大家好,我是邓飞,这里介绍一下如何使用Haploview进行单倍型的分析。 计划分为三篇文章:
今天是第一篇。 下面是Haploview做的结果: 下面是LDblockShow做的结果:两者结果是一致的。 Haploview因为是GUI界面,可以鼠标点点点的形式,所以更简单: 1. 软件下载「官网:」 https://www./haploview/downloads#JAR 「windows系统:」 「Linux系统:」 2. 配置java环境https://www./zh-CN/download/ 下载安装好之后,在终端运行java,出现帮助文档,说明配置成功。 2.1 windows系统cmd终端打开,键入java,出现下面界面,说明配置成功。 2.2 Linux系统终端打开,键入java,出现下面界面,说明配置成功。 3. windows安装安装好之后,打开HaploView软件: 打开软件: 4. Linux安装终端下,键入命令:
出现界面: 上面就是搞定了软件的安装。 下一篇介绍一下数据分析实操方法。 下下一篇介绍Haploview结果如何解读及如何微调结果。 欢迎继续关注。 |
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