分享

Haploview做单倍型教程1--软件安装

 育种数据分析 2022-12-29 发布于河南

大家好,我是邓飞,这里介绍一下如何使用Haploview进行单倍型的分析。

计划分为三篇文章:

  • 第一篇:Haploview做单倍型教程1--软件安装
  • 第二篇:Haploview做单倍型教程1--分析教程
  • 第三篇:Haploview做单倍型教程1--结果解读

今天是第一篇。

下面是Haploview做的结果:

下面是LDblockShow做的结果:两者结果是一致的。

Haploview因为是GUI界面,可以鼠标点点点的形式,所以更简单:

1. 软件下载

「官网:」 https://www./haploview/downloads#JAR

「windows系统:」

「Linux系统:」

2. 配置java环境

https://www./zh-CN/download/

下载安装好之后,在终端运行java,出现帮助文档,说明配置成功。

2.1 windows系统

cmd终端打开,键入java,出现下面界面,说明配置成功。

2.2 Linux系统

终端打开,键入java,出现下面界面,说明配置成功。

3. windows安装

安装好之后,打开HaploView软件:

打开软件:

4. Linux安装

终端下,键入命令:

java -jar Haploview.jar 

出现界面:

上面就是搞定了软件的安装。

下一篇介绍一下数据分析实操方法。

下下一篇介绍Haploview结果如何解读及如何微调结果。

欢迎继续关注。

    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多