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飞哥的GWAS分析教程更新啦

 育种数据分析 2022-10-30 发布于河南

大家好,我是邓飞。

这几天疫情一直封锁在家,周六日就想着把我的GWAS教程更新一下,没想到工作量这么大,不过终于完成了。

今年(2022年)1月我更新了GWAS学习笔记V3版,大半年来不断有老师告诉我,这本书帮助很多,我十分开心,因为这本来是自己学习的笔记,很多都是从初学者的角度考虑的。也有老师反馈里面有一些错误,需要更新,所以就有了这个版本的教程。

上一版我是用word编辑的,因为我写博客一直用markdwon,这次用Typora进行排版,应该更好看一些。

本次更新的内容:

  • 更改了之前错误的内容

  • 章节结构变了一下,结构性更好

  • 增加了GEMMA的操作

  • 增加了显著性SNP变异解释百分比(PVE)的内容

  • 增加了CMplot可视化,包括SNP密度图,多性状曼哈顿图,圆形曼哈顿图

  • 增加了多基因风险模型(PRS),软件PRSice的操作,PRS的计算和可视化

看一下更新后的界面:

一级标题,二级标题……层次分明,pdf支持目录阅读

代码块更好看,代码支持复制粘贴,

最新的教程一共232页,目录如下:

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