模块一:EWAS for single marker
在这个搜索模块中,EWASdb提供了五种不同的方法来搜索与疾病/表型相关的单个DNA甲基化标记的详细信息:1)疾病名称/表型;2)EWAS ID:可以输入从EWAS1到EWAS1319的任何条目;3)基因名称;4)
CpG位点编号:cg#;5)染色体区域位置:chr#。
操作示例:以胶质瘤为例,Search by disease/phenotype输入glioma,即可得到与胶质瘤相关的DNA甲基化标记列表,点击EWAS ID可得到每个EWAS的详细信息。
模块二:EWAS for KEGG Pathway
在这个搜索模块中,用户可使用单一条件搜索(KEGG ID、KEGG名称、EWAS ID)或多条件搜索(KEGG ID/KEGG名称+EWAS ID), 获取涉及该通路的EWASs详细信息。
操作示例:以半乳糖代谢为例,Search by KEGG_Name输入Galactose metabolism,即可获取涉及该通路的EWASs列表,点击EWAS ID可得到每个EWAS的详细信息。
模块三:EWAS for GO Category
在这个搜索模块中,用户可使用单一条件搜索(GO分类名称、GO分类ID、EWAS ID)或多条件搜索(GO分类名称/GO分类ID+EWAS ID), 获取与该GO分类相关的EWASs详细信息。
操作示例:以线粒体基因组维护为例,Search by GO_Term_Name输入Mitochondrial genome maintenance,即可得到与该GO分类相关的EWASs列表,点击EWAS ID可得到每个EWAS的详细信息。
EWASdb允许用户按照类别或按照字母浏览数据,其中类别子页面中包含7个大类302个子分类
用户还可以点击“EWAS软件”下载EWAS v2.0分析自己的数据。