LnCeCell的主要功能 LnCeCell的应用实例 Case1:MALAT1-KRAS的ceRNA相互作用已被证实在不同的癌症中发挥重要作用。以MALAT1-KRAS作为搜索输入,LnCeCell返回一个结果表,显示竞争的miRNA的数量,以及疾病、组织和该ceRNA可被发现的细胞数量/百分比。在每一行中,第一列和最后一列直接引导用户进入详细信息和分析工具。 点击表格最后一列分析工具即可进入分析工具页面,在此页面可访问MALAT1-KRAS在不同细胞群中分布的全局图;此外,还发现此ceRNA的可能细胞定位是核质,核糖体,核仁,核,染色质和外泌体;细胞网络部分提供了所有可能的MALAT1-KERAS相关的ceRNA相互作用全局图;还集成了Pan-cancer比较分析部分,为用户提供了跨不同癌细胞的ceRNA分布的全局图;关于置信度值和实验注释的详细信息,可以在“Annotations”模块访问;“Hallmarks”和”Functions”工具基于癌症分子途径和生物学过程对MALAT1进行了功能分析;CeRNA的“Survival”模块显示MALAT1-KRAS的ceRNA表达与急性髓细胞性白血病患者的生存率相关性,两组患者的Kaplan-Meier生存曲线显著不同(P <0.05)。 Case2:GAS5-PTEN已经在不同的癌症中的作用被实验证实,以GAS5-PTEN作为搜索输入,分别在高级别胶质瘤细胞、黑色素瘤和结直肠癌的数据集中验证了GAS5-PTEN的调控作用,与此前的研究结果一致。这些结果表明,GAS5-PTEN在不同肿瘤微环境中的分布导致不同的细胞状态,并可用于研究由ceRNA调节的微调驱动的不同细胞行为。 |
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