【原】文献管理软件系列 | 其他

JabRef、Papers、ReadCube

这篇文章有点敷衍了事

文献管理软件真不少，整理这么多款下来，发现这些个都大同小异，每一个都能满足大家的基本文献管理需求。你要问我选哪个，当然选免费的，除非你单位买了集团版的。

在后面我会试着分析文献管理软件应该做些什么才能体现出差异化，不像现在这么同质，目前这些个软件就是个工具而已，并没有多大的附加价值或增值点。

还有几个文献管理软件，JabRef、Papers、ReadCube，在这里大概介绍一下，不再一一试用和评测，因为大家实在太像了。

1、JabRef

JabRef 是一款基于 Java 的开源软件，可以非常方便的管理文献库。项目在 Github 上有了上千次的Fork和上万次的Commit。JafRef是开源软件，完全免费。但这不是它的主要优点。免费的东西很多，不见得每件免费的东西都有人要。实用性才是最重要的。

最优特性：极大地方便了使用Latex写作。

主页在这里，https://www./，下载和帮助都有，当然百度的话，也会有很多教程和使用经验。

一般文献管理软件，一是管理、整理自己电脑上保存的文献（主要是pdf格式文件），另外一个是写文章插入引用文献和编写参考文献列表。第二个很好搞定，第一个其实不容易，afRef有这么一个功能：全文文献自动关联。这个“自动”当然不可能自动到你什么都不用干。给文件改一个规则的名字，这是你需要做的。JafRef中有一个域名叫BibTexkey，每篇文献可以自动生成唯一的BibTexkey，生成规则可以根据个人喜好来定义，只要这个定好，把所有文件名改成BibTexkey加文件扩展名的形式，JabRef就能自动找到它。

直接来个实用的：介绍将文献录入JabRef中的两种方法。

直接导入文献BibTex源代码。第一种方法是我用的最多的，因为每一篇文献通过Google学术、百度学术都能查到其BibTex源代码，非常方便，不过百度学术有时候会有问题，建议使用Google学术（想办法翻墙或者代理搜索引擎）。

在JabRef中新建一个.bib文件

查找文献的BIbTex。这里用Google学术为例

复制粘贴BibTex代码到刚才新建的bib文件中引用文献的修改

通过以上3步然后保存一下基本上就可以了，但是有时候BibTex文件会有问题，需要手动修改一下。这就需要直接双击需要修改的那一行，就可以在下面修改了

手动建立引用。有时候我们的引用并不是文献，而是某个函数的参考文档或者是网址，这就需要自己手动建立引用。

新建BibTex。这里需要将Matlab的filtfilt函数的help文档作为引用，选用Misc。

写入内容。

    最后在Latex显示是这样的，更多的BibTex代码和操作可以去Latex开源小屋这个论坛看看。

测试的Latex编译器是WinEdt 7.0，用的是清华的Ctex套装，里面把所需要的软件都打包了，比较方便，下载地址是：http://www./CTeXDownload/

把刚才生成的.bib文件放在.tex文件同一目录下；下面介绍一下引用文献的代码语句：

\cite{这里面填引用文献的Bibtexkey}

% 一般打完括号编译器就会弹出所有参考文献的key值

\nocite{Bibtexkey}
% 文中未出现引用标记，但依然需要在参考文献中打印该文献时使用
\bibliographystyle{plain}
% 设置文献参考样式，LaTex中参考文献标准样式有八种，具体信息参见下面
\bibliography{这里填BibTex的文件名}
% 选择调用的BibTex文件，bibfile为文件名；该语句放在文中的哪个位置，pdf中参考文献部分也将出现在相应位置

plain：按字母的顺序排列，比较次序为作者、年度和标题；unsrt：样式同plain，只是按照引用的先后排序；alpha：用作者名首字母+年份后两位作标号，以字母顺序排序；abbrv：类似plain，将月份全拼改为缩写，更显紧凑；ieeetr：国际电气电子工程师协会期刊样式；acm：美国计算机学会期刊样式；siam：美国工业和应用数学学会期刊样式；palike:美国心理学学会期刊样式

编译。编译有两种，WinEdt直接编译就可以：

其他的可能需要先编译bib文件，然后再编译tex文件。

这里有个比较好的帮助：

https://www.cnblogs.com/tsingke/p/4523908.html

2、Papers

Papers 是一款专业的文献管理工具，这个软件最大的好处就是简单易用。初次使用时可以选择导入硬盘上所有的PDF文献，或者选择新建图书馆，以后再手动挑选希望导入的PDF文献。Papers导入PDF文献时有两种选择：一是将现有PDF文献移动到PDF图书馆中去并按Papers的规则改名，二是保持PDF现在的位置，Papers只负责管理文献列表的数据库。如果没有别的特别原因，建议使用第一个选择，这样，以后的PDF文献就不用用户操心存在哪里、文件名是什么了。同时这个软件还能够很好的与endnote进行关联，从而提高文献阅读与管理的效率。

Papers功能主要是文献收集，整理，阅读和引用。

文献收集，Papers提供两种导入文献的方法：在线搜索和本地导入。

在线搜索：

可以通过搜索题目，作者，摘要等内容中的关键词来查找文献，也提供各种联结词（AND，OR）来辅助搜索。搜索出的文献可以直接导入到个人Library，同时也会保存在本地。

本地导入，整理。导入文献后，Library界面会出现文献项，可以将文献加入自己的收藏集中分类或归档，界面右边是关于这篇文献的相关信息。综述：可以在这个界面添加关于文献的关键词，评论和各种标签。

信息：包括作者等各种出版时的信息，这些信息会在导入文献时自动添加。

笔记：阅读时添加的笔记

搜索本地的时候可以根据作者，来源和添加的各类标签查找。

智能收藏集。智能收藏集能根据文献的各种信息创建一个收藏集的规则，自动添加文献。

阅读。

可以添加各种笔记：添加笔记：点击可以向文章选定位置添加笔记，若无选定位置，将在文章当前页添加笔记；高亮模式 ：点击之后，该按钮将处在激活状态（变蓝），然后再用鼠标或键盘选中内容时，选中的内容将被高亮显示；下划线模式：与高亮模式类似，选中的内容将被添加下划线。删除线模式：与高亮模式类似，选中的内容将被添加删除线。

3、ReadCube

ReadCube来自一个软件开发创新团队Labtiva，Readcube与多个科研机构合作，包括大名鼎鼎的nature.com。而作为Labtiva推出的第一款软件，readcube可谓被寄予厚望。软件本身很小，完全基于adobe air开发制作的，所以在安装ReadCube之前会自动安装adobe air。也正因如此，它的打开速度和反应速度都很不错，界面也非常美观。尽管目前该软件只发布了基于windows和 Mac OX S两种操作系统下的public beta版本，但从google+和twitter上大家测试后的反响来看，都是赞不绝口。

这个基于Adobe AIR开发的应用程序集成Google Scholar和PubMed搜索引擎，让您可以在应用程序内直接搜索。该程序特别适合那些拥有海量数据库访问和下载权限的在校学生和科研人员。然而，这也并不是绝对要求，任何人可以使用任何电子邮件地址注册并使用它。ReadCube也可以让您在已打开的不同文件间自由切换，从本地磁盘导入现有PDF文件，创建分类列表，添加注释，搜索和快速下载PDF文件。注册非常简单：使用任意你喜欢的邮件账号注册，填写确认邮件中验证码后就可以批量导入本地的 PDF 文件了。（译者添加：其实我们不难发现，ReadCube 更像某款 Mac 系统下的Google 阅读器。）左侧的列表面板显示了你已建数据库中的各个文件夹和文件，同时最近阅读和收藏分类也出现在这个列表中，并且由于 Google Scholar 和 PubMed 的整合，可以让使用者很方便的在操作界面内快速搜索。

这段文字复制来的，说实话，看到内嵌或推荐谷歌学术的，一般就懒得写了，上不去么，没办法体验。

真的想用用看的话，就去https://www./home下载。