png

• 查看结果1，运行好之后会主动展现一些结果。

  

  查看运行结果1.png

• 查看结果2，根据自己想要查看的结果，可以输出（保存）已分析好的结果。

  

  查看运行结果2.png

• 也可根据自己的需求查看其它运行的代码，比如查看R脚本，而且可以复制。如果在操作上有不懂的，可以看GEO官网上的视频，视频里有整个过程的详细讲解，点击“YouTube”。