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癌症基因详解

 青山代码yyf 2022-08-25 发布于广西

1、BRAF 基因及突变概述

BRAF基因是位于第7号染色体的长臂上(7q34)的原癌基因,BRAF蛋白是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,为RAF激酶家族中的一员。

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图1:BRAF V600E的蛋白晶体结构及靶向药物结合位点

BRAF基因突变发生在大量癌症组织中,比如,约100%的毛细胞白血病、50%的黑色素瘤、20%~40%甲状腺癌,10%~15%的结直肠腺癌,10%的脑胶质瘤,4%的非小细胞肺癌,小概率发生在其它类型白血病和卵巢癌中。 

BRAF基因突变通常发生在蛋白激酶激活区域,主要包括点突变、小片段缺失、扩增、基因融合等,最常发生的突变类型就是BRAF V600E,BRAF V600是位于15号外显子第600位密码子的缬氨酸被替代,该突变使其蛋白活性上调至500倍。带有BRAF V600E突变的结直肠癌患者可能同时会存在高肿瘤突变负荷、高微卫星不稳定性(~30%-50%)、高CpG岛甲基化表型(~70%),甲基化介导的基因表达表观调控改变。

2、BRAF介导的信号通路

RAF激酶家族(ARAF、BRAF和CRAF)是RAS-RAF-MEK-ERK信号级联(MAPK信号)的核心组成部分,可传导细胞增殖、分化等信号并参与完成成熟细胞功能。当生长因子与细胞表面的受体(EGFR)结合后,受体的酪氨酸激酶结构域被激活并通过RAS激酶发出信号。RAF蛋白是活化的RAS蛋白的直接效应子,RAF分子的二聚化通过磷酸化和激活MEK进一步传递该信号级联,磷酸化的MEK激活ERK,活化后的ERK从胞质进入细胞核,磷酸化和活化核内的效应分子,最终启动与细胞增殖有关的靶基因转录,促进细胞增殖、分化、迁移、存活和促血管生成。 

BRAF基因对于正常细胞的生长至关重要,但不受抑制的BRAF信号传导会促进肿瘤的发生发展。 当BRAF基因突变,KRAS/AKT通路过度激活,细胞循环紊乱,检查点相关通路异常,肿瘤细胞过度增殖,同时参与调控影响上皮间充质转换,影响机体免疫反应。因此,BRAF基因突变也预示着不良预后。

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图2:RAS/BRAF/MEK/ERK 和PI3K/AKT/mTOR 信号通路及其抑制剂

3、BRAF基因的突变特点、治疗方法及耐药机制

BRAF V600E突变型结直肠癌多见于右半结肠(81%),多发于女性(65%),几乎不与KRAS突变同时发生。CSCO指南推荐结直肠癌患者行靶向治疗前,应检测BRAF V600E突变和RAS突变状态。BRAF V600E突变和RAS突变几乎不同时发生。 Mayo clinic的一项多中心回顾性队列研究显示,结直肠癌患者中,发生BRAF non-V600E突变的频率为2.2%(208/9643),占所有BRAF突变患者的21%(208/965)。BRAF non-V600E突变多发于左半结肠(63%),常见于男性(54%),多为MSS(94%),且与KRAS突变可以同时存在(26%)。

对比BRAF V600E突变及BRAF野生型的晚期结直肠癌患者,携带BRAF non-V600E突变患者的中位生存期(OS)显著延长(11.4个月 vs. 43.0个月 vs. 60.7个月,P <0.001),多因素分析结果显示BRAF non-V600E突变是结直肠癌预后更好的独立预测因子。 

BRAF V600E突变可以作为信号通路的单体,引起MAPK通路自发持续异常激活,且不依赖RAS活性,导致结直肠癌的发生发展以及对EGFR单抗如西妥昔单抗、帕尼单抗的耐药,对BRAF抑制剂和信号通路下游MEK抑制剂敏感。 BRAF V600E基因突变的激酶活性最高,对BRAF单体抑制剂(维莫非尼,达拉非尼和康奈非尼)、MEK抑制剂(考比替尼,比美替尼和曲美替尼)及二者联合方案均敏感。 

在单独使用RAF或MEK抑制剂的患者中,约50%会在治疗后的6~7个月内产生耐药。目前的研究表明,耐药患者中有60~70%的患者存在MAPK通路的再激活,这涉及到多种机制,可能和NRAS突变、BRAF扩增和MEK1/2突变等相关。 另外,有研究表明,BRAF V600E突变耐药也可能是相关自噬信号通路被激活。自噬是一个保守的细胞循环过程,在BRAF V600E突变的黑色素瘤中发现,在经过BRAF V600E抑制剂治疗的肿瘤中,自噬明显增加。自噬可以促进肿瘤的发生进展,并保护癌细胞免受化疗的细胞毒性作用。

为此,与敏感细胞系相比,BRAF抑制剂(BRAFi)耐药细胞往往表现出增加的自噬。BRAF抑制剂诱导的自噬有多种机制,如激活内质网(ER)应激蛋白gatekeeper GRP78、腺苷酸活化蛋白激酶,ERK1/2或mTOR被抑制,这会导致自噬相关的转录调控因子TFEB和TFE3表达上调,引起自噬。

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图3:BRAF V600E抑制剂诱导自噬的相关信号通路

除了直接靶向RAF的抑制剂外,发生BRAF突变的患者也对MEK抑制剂敏感。MEK蛋白是细胞外信号相关激酶(ERK)途径的上游调节剂,抑制MEK1和MEK2可以抑制MAPK途径的下游信号传导。目前有三种靶向MEK的别构抑制剂——考比替尼(Cobimetinib)、曲美替尼(Trametinib)和比美替尼(Binimetinib)获批用于治疗BRAF V600突变的黑色素瘤。 临床前研究和临床证据均表明,在BRAF V600E突变的肿瘤细胞中,RAF抑制剂联用MEK抑制剂可增加肿瘤细胞凋亡水平,表现出更有效及持久的治疗响应,可以有效提高患者的无进展生存期(PFS)。

多项全球关键性临床研究结果显示,对比达拉非尼单药治疗,达拉非尼联合曲美替尼双靶向治疗方案可帮助BRAF V600E突变黑色素瘤患者实现更高的疾病缓解,达到更长的无进展生存。2020版CSCO诊疗指南也将双靶联合治疗列入BRAF V600E阳性的黑色素瘤、结直肠癌及肺癌的推荐用药。

参考文献:

Mauri G, Bonazzina E, Amatu A, et al. The Evolutionary Landscape of Treatment for BRAFV600E Mutant Metastatic Colorectal Cancer. Cancers (Basel). 2021;13(1):137. Published 2021 Jan 4.

Foth M, McMahon M. Autophagy Inhibition in BRAF-Driven Cancers. Cancers (Basel). 2021;13(14):3498. Published 2021 Jul 13.

Grothey A, Fakih M, Tabernero J. Management of BRAF-mutant metastatic colorectal cancer: a review of treatment options and evidence-based guidelines. Ann Oncol. 2021 Aug;32(8):959-967. doi: 10.1016/j.annonc.2021.03.206. Epub 2021 Apr 7.

Haling JR, Sudhamsu J, et al. Structure of the BRAF-MEK complex reveals a kinase activity independent role for BRAF in MAPK signaling. Cancer Cell. 2014 Sep 8;26(3):402-41

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