|
大家好，本期小编给大家介绍的一篇文章DTL的关键作用以前与基因组稳定性有关题目为“Role of DTL in Hepato cellular Carci noma and Its Impact on the Tumor Micro envi ron ment”（DTL在肝细胞性肝癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响），的研究论文。 01 研究背景 DTL的关键作用以前与基因组稳定性有关;然而，其预后价值及其与肝细胞癌（HCC）肿瘤免疫的关系仍有待进一步探讨。 转录和突变数据集以及临床信息从GEO，ICGC和TCGA数据库中检索。通过DTL的比较获得差异表达基因（DEGs）高和 DTL低TCGA-HCC队列的表达组。 这些基因在KEGG和基因本体（GO）分析下破译DTL基因对HCC肿瘤细胞生物学行为的影响。根据DTL水平描绘和分析患者的生存状态和突变特征。 114例肝细胞癌患者的队列（验证队列）进一步证实了HCC中的DTL过表达及其对预后的影响。采用TIMER、GEPIA和TISIDB数据库来研究DTL水平与免疫细胞状态以及免疫细胞浸润之间的潜在关系。 见图一 肝细胞癌患者中DTL表达上调。  图一 （A–F， H）通过基于GEO，TCGA和ICGC数据库的学生t检验或Mann-Whitney U检验比较HCC患者肿瘤和非肿瘤组织之间的DTL转录水平。 （G）来自GEPIA数据库的肿瘤和非肿瘤组织中DTL表达的箱线图。 （I、K）DTL IHC 染色和统计结果揭示了验证队列中 DTL 的蛋白质水平。（K） 验证队列的操作系统分层为 DTL 高组和 DTL 低组。*p < 0.05，***p < 0.001。 见图二 DTL 的高表达可预测肝细胞癌预后较差。  图二 （A-C）TCGA数据库中HCC患者的生存分析，按DTL表达分组。 （E、F）DTL表达对按性别、种族、酗酒和肝炎病毒感染分组的HCC队列的影响的总生存期（OS）分析。 见图三 具有DTL过表达的HCC细胞表现出促增殖特征。  图三 （A-D）839个上调DEG的KEGG途径富集和GO分析。 （E–G）基因集富集分析 （GSEA） 提示 DTL 与细胞周期、DNA 复制和细胞分裂呈正相关。 见图四 DTL与HCC细胞周期相关的关键基因之间的关联。  图四 （A）勺形图显示了通过皮尔逊相关分析计算的与DTL表达相关的基因（橙色点，R < -0.3;玫瑰色点，R > -0.3）。 （B）细胞周期相关基因与DTL之间的相关性，以及它们对TCGA-HCC队列预后的影响。 （C）通过Cytoscape（ClueGO模块）可视化与DTL密切相关的基因相互作用网络。节点大小表示映射的基因数;节点颜色明细表表示 P 值。 见图五 体细胞突变与肝细胞癌中DTL表达的关系。  图五 （A）DTL高表达和低DTL表达组中的体细胞突变。 （B）DTL高表达组和低表达组突变比较。*P < 0.05， **P < 0.01， ****P < 0.001。 见图六 DTL表达与免疫细胞标记基因集的关系。  图六 （A、B）气泡图显示了DTL基因与16种不同免疫细胞的标记集或其状态（A）的相关性，以及从Timer 8.4数据库中总结的活化CD2 + / CD0 + T细胞标记（B）。 见图七 DTL高表达肿瘤免疫细胞浸润特征。  图七 （A、B）采用xcell和TISIDB平台分析了DTL表达与免疫细胞浸润的关系。 （C）亚组中22个免疫细胞的比例（DTL高和 DTL低）的HCC。 （D）箱形图显示了高DTL组和低DTL组中四种类型的免疫细胞组成的差异。 （E）高/低DTL表达组适应性免疫、先天免疫和T细胞反应活性的差异。 （F）DTL基因高表达组和低表达组之间不同免疫细胞活性的差异。*P < 0.05， **P < 0.01， ****P < 0.001， ****P < 0.0001.ns，没有意义。 02 研究结论 与远处非恶性肝组织相比，DTL基因在肿瘤组织中过表达，DTL在肝细胞中的过表达会增强HCC细胞在细胞周期和分裂中的活性。与低DTL表达的肝细胞癌患者相比，DTL表达高的肝癌患者临床结局较差，体细胞突变更多，多因素分析也表明DTL过表达可作为预后的独立生物标志物。 此外，DTL基因与浸润活化的CD8+和CD4 + T细胞的标记集呈正相关;然而，这些细胞被证明在功能上已经耗尽。 肝细胞癌中具有 DTL 过表达表型的患者预后比 DTL 患者差低组由于DTL基因在前细胞增殖过程中的作用，伴随着免疫抑制微环境和T细胞耗竭。 好了，今天的文献解读就到这儿来，我们下期再见！ |
|
|
