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文献解读| 分享一种新的液滴数字聚合酶链式反应检测的文章

 科研资料帮 2023-06-19 发布于广东

大家好,今天来给大家分享一篇四川大学华西医院应斌武教授团队近期在Inter national Journal of Infect ious Dise ases上发表科研成果,基于领航基因微滴数字PCR系统开发了一种灵敏且稳定的用于结核分枝杆菌定量的检测方法。题为 A new droplet digital PCR assay: impr oving dete ction of pau ciba cillary smear-ne gative pu lmo nary tube rcu losis(一种新的液滴数字聚合酶链式反应检测方法:改进少菌涂阴肺结核的检测)的文章。

01

研究背景

涂片阴性肺结核 (PTB) 难以诊断。目前的诊断和治疗监测方法具有固有的局限性。微滴数字PCR(ddPCR)是一种高灵敏度的新技术。本研究提出了一种用于快速灵敏地鉴定结核分枝杆菌(MTB)的新型ddPCR。

使用ddPCR测定法在疑似早产病例的呼吸道标本中检测到MTB DNA,该测定法针对IS6110中的两个不同位置。我们首次评估了这种ddPCR对贫杆菌涂片阴性PTB的临床诊断能力。

见图一

研究设计和患者入组的流程图。

图一

见图二

ddPCR检测呼吸道标本中MTBIS 6110序列的分析。

图二

(A) 分别在 PTB 组和非 PTB 组中检测到IS 6110 拷贝数。

(B) 分别在涂片阳性、涂片阴性和非早产患者组中检测到IS 6110 拷贝数。

见图三

使用呼吸道样本的 ddPCR 对早产的诊断性能。

图三

(A)IS6110 ddPCR的ROC曲线用于诊断总早产。

(B)IS6110 ddPCR的ROC曲线用于涂片阴性PTB诊断。

见图四

比较ddPCR和常规检测在检测总早产病例方面的诊断性能。

图四

(A)ddPCR与分枝杆菌培养:敏感性分析为55.22%vs 33.58%(P = 0.172)。

(B)ddPCR与qPCR:灵敏度分析为61.60%对27.38%(P = 0.033)。

(C)ddPCR与Xpert:灵敏度比较为58.06%与38.06%(P = 0.654)。

(D)ddPCR与IGRA:敏感性分析为59.46%vs 68.65%(P <0.001),呼吸样品中使用的IS6110-ddPCR测定的临界值设置为6.45拷贝/ 15μl反应混合物。

IS 6110-ddPCR 测定与培养、IS6110-qPCR、Xpert 和使用 McNemar 测试的 IGRA 测试的灵敏度比较。P <0.05, *;P <0.01, **;P <0.001。

见图五

ddPCR 测定与其他涂片阴性 PTB 诊断测试的性能比较。

图五

(A)ddPCR与分枝杆菌培养:敏感性分析为49.09%vs 23.64%(P = 0.001);

(B)ddPCR与qPCR:敏感性分析为58.37%vs 19.91%(P <0.001);

(C)ddPCR与Xpert:灵敏度比较为53.08%与28.46%(P = 0.020);

(D)ddPCR与IGRA:灵敏度比较为55.63%与68.75%(P = 0.005)。呼吸样品中使用的IS6110-ddPCR测定的临界值设置为6.45拷贝/ 15μl反应混合物。IS 6110-ddPCR 测定与培养、IS6110-qPCR、Xpert 和使用 McNemar 测试的 IGRA 测试的灵敏度比较。P <0.05, *;P <0.01, **;P <0.00。

02

研究结论

本文开发并验证了一种高灵敏度和稳健的ddPCR检测方法,用于呼吸道标本中的MTB定量,从而改善了涂片阴性PTB的诊断和治疗效果评估。

好了,今天的文献解读就到这儿来,我们下期再见!

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