重磅 | 人人可及，时空组学技术Stereo

来源：华大时空 2022-11-04 10:47

未来，时空组学将朝着智慧实验室、多样本多组学、便捷与开放的平台方向，打造全方位的时空生态系统，降低科学发现的门槛，赋能更多领域的科学研究。

Stereo-seq新品一览

• 载体版时空芯片：提升操作便捷性

• 时空一体机：时空智能一站式平台，通量可达24张芯片/天

• Stereo-seq 空间单细胞分析：实现图像质控、拼接、配准、细胞分割全自动化

• Stereo-seq TCR/BCR富集：适用于肿瘤微环境、器官移植、免疫治疗等领域

• Stereo-seq H&E+转录组：实现同张切片获得组织形态学和转录组学信息

• Stereo-seq mIF+转录组：通过荧光抗体染色，实现同张切片的蛋白和转录组共检测

• Stereo-seq 空间多蛋白：在同张切片上实现全转录组和多达十余种蛋白标记物同时检测

即日起，所有科研工作者可通过扫描下方二维码，提交信息申请免费体验。

# 华大时空正式推出新品体验计划#

“工欲善其事，必先利其器” ，华大作为时空组学领域的重要推动者，一直致力于为生命科学领域提供通用且功能强大的工具，助力更多的科学新发现。10月29日，在ICG-17时空组学与疾病的会场上，深圳华大生命科学研究院时空工具主任科学家廖莎，正式推出载体版时空芯片、时空一体机、空间单细胞分析、空间TCR/BCR富集、H&E+转录组、mIF+转录组、空间多蛋白等新品体验计划。

# Stereo-seq技术最新进展和体验计划 #

华大自主研发的Stereo-seq实现了500 nm的分辨率（单个细胞可被400个像素点捕获），同时捕获面积可达13 cm×13 cm，成为全球领先的能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术，且实现了基因与影像同时分析。该技术作为新时代的分子 “显微镜”，将推动继显微镜和DNA测序技术以来的生命科学领域第三次科技革命。

Stereo-seq已经应用于发育、疾病、再生等领域，因领先的技术优势，不到半年的时间，相关科研成果已陆续在Cell、Nature和Science三大顶级学术期刊发表，实现CNS大满贯，其中有两篇刊登为当期封面。这个核心工具的突破，让研究者得以用全新的视角观察生命，成为高水平文章发表的基石。

本次大会上，廖莎从通用性和引领性两方面重磅发布了Stereo-seq的技术突破和新品体验计划。

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通用性

在通用性方面，华大时空从样本和操作性出发，提升Stereo-seq技术的可及性。

样本可及性

在样本可及性上，Stereo-seq实现了将在液氮或-80℃环境中保存的组织进行组织切片，解决特定场景下样本得不到及时包埋的困扰。时空组学的技术特点是原位捕获，而有冰晶的样本往往阻碍研究人员获取组织内细胞的原位信息，对此，Stereo-seq更新了包埋方案，缓解了样本的冰晶问题。

另外，某些含水量较高或空腔较多的组织，容易出现脱片或RNA扩散问题。针对这类组织，Stereo-seq优化并兼容了多聚甲醛样本处理方案，可以有效解决RNA的扩散，保证组织原位信息的获取。

实验便捷性

研发人员开发了载体版时空芯片方案，降低了操作复杂性，提高流程的流畅性，使Stereo-seq技术操作更简单，同时减少样本操作间的差异。

操作智能化

本次发布会上重磅亮相的时空一体机，可提供从样本到数据的全自动化智能解决方案。在组织拍照后，可实现芯片cDNA文库的全自动化，且最高通量可达24张切片/天，大大缩短手工操作时间，减少人为操作导致的批次效应，逐步实现Stereo-seq技术的标准化。

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引领性

空间单细胞分析

在空间单细胞方面，Stereo-seq通过芯片试剂全面更新实现捕获性能提升；同时，通过华大自主研发的Workflow，实现图像质控、拼接、配准、细胞分割全自动化，实现了真正的自动化空间单细胞分析。

空间TCR/BCR富集

为加速时空组学技术在临床方向的应用，Stereo-seq开发了空间免疫组库测序技术，目前针对TCR/BCR的V区设计了40多对引物，以cDNA为模板，富集TCR/BCR相关基因。一个典型的例子，癌症病人的扁桃体样本经过富集后，被检测到的TCR/BCR基因有了百倍至千倍的提升；经过VDJ组装后，在切片上获得了近5万种T细胞克隆型。

H&E+转录组

H&E染色是组织学、病理学常用的技术，目前Stereo-seq可以在同一张切片上成功兼容H&E染色和转录组的分析，更准确地判断组织分型及获取特定组织区域的基因表达信息。在算法分析上，Stereo-seq实现H&E图像与转录组表达矩阵的自动配准，科研工作者可以根据H&E染色的信息圈选感兴趣的区域，提取对应的表达矩阵，利用华大时空高级分析软件进行下游的高级分析，包括细胞聚类、注释、差异分析、通路富集分析等。

mIF+转录组

多重免疫荧光（mIF+转录组）可实现同张切片的多蛋白标记物和转录组共检测和共定位，同时辅助转录组实现细胞类型精准注释及细胞生物学功能解析。单细胞分辨率下，通过蛋白染色实现细胞重要结构的鉴定。

空间多蛋白

在同一张切片上，实现全转录组和多达十余种蛋白标记物的同时检测，获得更准确的细胞注释及鉴定。目前Stereo-seq技术分辨率为0.5 μm，远高于同类技术的最高分辨率，实现更加精细的空间蛋白和转录组的联合分析。

以上重磅新品，将于2023年陆续面市。为了让用户更好地体验Stereo-seq，廖莎同时发布了新品体验计划，即日起，所有的科研工作者都可通过提交信息申请免费体验。

未来，时空组学将朝着智慧实验室、多样本多组学、便捷与开放的平台方向，打造全方位的时空生态系统，降低科学发现的门槛，赋能更多领域的科学研究。