196年（汉建安元年）置侯官县， 属会稽郡南部都尉。三国吴时，隶属建安郡。 282年（晋太康三年）侯官析置原丰县、温麻县，三县同属晋安郡。 502—519年（南朝梁天监中年间）侯官、原丰合并为东侯官。589年（隋开皇九年）复名原丰。 592年（隋开皇十二年）改名闽县，属建安郡。623年（唐武德六年）闽县析置侯官、长溪、新宁（长乐）、温麻（连江）县。公元631年（贞观五年）侯官又并入闽县。702年（武周长安二年）复置侯官县。766年（永泰二年）划侯官西部地置永泰县。785年（贞元元年）划北部地置梅溪场（后为闽清县）。808年（元和三年）侯官并入福唐县，810年（元和五年）复置侯官县，闽县和侯官县同属福州。闽国年间 （933年）改闽县为长乐县，侯官县为闽兴县。935年，长乐、闽兴复名闽县、侯官县。941年，闽县再改称长乐县，翌年又恢复原名，此时两县皆隶于长乐府。981年（宋太平兴国六年）闽县析置怀安县，侯官、闽县、怀安三县同属福州。元属福州路。公元1580年（明万历八年）怀安县并入侯官县，自此闽县、侯官两县并立，同属福建 宁福道福州府。民国元年(1912年)，闽县、侯官县政区仍沿袭清末区划。5月5日，闽县、侯官县裁撤归并，称闽侯府， 原两县一切事务均归闽侯府接收管理。闽侯府印信于12日启用，福州府印信于同日作废。同年11月，闽县、侯官县印又重新启用。 民国2年3月废府，闽县、侯官县再次合并为闽侯县，辖地范围不变。取两县原名首字定名为闽侯县，闽侯由此而得名。 1946年,民国35年，析县治部分区域设福州市政筹备处，从此县市分治。1944年改名林森县。1949年9月隶属福建省第四专区，1950年复名闽侯县，属闽侯专区。1956年3月直属福建省辖，8月改属福州市（或说，1958年属福州市）。 1959年复属闽侯专区， 闽侯又归其管辖， 1970年改专区为地区，同年2月，闽侯地区移驻莆田，改称莆田地区。 1970年，闽侯县改隶莆田地区。2013年7月1日，闽侯县南屿镇以及上街镇建平、新洲、厚庭、马排、马保等5个村交由福州高新区托管。县内著名景点有旗山国家森林公园、昙石山文化遗址、雪峰寺、马岚山、十八重溪风景区、塔礁洲湿地公园等。
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