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《细胞》2022年前15期论文汇总| 第15期居然没有一篇研究论文!但有多篇综述

 GCTA 2022-11-15 发布于广东

2022年Cell第15期没有一篇研究论文!但有多篇综述和评述文章,阐述了相关技术和科学研究之间相辅相成协同发展的概念。

推荐阅读:
【肿瘤生物变聪明了】
【蛋白质结构的未来十年】
【人工智能对科学研究的影响】
【古DNA研究技术的发展和人类历史的未来】
【灵长类大脑的转录组、连接组和神经调节】
【人工智能在生物学和神经科学中的应用】
哺乳动物糖科学研究工具
单细胞方法在人类菌群研究中的作用
什么是细胞类型以及如何定义?

On the cover: Technologies and creative methods are essential for research. They allow us to (uncover new aspects of ourselves and our surrounding world)and address what would otherwise be insurmountable problems【解决本来无法解决的问题,insurmountable 记忆技巧:in 不 + sur 超 + mount 登上;升 + able 能…的 → 不能超过的 → 难以克服的】. In this special issue, we explore how( recently developed tools) can be used to (advance biological and bioengineering research) and highlight the unmet needs that future tools must address【强调未来工具必须解决的未满足的需求,换言之,目前的研究工具仍然不能满足我们所有的科研需求,但是这些问题将会随着技术的革新而得到解决】. We hope this special issue creates inspiration for technologies that—like a friendly robot—lift us higher, move us faster, and (carry us over obstacles) to help us achieve the impossible. Image credit: Naola Leconte.


The integral partnership of biology and technology

生物学与技术的整体伙伴关系【现代技术与生物科学相互促进作用】

技术的发展对生物学和生物医学十分重要。变革性的发现往往伴随着新方法、工具或计算方法的开发和巧妙部署而来。相应地,技术进步往往受到生物系统的启发,或者需要开发一种方法来解决生物问题。


Tumor biology gets smart

【肿瘤生物变聪明了】

协同作用 : 两个或两个以上的组织、物质或其他因素的相互作用或合作,可以产生比它们各自作用的总和更大的联合效应。

Tackling human problems through biotechnology

【利用生物技术解决人类问题】

米歇尔 · 麦克默里-希思博士在医学、免疫学、研究和政策协调方面具有广泛的背景,她目前担任生物技术创新组织(BIO)的首席执行官。她与《细胞》杂志的编辑 Cheri Sirois 聊了聊生物技术与基础科学的区别,以及生物技术提供的机会。这里分享了他们的谈话记录。

The next decade of protein structure
【蛋白质结构的未来十年】

随着蛋白质结构研究中各种技术的显著进步,我们请研究人员评论该领域下一个令人兴奋的问题,以及这些技术将如何不仅提高我们对蛋白质的认识,而且还提高我们对人类健康和疾病的认识。

The impact of AI on research
【人工智能对科学研究的影响】

庞大而复杂的数据集使得人工智能(AI)成为跨生物学研究发现的无价工具。我们询问了专家人工智能如何影响他们的工作。他们的经验和观点为人工智能在他们领域提供的潜力提供了深刻的见解。

The challenges in finding your home as a multidisciplinary scientist
【科学家的挑战:
作一名多学科科学家

各种科学分支的技术进步正在应用于生命科学,导致越来越多的科学家认为自己是多学科的,或者被归类为多学科的。虽然他们的多样化技能被赞扬,并需要了解生活的巨大复杂性,作为一个多学科的研究人员可以提出独特的挑战。我们询问了多学科研究人员和一个促进多学科研究的研究所所长,他们对多学科科学家经常面临的挑战或障碍有何看法。

Establishing a blockchain-enabled Indigenous data sovereignty framework for genomic data
【为基因组数据建立区块链式的数据主权框架】

技术进步使健康和基因组数据得以迅速生成,尽管这些技术很少考虑到边缘化社区的价值观和优先事项。在这篇评论中,我们概念化了一个区块链基因组学数据框架的概念建立了数据主权。

Evolving ancient DNA techniques and the future of human history
【古DNA研究技术的发展和人类历史的未来】

应用于人类基因组学的古 DNA (aDNA)技术在过去的十年中取得了显著的进步,使得大规模的 aDNA 研究成为可能,有时独立于人类遗骸。本评论回顾了 DNA 技术的主要里程碑,并探讨了未来的方向,以扩大范围的 DNA 研究和见解,目前的人类健康。

Transcriptome, connectome and neuromodulation of the primate brain
【灵长类大脑的转录组、连接组和神经调节】

单细胞转录组学分析促进了大脑中的细胞类型识别和细胞类型特异性连接体的映射,有助于阐明大脑功能的神经回路,并通过神经调节治疗脑部疾病。然而,我们缺乏一个共识的定义神经元类型/亚型和明确的区分因果之间的相互关联的网络。

The application of artificial intelligence to biology and neuroscience
【人工智能在生物学和神经科学中的应用】

在过去的十年里,人工智能(AI)经历了一场改变经济、社会和科学的革命。进展的速度是惊人的,几年前看似棘手的问题现在已经得到解决。神经科学和人工智能之间的交叉特别令人兴奋。

Tissue bioprinting for biology and medicine

Bioprinting merges additive manufacturing and tissue engineering to generate functional tissues and organs. The field has experienced tremendous growth over the past few years. Here, we highlight recent breakthroughs in bioprinting and discuss the challenges that are yet to be addressed before this technology can be widely utilized in biology and medicine.

Cryo-electron tomography: A long journey to the inner space of cells

Cryogenic electron tomography (cryo-ET) is the application of tomographic principles of data acquisition and reconstruction to frozen-hydrated biological specimens. It combines a close-to-life preservation of cellular structures with the power of high-resolution three-dimensional imaging, which allows us to study the molecular architecture of cells, or their molecular sociology, in unprecedented detail.

High current hydrogels: Biocompatible electromechanical energy sources

Innovations in soft materials bridge electronic conduction in conventional electronics and ionic conduction in biology. In a recent issue ofScience, Dobashi et al. describe a hydrogel that generates large ionic currents in response to applied force. The technology could enable sensors and energy generators for wearable and implantable devices.

Repurposing chemical waste: Sustainable chemistry for circularity beyond artificial intelligence

Generating considerable amounts of industrial waste requires rethinking chemistry for circularity in a broader picture. We discuss the study by Wołos etal. (2022) showing that the critical application of artificial intelligence on chemical reactivity can help us trace an unprecedented number of syntheses to novel responsible uses of waste.

Tools for mammalian glycoscience research
【哺乳动物糖科学研究工具】

聚糖是复杂的、无处不在的、异质的,在生物学的基本过程中起着重要作用。Griffin 和 Hsieh-Wilson 提供了一个关键的概述,并讨论了目前用于鉴定,表征,监测和调节哺乳动物聚糖的方法,探索技术进步如何克服聚糖复杂性和异质性的困难,以提供更清楚的聚糖活性的中心特征。

Metabolic analysis as a driver for discovery, diagnosis, and therapy

This review describes recent technical advancements in metabolic analysis over the last decade and how they have advanced understanding of metabolism in a variety of biomedical contexts.

3D genome, on repeat: Higher-order folding principles of the heterochromatinized repetitive genome

Nearly half of the human genome is comprised of diverse repetitive sequences ranging from satellite repeats to retrotransposable elements. Such sequences are susceptible to stepwise expansions, duplications, inversions, and recombination events which can compromise genome function. In this review, we discuss the higher-order folding mechanisms of compartmentalization and loop extrusion and how they shape, and are shaped by, heterochromatin. Using primarily mammalian model systems, we contrast mechanisms governing H3K9me3-mediated heterochromatinization of the repetitive genome and highlight emerging links between repetitive elements and chromatin folding.

Synthetic chromosomes, genomes, viruses, and cells

Synthetic genomics is a branch of synthetic biology that constructs viruses, bacteria, and eukaryotic cells with synthetic genomes. Venter and colleagues review the foundations, advances, challenges, and future prospects of synthetic genomics.

Single-cell approaches in human microbiome research
单细胞方法在人类菌群研究中的作用

这篇综述介绍了最近开发的各种单细胞方法,用于研究该领域的正常菌群和其余挑战。

What is a cell type and how to define it?
【什么是细胞类型以及如何定义?】

在这篇综述中,曾教授讨论了从哺乳动物大脑中学到的见解如何开始揭示细胞类型的普遍组织原则,并提出了基于这些原则的路线图,用于采用多层次,迭代的方法来定义细胞类型,并产生跨寿命,物种,大脑和身体的细胞类型的知识库。

Human organoids: New strategies and methods for analyzing human development and disease

This review highlights novel advances in organoid biology with a focus on how organoid technology has generated a better understanding of human-specific processes in development and disease.

Cancer vaccines: Building a bridge over troubled waters

For many decades, vaccines have provided effective protection against a variety of infectious diseases. Attention is now focused on utilizing the power of the immune system to target tumors through the development of cancer vaccines. This review provides a background in how the immune system responds to cancer and how these immune responses can be harnessed for cancer vaccines and highlights some of the remaining challenges.

Designing antibodies as therapeutics

Antibodies are a rapidly evolving class of drugs with the potential to treat a myriad of human diseases. Technological advances in areas such as protein engineering and drug delivery are enabling the design of antibodies that overcome some of the hurdles previously limiting their use as therapeutics in certain disease or clinical settings. This review highlights the major obstacles that have limited the use of antibodies as drugs and discusses how antibody design is overcoming these problems to unleash their full therapeutic potential.

Therapeutic in vivo delivery of gene editing agents

Therapeutic gene editing has made exciting progress in the past few years, in part through key advances inin vivo delivery technologies. David Liu and colleagues review the essential characteristics required for efficient in vivo gene editing delivery vehicles, discussing the pros and cons of viral vectors, lipid nanoparticles, and virus-like particles.

The integrated genomics of crop domestication and breeding

New genomic methods have advanced the understanding and capacity to manipulate plant genomes to accelerate future crop domestication and breeding needed to address the looming challenge of global food security.

SnapShot: Spatial transcriptomics

Spatially resolved transcriptomics methodologies using RNA sequencing principles have and will continue to contribute to decode the molecular landscape of tissues. Linking quantitative sequencing data with tissue morphology empowers profiling of cellular morphology and transcription over time and space in health and disease. To view this SnapShot, open or download the PDF.

往期回顾:(点击每期任意文字可转换到对应全文)

2022年Cell第1期共发表6篇研究论文,内容包括:指纹基因的发现、mRNA疫苗功效、艾滋病的预防、细菌生物膜分段时钟的机制、蛋白质折叠校正结构机制、肺癌免疫逃逸机制。
2022年Cell第2期共发表8篇研究论文,内容涉及DNA非依赖的基因编辑技术,单HIV病毒分析,GSDMB不依赖细胞焦亡调节上皮恢复/修复,乳腺癌浸润性转变与进展性有关,皮层细胞类型和功能发育与视觉有关,腹侧嵴髓小脑束神经元控制哺乳动物运动,利用3D的“最小活细胞”模拟细胞内部基本运作,解析酵母核孔复合体的三维结构。
2022年Cell第3期共发表7篇研究论文,有5篇和疫情直接相关,另外两篇关于是微生物,具体内容包括奥密克戎变异株对抗体介导的中和作用具有高度抗药性,mRNA疫苗增强剂诱导的中和免疫,奥密克戎突变体广泛逃离中和抗体反应,德尔塔变异株接种疫苗后的传播能力,肠道微生物聚糖代谢,补体激活新冠病毒导致过度T细胞毒性,基因组结构预测微生物群落代谢动力学。
2022年Cell第4期共发表7篇研究论文,包括镁并调节CD8+T细胞效应功能,新冠mRNA疫苗有效性的关键是滤泡辅助T细胞,真菌配体的物理性质与抗原免疫原性,人血管紧张素转换酶2(ACE2)受体及其复合结构HIV病毒微结构,哺乳动物中性别典型的社会行为由大脑基因活动的差异决定,泵状光敏感通道蛋白ChRmine通道传导的结构。

2022年Cell第5期共发表9篇研究论文,包括:
胞表面的波动调节早期胚胎谱系分选
转录因子蛋白质相互作用组揭示
心脏病的遗传决定因素
GPR35 响应血清素代谢物5-羟基吲哚乙酸 (5-HIAA)促进
中性粒细胞募集
黏膜真菌
通过17型免疫促进肠道屏障功能和社会行为
新冠
疫苗可诱导针对Omicron变体的强大记忆T细胞免疫效应
SARS-CoV-2
奥密克戎传染性和免疫逃避的结构和功能特征
SARS-CoV-2的突破性感染或会引起强有力、广泛且持久的
机体中和抗体反应
多种早期因素预示着急性2019
冠状病毒疾病后遗症
新一代2019冠状病毒疾病
疫苗的呼吸道黏膜输送可提供强有力的保护,抵抗原始和变异;

2022年Cell第6期共发表9篇研究论文,包括:

局部热疗诱导白色脂肪褐变并治疗肥胖,泡个热水澡也可减肥啊!
合成信号通路可实现细胞群规模调控
TFPI是超毒力分支艰难梭菌毒素B肠道隐窝受体
两种抗体的组合使用有望治疗多种致命的埃博拉病毒物种。
新冠
mRNA疫苗可促进有效抗原特异性生发中心反应
疫苗接种与SARS-CoV-2感染后产生的
抗体不同
大部分个体(但并非所有个体)对 SARS 冠状病毒2型
奥密克戎变异株的T细胞反应仍然存在。
非细胞自主破坏核结构是 COVID-19诱导
嗅觉丧失的潜在原因。
中脑-丘脑-皮层回路重组皮层动力学以启动准备好的运动

2022年Cell第7期共发表7篇研究论文,包括:

果子狸等“野味”病毒多,不能吃。
cAMP纳米畴是不同G蛋白偶联受体
GPCR行使不同功能的关键。
冷冻电镜结构揭示了细菌外膜
蛋白质折叠的多个阶段。
以MHC/HLA-1为受体的新肠球菌成孔毒素(Epxs)。
肠粘膜
唾液酸化调控肠道宿主-菌群生理稳态。
人类乳腺癌中的组织驻留
FOLR2+巨噬细胞与CD8+T细胞浸润相关。
肿瘤反应性抗体非结合性和自身反应性前体演化而来。

2022年Cell第8期共发表9篇研究论文,包括:

为了包装更大的基因组,杆状病毒进化成纺锤形
oskar核糖核蛋白颗粒通过液相-固相转变调控果蝇胚胎发育;
新型聚集体自噬受体CCT2介导固态聚集体的清除;
TMEM106B在多种
神经退行性疾病中的同型纤维化;
肿瘤内的
微生物促进乳腺癌转移定植;
表达LGR5的皮肤成纤维细胞定义硬皮病中一个主要的细胞枢纽;
可吸入双特异性单域抗体,可广泛中和新冠病毒变体;
古基因组揭示了7世纪阿瓦尔族精英的起源和快速跨欧亚大陆迁移;
替代细胞因子激动剂的筛选方法。

2022年Cell第9期共发表10篇研究论文,包括:

【Argonaute蛋白通过一种新机制中和入侵 DNA,增加NAD (P) + 消耗,触发细胞死亡】
合成基因元件的跨物种表达有助发现人类微生物组衍生性的代谢物】
【雄性来源的
非核糖体多肽信息素控制着雌性血吸虫发育
靶向线粒体凋亡增强NK细胞免疫治疗
【Omicron 和 Delta 变异
疫苗对感染的保护作用随着时间的推移而减弱
【猴试验:测试针对奥密克戎变异毒株的疫苗保护】
加强针疫苗增强反应性记忆B细胞诱导的免疫反应】
【增强变异匹配或历史mRNA疫苗对小鼠Omicron感染的保护作用】
【印迹 SARS-CoV-2特异性记忆淋巴细胞定义混合免疫】
【前额叶远程抑制对海马信噪比的自上而下控制】

2022年Cell第10期共发表10篇研究论文,包括:

有袋动物的不完全谱系分类和表型进化】
【GPCR介导β-arrestin激活的单分子精度机制】
大麻与心脏病有关,金雀异黄素可以降低该风险
【静息的癌细胞通过形成免疫抑制生态位来抵抗T细胞的攻击】
【骨髓组织的适应性先天免疫训练是炎症性合并症的基础】
【SARS-CoV-2环状RNA疫苗及其变异体的研究】 
【蛋白酶调控的CAR-T细胞受体可增强安全性和有效性】
人类线粒体DNA中A-到-G的碱基编辑
【DNA纳米阵列技术绘制小鼠器官发生时空转录组图谱
【哺乳动物组织中细胞药物靶点的原位识别

2022年Cell第11期共发表10篇研究论文,包括:

【1.29万年前第一批农民的基因起源
【宿主和病原体能够响应针对脓肿分枝杆菌肺部感染而设计的噬菌体】
【第三剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗对Omicron反应性B细胞记忆的影响】
【一种植物免疫蛋白能够通过挽救microRNA的缺乏来实现广泛的抗肿瘤反应
【谱系追踪揭示了肿瘤的系统动力学、可塑性和进化途径
淋巴结定植诱导肿瘤免疫耐受促进远处转移
【抑制 PAAN/MIF 核酸酶可预防帕金森病中的神经退行性疾病
细胞外基质(ECM)动力学在自发滤泡模式下产生超细胞流动性】
癌症中突变导向的新蛋白相互作用
【人类复发性反转多态性与遗传不稳定性和基因组疾病相关】

2022年Cell第12期共发表10篇研究论文:
【帕金森病蛋白α-突触核蛋白调控mRNA稳定性
【拆除反义寡核苷酸搭起的“路障”可显著提高其在脊髓性肌萎缩症中的疗效】
先天性巨痣消退的局部治疗及黑色素瘤的预防
【破坏自动抑制回路产生“开环杀伤力”以产生
抗逃逸的抗病毒剂
【SARS冠状病毒2型
奥密克戎变异株BA2的病毒学特性
奥密克戎突破性感染后能够增强疫苗保护效果并产生大量反应性抗体
【人类
核外泌体靶向复合物(NEXT) RNA监测的结构机理】
【锌调节的GTPase金属蛋白激活剂1(ZNG1)调节
脊椎动物的锌稳态
XIST缺失损害乳腺干细胞分化,增加乳腺的成瘤性
胶质瘤的进展是由遗传进化和微环境相互作用决定的
2022年Cell第13期共发表11篇研究论文:
【星形胶质细胞和小胶质细胞中胆固醇与基质体通路失调
【骨髓
造血促进多发性硬化症的进展】
【基因编辑
人类造血干细胞的无化疗移植新方法
【新一代
重组蛋白疫苗高效预防Omicron
【新的人类冠状病毒CCOV-HuPn-2018
起源于犬类
【帕金森病风险蛋白TMEM175是
溶酶体中质子激活的质子通道
【非编码7S RNA通过
线粒体RNA聚合酶二聚化抑制转录】
【III-E 型
CRISPR-Cas7-11效应子配合物的结构与工程化】
【BacPROTACs 介导
细菌靶向蛋白质降解
【一系列保守的细菌毒性因子
通过阻断钙信号来抑制干扰素的反应
【植物免疫受体的TIR结构域为介导
细胞死亡的2′ ,3′-cAMP/cGMP合成酶】

2022年Cell第14期共发表11篇研究论文:

【新冠病毒BA.4、BA.5变种可逃避疫苗及免疫系统】
【四种新冠
疫苗诱导的体液和细胞免疫记忆
轻微的新冠感染仍可导致神经细胞和髓鞘失调】
【GABAA受体自身免疫性脑炎的结构机制】
抑制食欲的器官间神经回路】
肠道菌群将橙皮纤维转化为活性代谢物N-甲基-5-羟色胺】
皮肤共生微生物来源的一种气味挥发物促进黄病毒感染宿主吸引蚊虫】
【从
多能干细胞生成人类动脉和静脉细胞突出了尼帕病毒和亨德拉病毒的动脉嗜性】
【胸腺上皮细胞通过谱系相关转录因子清除自身反应性T细胞】
单细胞测序绘制首张全基因组基因型-表型图谱
【小鼠卵母细胞在哺育细胞的帮助下在囊中发育】
【解析未经治疗的
人类黑色素瘤脑转移的生态系统】

-END-

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