加星标,才能不错过每日推送!方法见文末动图 人类,作为灵长类中的一员,一直关注着灵长类动物的起源和演化。这方面的研究不仅有助于回答人类的起源问题,也能让我们更多了解人类独特的身体结构特征是怎样演变的。随着分子生物学的发展,近年来我们已经有能力通过基因研究来回答相关的问题。 虽然非人类灵长类动物在生物学、演化学、药理学等领域中扮演着重要的角色,但仅有不到10%的非人类灵长类动物的参考基因组得到了测序和解读。测序进展缓慢,大大限制了我们对非人灵长类动物的基因组演化、适应性演化以及分子生物学方面的深入探究。 为了改善这样的状况,2018年,中外多个研究中心联合发起了灵长类基因组计划,旨在通过多学科交叉技术手段和团队合作,研究人类在内的灵长类物种的起源和分化过程,以及灵长类社会组织和各种生理特征的演化和遗传基础。此外,联盟还将研究灵长类遗传变异图谱及其对人类致病基因变异模式的影响。 浙江大学生命演化研究中心张国捷教授团队 中国科学院昆明动物所吴东东研究员团队 西北大学生命科学学院齐晓光教授团队 云南大学生命科学学院于黎研究员团队 西班牙庞培法布拉大学联合演化生物学研究所Tomàs Marquès-Bonet教授团队 Illumina人工智能实验室 美国贝勒医学院人类基因组测序中心Jeffrey Rogers教授团队 丹麦奥胡斯大学Mikkel H. Schierup团队 德国莱布尼茨灵长类研究所Christian Roos教授团队 随着灵长类基因组计划的逐步推进,这一情况得到了改观。近日,联盟成员在灵长类演化研究上取得重大进展,回答了一系列相关问题。主要成果于2023年6月2日以研究专刊的形式在学术期刊Science(《科学》)上发表8篇论文(其中有4篇是国内团队主力完成)。另有3篇卫星论文同日发表于Science Advances(《科学进展》)、Nature Ecology & Evolution(《自然-生态与演化》)等知名学术期刊。(注:发表于NEE的论文将于今日23点上线) 在Science专刊的8篇论文中,题为“Phylogenomic analyses provide insights into primate evolution”(《基因组学分析提供了对灵长类演化的洞见》)的研究论文是一篇基础性的、重要的旗舰论文。它是由浙江大学生命演化研究中心张国捷教授团队联合昆明动物研究所吴东东教授团队、西北大学齐晓光教授团队和其他国内外合作者完成的。今天我们推出对这篇旗舰论文的清晰、系统的解读,以飨读者。 灵长类祖先出现在白垩纪界限附近图1.灵长目演化树(点击看大图)。灵长类图片由Stephen D. Nash绘制(张国捷课题组和吴东东课题组合作供图) 再认识灵长类的染色体演化历程图2. 示意图:人类8号染色体在灵长类的起源过程的不同假说。(张国捷课题组供图) 灵长类大脑经历了快速演化图3. 灵长类物种脑容量演化历程,以及此过程中基因组上的变化。大脑图像来自于密歇根州立大学的比较哺乳动物大脑收藏。(张国捷课题组和吴东东课题组合作供图) 猿类的尾巴怎么会丢失?图4.KIAA1217基因的调控区域在猿类中快速演化,可能导致了猿丢失尾巴。在图形下方可以看到快速进化区域与基因落在同一个TAD(图上三角形)中,暖色表示较强的相互作用。(张国捷课题组和吴东东课题组合作供图) 灵长类其他性状演化和基因组变化之间的联系图5. 灵长目基因组演化特征与表型特征之间的关联。(张国捷课题组和吴东东课题组合作供图)
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