基于网络药理学和分子对接技术探讨四季抗病毒合剂治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制杨起江张思思苗云波阮丽波杨天睿云南省第一人民医院昆明理工大学医学院1 摘要：目的：利用网络药理学及分子对接技术探讨四季抗病毒合剂治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制，为临床应用提供理论依据。方法：首先应用TCMSP数据库获得四季抗病毒合剂的活性成分及靶点，通过GeneCards数据库检索新型冠状病毒肺炎靶点，然后采用Cytoscape3.6.1软件构建“中药-成分-靶点”网络，接着将药物及疾病的交集靶点导入STRING平台构建蛋白相互作用（PPI）网络，并利用DAVID数据库、R软件（ggplot2包）实现基因本体（GO）富集和KEGG通路富集分析，最后将四季抗病毒合剂的主要活性成分及目前临床报道有效化学药（氯喹、利巴韦林、瑞德西韦）与SARS-CoV-23CL水解酶进行分子对接。结果：经数据库分析筛选出四季抗病毒合剂活性成分156个，对应靶点271个；筛选出新型冠状病毒肺炎靶点259个，PPI网络分析获得四季抗病毒合剂干预COVID-19关键作用靶点53个，关键靶点涉及IL6、MAPK3、TNF、MAPK8等。GO及KEGG富集分析得出与四季抗病毒合剂治疗COVID-19作用相关的生物过程499个（P＜0.05），其中生物学过程条目406个、细胞组成条目38个、分子功能条目为55个；相关信号通路120条（P＜0.05），主要涉及查加斯病（美洲锥虫病）、乙型肝炎、TNF信号通路、利什曼病、百日咳等通路。分子对接结果表明四季抗病毒合剂主要活性成分与2019-nCoV3CL水解酶具有较好的亲和力且亲和力与目前临床报道有效化学药相近。结论：四季抗病毒合剂主要活性成分能稳定与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合，通过多成分、多靶点调节多条信号通路发挥对COVID-19 的治疗作用。 关键词：四季抗病毒合剂;新型冠状病毒肺炎;网络药理学;分子对接;SARS-CoV-2 3CL水解酶; 基金资助：云南省科技计划项目（编号：2017FE468（-112））
|
|
|
