发文章
发文工具
撰写
网文摘手
文档
视频
思维导图
随笔
相册
原创同步助手
其他工具
图片转文字
文件清理
AI助手
留言交流
近日,Dana-Farber癌症研究所、哈佛大学医学院、多伦多大学等多家单位的研究人员共同完成迄今为止最大规模人类蛋白互作图谱:HuRI,此项研究已在《Nature》发表。
HuRI是Dana-Farber癌症研究所癌症系统生物学中心(CCSB)蛋白组研究项目的第三阶段,包含大约53000个蛋白互作信息,是以往研究规模的4倍,是一个将基因组变异与表型结果联系起来的系统的蛋白组学参考图谱。
为什么要绘制蛋白互作图谱?
人类参考基因组序列使我们能够在机体、组织、细胞类型和单细胞水平上对基因和表达变异进行系统研究。尽管在基因组、转录组和蛋白组方面取得了进展,但我们仍然对介导表型和组织或细胞类型变异的细胞机制知之甚少。蛋白互作在一定程度上能够解答这个问题。
就像人类参考基因组一样,需要通过研究基因及其产物(主要是蛋白质)如何相互作用,系统而全面地生成人类蛋白互作参考图谱,为在一般/特定细胞环境中对整个蛋白组的生物学机制进行研究提供支撑。
HuRI能做什么?
HuRI与基因组、转录组、蛋白组数据的整合使得细胞功能可以在大多数生理或病理细胞环境中被研究。研究人员证明了HuRI可鉴定特定亚细胞中蛋白相互作用。由此推断的组织-特异功能网络揭示了细胞环境-特异功能形成的一般原理,阐明了孟德尔疾病组织-特异功能表型的潜在分子机制。
HuRI基因间的互补功能关系。在观察到HuRI直接富集蛋白互作网络(PPIs)的基础上,还通过相似互作界面预测蛋白是否共享互作分子。
HuRI蛋白质组的无偏倚覆盖揭示了疾病相关基因的未知互作网络。
在HuRI中,具有不同亚细胞区室的蛋白质是均匀分布的。通过整合HuRI和现有的蛋白质定位数据,可以推断出许多不同细胞区室的细胞定位特异性PPI网络。作为验证实验,研究人员鉴定蛋白质进入细胞外囊泡的潜在受体。
揭示组织特异的蛋白互作网络和组织特异性疾病的机制。
研究数据
HuRI, Lit-BM和所有之前已发表的来自CCSB的人类蛋白互作图谱数据均可在如下链接获取:
来自: 尐尐呅 > 《待分类》
0条评论
发表
请遵守用户 评论公约
Nature|绘制的世界上最大的蛋白质互作图为健康和疾病提供线索
如《自然》杂志上的一项研究所述,人类参考相互作用组(HuRI)映射了8,275种人类蛋白质之间的52,569种相互作用,是同类研究中最大的。人...
《自然》重磅:历时十年,超30亿次检测,迄今最大规模人类蛋白互作组诞生丨科学大发现
《自然》重磅:历时十年,超30亿次检测,迄今最大规模人类蛋白互作组诞生丨科学大发现。本次研究使用的是酵母双杂交法(Y2H),简单来说...
科研 | Science:人类血细胞中蛋白质编码基因的全基因组转录组学分析
细胞类型包括:初始B细胞和记忆B细胞、CD4和CD8的T细胞、自然杀伤(NK)细胞、三个单核细胞亚群、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒...
迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱问
迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱问迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱问世来源:中国科技网-科技日报 作者:冯卫东 2014年12月03日 00:51[导读] 据最新一期...
术语 外文
&&& 非蛋白质编码区("Junk"DNA)占据了人类基因组的大部分,研究表明"Junk"是许多对生命过程富有活力的不同类型的DNA的复合体,它们至少包括以下类型的DNA成份或由其...
世界未解之谜——人体蛋白质魅力何在
世界未解之谜——人体蛋白质魅力何在世界未解之谜——人体蛋白质魅力何在随着科学家成功地破译生命密码的人类基因组之后,一个以揭示蛋白质功能与结构为研究重点的后基因组时代也拉开了它的帷幕。蛋白...
Nature:2018年将改变生命科学发展的技术
以及耐病毒的人类细胞,用于生产药物和疫苗。单细胞 RNA 测序(Single-cell RNA sequencing)是识别不同细胞类型的有效方法,也是绘制 H...
蛋白质组学研究的主要步骤
(2)细胞图谱蛋白质组学(cellmapproteomocis):是对蛋白质组功能模式的研究,即确定蛋白质在亚细胞结构中的位置和鉴定蛋白质复合物组成等,便于研究蛋白质在细胞内的行为、运输及蛋白质相互作用网络关系...
Nat. Cancer | 细胞表面蛋白图谱与多组学数据整合发现有用的药物靶点
组织特异性index36分析一致表明,与非GESP相比,大部分GESP表现出癌症类型特异性。为了系统地识别癌症特异性GESP(CAGESP),研究使用了...
微信扫码,在手机上查看选中内容