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【收藏】DRESIS数据库:史上最全面的耐药性数据库

 外科黄文斌 2023-04-14 发布于广东
广泛的耐药性已成为全球卫生保健的关键问题,今天要介绍的DRESIS数据库则有望解决耐药相关的临床治疗优化并辅助新药开发。文章标题:DRESIS: the first comprehensive landscape of drug resistance information,数据库地址:http://dresis./

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DOI: 10.1093/nar/gkac812


数据库亮点

v首次系统地整理全网最全的耐药分子机制;
v全网最广泛的疾病覆盖;
v全网数量最多的药物临床/实验验证耐药数据。

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数据库收录信息

DRESIS数据库收录了超过2万种具有临床/实验验证的耐药性药物,对应到395种耐药疾病,以及2197个关键耐药分子的分子机制,并分析了耐药相关分子的疾病特异性和组织特异性。

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1)药物耐药信息详情
每种药物耐药信息的详细描述包括:药物名称、药物同义词、疾病适应症(以及相应的药物临床状态)、药物结构(可下载的2D3D格式)、药物靶点和外部链接到其他完善的分子生物学数据库,如PubChemDrugBankTTDVARIDTINTEDE,以及对应的耐药疾病。

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(2)药物的耐药机制类型
使用交互式图表说明药物的多种耐药机制。药物被放置在中间,周围是各种类型的机制(如图顶部所示。不同的疾病类别与不同机制类型相关联,这些机制类型进一步与关键的抗性分子相关联(在最外层的叶子中显示)
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数据库还按照疾病进行分类,提供了详细的耐药机制,包含:关键耐药分子数据、耐药证据类型和实验细节。对于关键的耐药分子,描述了它们在耐药疾病中的改变,及不同类型的耐药证据(临床报告,通过体内模型验证或通过细胞系实验确定)。实验细节包括:不同的实验技术,数百种疾病细胞系和感染菌株,数百种体内模型和多种信号通路调控的耐药性疾病。

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(3)对一种特定疾病的耐药性药物的总览
DRESIS数据库还可以查看特定疾病的耐药性药物的总览结果:纵轴使用药物id提供完整的耐药药物列表,横轴使用分子id显示另一个关键耐药分子列表。可以通过拖动交互图底部和右侧的滑块来实现整个总览的可视化。不同类型的耐药机制在这张图中用不同颜色的圆圈(中间有字母“R”)表示。将鼠标放在任意一个圆圈上,就可以交互式地查看机制类型、耐药药物和关键分子的详细信息。

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数据库使用指南

(1)数据检索
可以在数据库的“Home”“Search”界面直接检索所关注的药物/疾病/分子,当然也可以设置筛选条件进行精细检索,使用非常友好。

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(2)数据下载
可以在数据库的“Download”界面下载药物/疾病/分子,下载也非常友好哦。

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说一千道一万,不如大家动动手指点一点试试看,再次奉上数据库地址:http://dresis./

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