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国自然热点:糖酵解、乳酸代谢、组蛋白乳酸化修饰

 外科黄文斌 2022-09-27 发布于广东
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前言:

乳酸(lactate)是细胞无氧呼吸的代谢产物,早期被认为是细胞的代谢废物,但随着研究深入,乳酸被发现具有多种重要的生理病理功能。乳酸是一种方便快捷的碳水化合物燃料,可为哺乳细胞供能;还是糖异生循环的主要前体;亦可作为信号分子,调控细胞信号通路。

2019年10月24日,芝加哥大学赵英明教授课题组在Nature上发表研究成果“Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation”,该研究揭示了乳酸在表观遗传学途径中的作用,首次报道乳酸可以修饰组蛋白,调控基因的转录表达,拓展了大家对乳酸的认识之外,也掀起了乳酸化修饰热潮。

近年来,乳酸化修饰的高质量文章不断涌现,而且近几年国家自然科学基金的资助项目中,乳酸化修饰的项目也在不断增多,已成为当前生命科学/基础医学研究的一大热点。

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2021年乳酸化修饰相关资助的部分项目

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研究背景:

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肝癌是世界范围内最常见的肿瘤之一,也是肿瘤致死的主要原因之一。肝癌干细胞(LCSCs)被认为直接参与调控肝癌的进展、复发、转移和耐药,是肝癌的重要生物标记物。去甲泽拉木醛 (demethylzeylasteral, DML)是一种三萜类化合物,提取自传统药材雷公藤。研究报道,DML及其衍生物可以抑制黑色素瘤、乳腺癌和胶质瘤等多种肿瘤细胞的增殖,并且可以促进胰腺癌和结直肠癌细胞对化疗药物的敏感性。但是关于DML对LCSCs的作用及机制却未见报道。

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研究成果:

2022年5月21日,重庆大学杨力教授、王春莉副研究员团队与湖北中医药大学许康副教授

Pharmacological Research (IF=10.334上发表了题为Demethylzeylasteral targets lactate by inhibiting histone lactylation to suppress the tumorigenicity of liver cancer stem cells 的最新研究成果,该研究发现DML通过下调组蛋白乳酸化水平,抑制LCSCs增殖和自我更新,诱导细胞发生凋亡和周期阻滞。为肝癌的临床诊疗提供更多理论依据。

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原文链接:https:///10.1016/j.phrs.2022.106270

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研究内容:

首先,作者使用DMEM/F12培养基培养肝癌细胞系HCCLM3 和Hep3B,获得了具有肝癌干细胞特征的sphere-forming cells (SFCs)细胞,这群细胞具有自我更新和增殖能力,同时表达肿瘤干细胞标记物CD133、CD90、CD44 和OCT3/4,因此作者获得了可以用于研究肝癌干细胞的工具细胞SFCs。作者发现,小分子药物去甲泽拉木醛(demethylzeylasteral, DML)以浓度和时间梯度依赖的方式抑制SFCs细胞的增殖和迁移,诱导细胞发生凋亡和周期阻滞

其次,作者使用RNA-seq探究DML的作用机制。数据显示,DML造成2361个基因表达上调,1729个基因表达下调。KEGG分析显示,多种表达差异的基因富集在细胞代谢通路中。GC-MS实验发现糖酵解/糖异生通路的代谢产物含量变化明显,其中代谢物乳酸含量显著降低

再次,乳酸是细胞中含量较高的代谢物,且具有多种重要的生理病理功能。2021年芝加哥大学赵英明教授报道代谢物乳酸可以修饰组蛋白,调控炎症相关基因的表达。因此,作者使用乳酸化修饰抗体对细胞中蛋白质乳酸化水平进行检测,结果显示:DML处理后,H3K9和H3K56的乳酸化修饰水平显著降低(见下图)。使用乳酸直接处理细胞,可以提高组蛋白的乳酸化修饰水平,促进细胞增殖和克隆形成,上调细胞周期相关蛋白的表达。

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DML下调细胞中的乳酸含量,降低组蛋白乳酸化修饰(H3K9la, H3k56la)水平

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最后,作者使用DML处理小鼠,结果显示DML可以在动物体内抑制肝癌细胞SFCs的增殖,且可以下调肿瘤细胞中乳酸含量和组蛋白的乳酸化修饰。

该研究建立了具有肝癌干细胞特征的细胞群SFCs,为肝癌干细胞研究提供了新的研究工具;并发现抑制SFCs的小分子DML;机制研究显示,DML通过影响细胞代谢,下调乳酸含量,抑制组蛋白的乳酸化修饰,从而调控下游基因改变;进一步作者发现,DML可以在动物体内抑制SFCs细胞增殖,下调乳酸含量。因此,乳酸及乳酸代谢相关通路可能成为肝癌潜在的治疗靶点,也为肝癌的研究提供了更多理论依据。

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DML通过抑制组蛋白乳酸化修饰抑制肝癌细胞增殖、自我更新、侵袭迁移

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研究亮点:

1.  制备了具有肝癌干细胞特征的细胞群体 SFCs;

2.  找到抑制SFCs的小分子DML;

3.  DML通过抑制组蛋白乳酸化发挥作用;

4.  DML在动物体内可以抑制SFCs增殖;

5.  揭示了乳酸及其相关代谢通路具有成为肝癌诊疗 靶点的潜力。

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2021年度国自然医学部国自32大科研热点的中标数统计如下:

2022热点

2021年医学部总中标数

2022热点

2021年医学部总中标数

免疫调控

852

细胞焦亡

118

血管生成、重构

531

代谢重编程

118

线粒体

485

单细胞测序

105

外泌体

430

DNA甲基化

97

miRNA

413

组蛋白修饰

80

干细胞

371

内质网

76

lncRNA

371

炎性小体

76

细胞自噬

358

中性粒细胞诱捕网

67

肠道菌群

312

糖酵解

55

circRNA

287

氧化应激

46

m6A、m5C、m7G

270

类器官

46

铁死亡

257

超级增强子

25

转录调控

232

精氨酸甲基化

25

缺氧、低氧

211

相分离

21

泛素化

186

乳酸化修饰

21

乙酰化

135

迁移体

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