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DNA电泳常见问题

 和元李记 2023-08-10 发布于上海

一、DNA带缺失

原因:①小DNA带走出凝胶

解决方式:缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度

原因:②分子大小相近的DNA带不易分辨

解决方式:增加电泳时间,核准正确的凝胶浓度

原因:③DNA变性

解决方式:电泳前请勿高温加热DNA链,以20mMNacl Buffer稀释DNA

原因:④DNA链巨大,常规凝胶电泳不合适

解决办法:在脉冲凝胶电泳上分析

二、DNA带模糊

原因:①DNA降解

解决办法:避免核酸酶污染

原因:②电泳缓冲液陈旧

解决办法:电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低。pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液

原因:③所用电泳条件不合适

解决办法:电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃;巨大DNA链电泳,温度应<15摄氏度;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力

原因:④DNA上样量过多

解决办法:减少凝胶中DNA上样量

原因:⑤DNA样含盐过高

解决办法:电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐

原因:⑥有蛋白污染

解决办法:电泳前酚抽提去除蛋白

原因:⑦DNA变性

解决办法:电泳前勿加热,用20mM NacI缓冲液稀释DNA

三、不规则DNA带迁移

原因:①对λ/Hird 11I片段cos位点复性

解决办法:电泳前于65℃加热DNA 5分钟,然后在冰上冷却5分钟

原因:②电泳条件不合适

解决办法电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液

原因:③DNA变性

解决办法:以20mM Nacl Buffer稀释DNA,电泳前勿加热

四、带弱或无DNA带

原因:①DNA的上样量不够

解决办法:增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂电泳灵敏度稍高,上样量可适当降低

原因:②DNA降解

解决办法:避免DNA的核酸酶污染

原因:③DNA走出凝胶

解决办法:缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度

原因:④对于EB染色的DNA,所用光源不合适

解决办法:应用短波长(254nm)的紫外光源

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