【焦亡】炙手可热的基金热点，涉及越来越多临床疾病；如何追这个热点？

zhzpig 2022-02-19

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国自然基金撰写正酣，群友发来信息，希望解读“焦亡”相关的研究大数据分析。

我们先看一下美国NIH在过去十年资助的焦亡及相关研究。

当以“Pyroptosis”为检索词进行资助的项目搜索时可以发现，美国2012年在此领域资助了9项研究，2021年资助了92项；十年增长10倍。

（🔺美国NIH于2012年在此领域资助了9项研究，2021年资助了92项。十年增长10倍。）

当以“Pyroptosis”为检索词在Medline数据库进行检索式，可以看到，焦亡研究论文17.4%发表在9分以上期刊，4.4%发表在24分以上期刊；并且最近几年的论文发表数量增速堪比火箭。

(焦亡研究发表的期刊分布及时间分布）

焦亡研究是目前研究的炙热点。

https://www.ncbi.nlm./pmc/articles/PMC2910423/

细胞焦亡(pyroptosis)是一种细胞程序性死亡方式,表现为细胞不断胀大直至细胞膜破裂,导致细胞内容物的释放进而激活强烈的炎症反应；相比于细胞凋亡(apoptosis)，细胞焦亡发生得更快,并会伴随大量促炎症因子的释放；是机体重要天然免疫反应,在抗感染和内源危险信号中发挥重要作用。

（细胞程序性死亡：焦亡（pyroptosis）、凋亡（apoptosis）、自噬（autophagy）、坏死性凋亡(necroptosis)。编者注）

从免疫治疗角度来说，癌症可按照抗肿瘤免疫应答状况分为三种：炎症型、免疫排除型和免疫沙漠型。

炎症型肿瘤-“热肿瘤”,免疫治疗的效果较好；免疫排除型、免疫沙漠型-“冷肿瘤”,免疫治疗效果不理想。基于此理论，“冷肿瘤”的治疗策略是先杀死一些癌细胞（如化疗、溶瘤病毒）后，癌细胞释放信号分子和抗原，将免疫细胞招募进肿瘤中。

距离发现凋亡现象的1986年已过去36年，目前，凋亡研究的方向除了广为人知的免疫反应相关的疾病（肿瘤、肾病、感染、肠炎、动脉粥样硬化等），焦亡研究还致力于阿尔茨海默症（NLRP3炎症小体识别β淀粉样蛋白学说，PMID: 18604209）的治疗，均获得了不同程度的进展；是解决多种“不治之症”的希望途径之一。

焦亡研究成为顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点。

为了解目前在焦亡领域的研究进展，我们对发表的论文做了全面解读，以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢焦亡研究，目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。

检索数据库：Medline
检索工具：文献鸟/PubMed
检索时间：February 17, 2022
检索及分析机构：Healsan Consulting LLC（美国恒祥咨询）; Stork（文献鸟）

一，焦亡研究论文大数据分析

焦亡论文发表的时间和国家分布

全球已经在焦亡领域发表了3,923篇Medline收录的文献；文献鸟则检索到3,916篇，对其中的3,911篇进行分析。
时间分布显示，可以看到针对焦亡的研究论文数量，2018年有318篇，2021年为1,307篇。
国家分布可以看到，中国发表的研究论文数量为2073篇，占24.3%，排在第一位。
美国发表的文章数占24.1%；
德国、日本和澳大利亚分列第三到五位。

（SCI论文的时间和国家分布）

学术机构排名

中南大学、复旦大学、南方医科大学、武汉大学人民医院、哈尔滨医科大学附属第一医院、浙江大学、四川大学、华中科技大学、山东大学、首都医科大学在大学为单位的论文发表排名中居前十名。
St. Jude Children's Research Hospital、武汉大学人民医院、哈尔滨医科大学第一附属医院、中南大学湘雅医院、波士顿儿童医院、南方医院、华西医院、同济医学院附属协和医院、中南大学湘雅三医院、中南大学湘雅二医院是发表论文最多的前十五所医院。

（全球发表论文的机构排名）

研究热点基因和相关疾病

如下图所示，显示NLRP3、GSDMD、AIM2、NLRC4、NLRP1等是焦亡研究中最受关注的位点。
败血症、压力、脑损伤、中风和结肠炎 等是焦亡研究中最关注的疾病。

（焦亡研究相关的基因和疾病）

焦亡研究
的关键词

括炎性小体、 NLRP3、激活、损伤和 信号通路 等。

哪些期刊喜欢焦亡研究？

可以看到发表焦亡相关研究最多的五个杂志是Front Immunol (IF=7.6)、 Cell Death Dis (IF=8.5)、 Int Immunopharmacol (IF=4.9)、 Front Pharmacol (IF=5.8)、 Oxid Med Cell Longev (IF=6.5)等。

（发表论文的杂志分布）

最有影响力学者及其关系网。

国际焦亡研究论文中
最有影响力的学者。

（学术大咖及其关系网。）

学者影响力是基于
学者在该领域的论文影响因子总分。

其中St. Jude Children's Research Hospital的Kanneganti, Thirumaladevi;北京生命科学研究所的Shao, Feng；Ghent University (比利时)的Lamkanfi, Mohamed；University of Lausanne（瑞士）的Broz, Petr；杜克大学的Miao, Edward A；哈佛大学的Wu, Hao；澳大利亚国立大学的Man, Si Ming；中科院上海巴斯德研究所的Liu, Xing；波士顿儿童医院的Kagan, Jonathan C等在焦亡研究领域最为活跃。

二，焦亡研究领域
的经典论文

除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外（数量+质量），单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。
所以我们通过大数据分析找到高引用论文，即领域内的经典论文。
从下图可以看出焦亡研究领域论文的爆发，及经典论文的分布。

高引用文章大多是该领域的经典文章，适合于在撰写立题依据或者综述时引用。

如果我们只看最近发表的重要论文时，可以看到2022年新发表的论文中，既有对疾病的长期跟踪临床研究，也有新药研发、基础医学技术、机制研究。

涉及的疾病有：感染（包括COVID-19)、炎性肠病(IBD)、神经退行性变、肝病、卵巢癌预后。

涉及到的研究重点、方法包括：链球菌致热外毒素 B、 GSDMA、 TNF-α与IFN-γ、 Ragulator-Rag-mTORC1途径、 Gasdermin D、宿主-微生物界面、细胞因子释放抑制剂 CRID3、白细胞介素-1、 USF2敲低、 AIM2炎性体、 NLRP3十聚体、 Dpp9抑制剂、 NLRP1的C末端、炎症小体、死亡途径的进化与其病原体的逃避等。

三，如何开启自己的
焦亡研究

了前面内容，您已经深信不疑的是：焦亡研究很值得做。尤其是研究生选题，可能这是一辈子课题的好起点。

问题是：如何开始呢？

最简单的方法：从模仿，到超越。

基础研究学者：

比如St. Jude Children's Research Hospital的Dr.Kanneganti, Thirumaladevi 。

临床科学家：

可以参考University Hospital Carl Gustav Carus at the Technische Universität Dresden（德国）的Tonnus, Wulf，发表的肾脏疾病系列的焦亡研究论文，机制结合临床研究，由浅入深。

如果要做转化，则可以参照Genentech Inc.（旧金山）的Dixit, Vishva M和Qu, Yan，致力于药物的基础研究开发到临床应用探索。

而最容易的切入点还是经典一套：A因子/蛋白通过B信号通路途径调控了（抑制/增强）焦亡从而抑制/增强了C疾病/细胞的D功能。

比如这篇文章标题的描述。

以及目前美国在研的部分焦亡领域基金。

小结：通过针对焦亡论文的大数据分析，我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1）焦亡研究，目前是医生科学家最好的切入时机。一方面，焦亡的机制已经比较清楚；另一方面，目前针对焦亡在不同疾病中的干预效果研究还远远不够。
2）针对焦亡研究，美国NIH资助的基金十年增长10倍。全球已经发表了3,923篇Medline论文，且论文数量快速增长；且有非常高的比例发表在高质量期刊上。
3）焦亡研究发文最多期刊是Front Immunol (IF=7.6)、 Cell Death Dis (IF=8.5)、 Int Immunopharmacol (IF=4.9)、 Front Pharmacol (IF=5.8)、 Oxid Med Cell Longev (IF=6.5)等。有17.4%的研究发表在影响因子大于9分的期刊,4.4%发表在24分以上期刊。
4）焦亡研究领域广泛，除了感染性疾病，在自身免疫病（炎性肠病、肾病)、神经退行性变、肝病、卵巢癌预后等领域都有研究。
5）针对焦亡研究最有影响力的论文，已经由机制探索、细胞和动物实验，转向临床转化和研发。