2017/3/5 第三章 酶 Enzymology 目录 教学目标 掌握酶的化学本质、结构与功能 掌握酶促反应的特点,理解酶促反应的机制 掌握酶促反应动力学的主要内容。 熟悉酶的调节。 掌握同工酶和酶原的基本概念及生理意义。 理解酶的命名与分类、酶与医学的关系 目录 12017/3/5 ? ? 酶的概念 酶的概念 ? ? ? ?酶 酶 酶 酶( (enm nzyme) )是一类由 是一类由 是一类由 是一类由活细胞 活细胞 活细胞 活细胞产生的 产生的 产生的 产生的、 、对 对 对 对 其底物具有高度 其底物具有高度特异性 特异性和高度催化效能 和高度催化效能的 的 蛋白质 蛋白质。 。 目录 ? ? 酶学研究简史 酶学研究简史 ?公元前两千多年,我国已有酿酒记载。 ? ?一百余年前 百余年前, ,Pasteur Pasteur认为发酵是酵母细胞生命活 认为发酵是酵母细胞生命活 动的结果。 ?1878年,Kühne首次提出Enzyme一词。 ?1897年,Eduard Buchner用不含细胞的酵母提取 液,实现了发酵。 ?1926年,Sumner首次从刀豆中提纯出脲酶结晶 (deoxyribozyme)。 目录 22017/3/5 ?1982年,Cech首次发现RNA也具有酶的催化活性, 提出核酶 提出核酶(ribozyme)的概念 的概念。 ?1995年,Jack W.Szostak研究室首先报道了具有 DNA连接酶活性DNA片段,称为脱氧核酶 (deoxyribozyme)。 目录 第一节 酶的分子结构与功能 The Molecular Structure and Function of f Enzyme 目录 32017/3/5 ? ? 酶的不同形式 酶的不同形式: : ?单体酶(monomeric enzyme):单一亚基构成的酶 。 ? ?寡聚酶 寡聚酶(oligomeric (oligomeric en enz zy yme) me): :由多个相同或不同亚基 由多个相同或不同亚基 以非共价键连接组成的酶。 ?多酶体系(multienzyme system):由几种不同功能的 酶彼此聚合形成多酶体系或称多酶复合物。 ?多功能酶( (multifunctional enzyy) me)或串联酶( (tandem enzyme):一些多酶体系在进化过程中由于基因的融 合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶 称为多功能酶。 目录 一、酶的分子组成中常含有 一、酶的分子组成中常含有辅助因子 辅助因子 ? ? 单纯酶 单纯酶 (simple enz (simple enzy yme) me): :仅含有蛋白质的酶 仅含有蛋白质的酶 称为单纯酶 称为单纯酶 称为单纯酶 称为单纯酶 ? 结合酶 (conjugated enzyme):由蛋白质部分 和非蛋白质部分共同组成的酶 蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme) 全酶 全酶 (holoenzyme) 小分子有机化合物 辅助因子 (cofactor) 金属离子 目录 42017/3/5 ? ? 全酶分子中各部分在催化反应中的作用 全酶分子中各部分在催化反应中的作用: : ?酶蛋白决定反应的特异性 ?辅助因子决定反应的种类与性质 目录 辅助因子分类 (按其与酶蛋白结合的紧密程度) 辅酶 (coenzyme): 与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的 方法除去。 辅基 (prosthetic group): 与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超 滤的方法除去。 目录 52017/3/5 ? 辅助因子多为小分子的有机化合物或金属离子。 ?作为辅助因子的有机化合物多为B族维生素 的衍生物或卟啉化合物 ?它们在酶促反应中主要参与传递电子、质子 ( (或基团 或基团) )或起运载体作用 或起运载体作用 目录 某些辅酶(辅基)在催化中的作用 小分子有机化合物(辅酶或辅基) 转移的基团 名 称 所含的维生素 + 氢原子(质子) NAD (烟酰胺腺嘌呤二核苷 烟酰胺(维生素PP)之一 酸 酸, ,辅酶 辅酶I I + NADP (烟酰胺腺嘌呤二核 烟酰胺(维生素PP)之一 苷酸磷酸,辅酶II FMN(黄素单核苷酸) 维生素B (核黄素) 2 FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸) 维生素B (核黄素) 2 醛基 TPP(焦磷酸硫胺素) 维生素B (硫胺素) 1 酰基 辅酶A(CoA) 泛酸 硫辛酸 硫辛酸 烷基 钴胺素辅酶类 维生素B 12 二氧化碳 生物素 生物素 氨基 磷酸吡哆醛 吡哆醛(维生素B 之一) 6 四氢叶酸 叶酸 甲基、甲烯基、甲炔基、 甲酰基等一碳单位 目录 62017/3/5 ? 金属离子是最多见的辅助因子 ? ?金属酶 金属酶( (metalloenz metalloenzy yme me) ) 金属离子与酶结合紧密,提取过程中不 易丢失。 ?金属激活酶(metal-activated enzyme) 金属离子为酶的活性所必需,但与酶的 结合不甚紧密。 目录 ?金属离子的作用: 参与催化反应,传递电子; 在酶与底物间起桥梁作用; 稳定酶的构象; 中和阴离子 中和阴离子,降低反应中的静电斥力等 降低反应中的静电斥力等。 目录 72017/3/5 某些金属酶和金属激活酶 金属酶 金属离子 金属激活酶 金属离子 2+ + 2+ Fe 过氧化氢酶 丙酮酸激酶 K 、 Mg g 2+ 2+ 2+ 过氧化物酶 Fe 丙酮酸羧化酶 Mn 、Zn 谷胱甘肽过氧化 2+ 2+ 2+ Se 蛋白激酶 Mg 、Mn 物酶 2+ 2+ 固氮酶 Mo 己糖激酶 Mg 核糖核苷酸还原 2+ 2+ Mn Mn 磷脂酶 磷脂酶C C Ca Ca 酶 2+ 2+ 羧基肽酶 Zn 细胞色素氧化酶 Cu 2+ 2+ 碳酸酐酶 Zn 脲酶 Ni 2+ + 碱性磷酸酶 Mg 柠檬酸合酶 K 目录 二、酶的活性中心是酶分子中执行 其催化功能的部位 ? 酶的活性中心 (active center) 酶的活性中心或活性部位(active site)是酶分子中能与底物特异地结合并催 化底物转变为产物的具有特定三维结构的区 域。 目录 82017/3/5 ? 必需基团(essential group) 酶分子中氨基酸残 酶分子中氨基酸残 基侧链的化学基团中, 一些与酶活性密切相关 的化学基团。 目录 底物 活性中心以外 的必需基团 的必需基团 催化基团 活性中心 结合基团 92017/3/5 ?活性中心内的必需基团 催化基团 催化基团 结合基团 结合基团 (catalytic group) ( (binding group) ) 催化底物转变成产物 与底物相结合 与底物相结合 ?活性中心外的必需基团 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有 的空间构象和(或)作为调节剂的结合部位所 必需。 目录 ? 溶菌酶的活性中心 ?溶菌酶的活性中 心是 心是一裂隙 裂隙, ,可 可 以容纳肽多糖的6 个单糖基(A,B, C,D,E,F), 并与之形成氢键 和van derwaals力。 ?催 催化基团是35位 Glu,52位Asp; ? 101位Asp和108位 Trp是结合基团。 目录 102017/3/5 三、同工酶催化相同的化学反应 三、同工酶催化相同的化学反应 ? ? 定义 定义 同工酶 (isoenzyme)是指催化相同的化 学反应,但酶蛋白的分子结构、理化性质 乃至免疫学性质不同的一组酶。 目录 ? 举例 1 H H H H H H H M M M H H H M M M M M M M LDH LDH LDH LDH LDH 1 2 3 4 5 (H ) (H M) (H M ) (HM ) (M ) 4 3 2 2 3 4 乳酸脱氢酶的同工酶 目录 112017/3/5 人体各组织器官LDH同工酶谱(活性%) 白细 LDH同工酶 红细胞 血清 骨骼肌 心肌 肺 肾 肝 脾 胞 43 12 27.1 0 73 14 43 2 10 LDH (H ) 1 4 LDH (H M) 44 49 34.7 0 24 34 44 4 25 2 3 LDH (H M ) 12 33 20.9 5 3 35 12 11 10 3 2 2 LDH (HM ) 1611.7160512720 4 3 LDH (M ) 0 0 5.7 79 0 12 0 56 5 5 4 目录 检测组织器官同工酶的变化有重要的临床意义 心肌梗死酶谱 酶 在代谢调节上起着 在代谢调节上起着 活 活 性 重要的作用; 用于解释发育过程 中阶段特有的代谢特征; 正常酶谱 同工酶谱的改变有 助于对疾病的诊断; 急性肝炎酶谱 同工酶可以作为遗 同工酶可以作为遗 传标志,用于遗传分析 研究。 1 2345 心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶谱的变化 目录 122017/3/5 ? 根据国际生化学会的建议,同工酶是由不同基 因编码的多肽链,或由同一基因转录生成的不 同mRNA所翻译的不同多肽链组成的蛋白质。 ? 同工酶存在于同一种属或同一个体的不同组织 或同一细胞的不同亚细胞结构中,它使不同的 组织、器官和不同的亚细胞结构具有不同的代 谢特征。这为同工酶用来诊断不同器官的疾病 提供了理论依据。 目录 ? 举例 2 B B B B M M M M M M B B CK (BB) CK (MB) CK (MM) 1 2 3 脑 心肌 骨骼肌 肌酸激酶 (creatine kinase, CK) 同工酶 CK 常作为临床早期诊断心肌梗死的一项生化指标 2 目录 132017/3/5 第二节 酶的工作原理 The The Mechanism Mechanism of of Enzyme Enzyme Action Action 目录 ? 酶与一般催化剂的共同点: ? 在反应前后没有质和量的变化; ? 只能催化热力学允许的化学反应; ? 只能加速可逆反应的进程,而不改变反 应的平衡点。 目录 142017/3/5 一、酶促反应的 一、酶促反应的特点 特点 (一)酶对底物具有极高的效率 8 20 ?酶的催化效率通常比非催化反应高10 ~10 倍, 7 13 比一般催化剂高10 ~10 倍。 ?酶的催化不需要较高的反应温度。 ? ?酶和 酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应 般催化剂加速反应的机理都是降低反应 的活化能(activation energy)。酶比一般催化剂 更有效地降低反应的活化能。 目录 某些酶与一般催化剂催化效率的比较 底物 催化剂 速率常数 反应温度 ( (℃ ℃) ) + -6 苯酰胺 H 52 2.4×10 - -6 OH 53 8.5×10 α-胰凝乳蛋白酶 25 14.9 + + -7 7 尿素 尿素 H 62 62 7.4×10 6 脲酶 21 5.0×10 2+ H O Fe 56 22 2 2 目录 152017/3/5 (二)酶对底物具有高度的特异性 ? 酶的特异性 (specificity) 一种酶仅作用于一种或一类化合物, 或一定的化学键,催化一定的化学反应并 生成一定的产物 生成一定的产物。酶的这种特性称为酶的 酶的这种特性称为酶的 特异性或专一性。 目录 ? 根据酶对底物选择的特点,酶的特异性可分 为两种类型 : 1.绝对专一性((p absolute specificity y)) 只能作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应, 生成一种特定结构的产物。如脲酶仅能催化尿素水解 生成CO 和NH 。 2 3 有些具有绝对专 有些具有绝对专一性的酶可以区分 性的酶可以区分光学异构体 光学异构体和 和立 立 体异构体,只能催化一种光学异构体或立体异构体进行 反应。例如乳酸脱氢酶仅催化L-乳酸脱氢生成丙酮酸, 而对D-乳酸无作用。 目录 162017/3/5 2.相对专一性(relative specificity) 有些酶对底物的专一性不是依据整个底物分子结构, 而是依据底物分子中的特定的化学键或特定的基团,因而 可以作用于含有相同化学键或化学基团的一类化合物 可以作用于含有相同化学键或化学基团的一类化合物。例 例 如,消化系统中的蛋白酶仅对蛋白质中肽键的氨基酸残基 种类有选择性,而对具体的底物蛋白质种类无严格要求 。 目录 (三)酶的活性与酶量具有可调节性 酶促反应受多种因素的调控,以适应机体 对不断变化的内外环境和生命活动的需要。 例: 磷酸果糖激酶-1的活性受AMP的别构激 活,而受ATP的别构抑制。 胰岛素诱导HMG-CoA还原酶的合成,而 胆固醇则阻遏该酶合成。 目录 172017/3/5 (四)酶具有不稳定性 酶的化学本质主要是蛋白质。在某些理化 因素(如高温、强酸、强碱等)的作用下,酶 会发生变性而失去催化活性。因此,酶促反应 往往都是在常温、常压和接近中性的条件下进 行的。 目录 二、酶通过促进底物形成过渡态而 二、酶通过促进底物形成过渡态而 提高反应速率( 提高反应速率(工作原理 工作原理) ) ( (一) )酶比 酶比一般催化剂更有效地 般催化剂更有效地降低反应活化能 降低反应活化能 酶和一般催化剂一样,加速反应的作 用都是通过降低反应的活化能 (activation energy) )实现的 实现的。 活化能:底物分子从基态转变到过渡 态所需的能量。 目录 182017/3/5 能 量 非催化反应活化能 一般 催化剂 催 酶 促反应 化 反应的 活化 能 活化 能 底物 反应总能量改变 产物 产物 反应过程 酶促反应活化能的改变 目录 (二)酶与底物结合形成中间产物 酶底物复合物 酶底物复合物 E + S E + P ES ( (过渡态 过渡态) ) 目录 192017/3/5 1. 诱导契合作用使酶与底物密切结合 ?酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相 互变形和相互适应,进而相互结合。这一过 程称为酶-底物结合的诱导契合(induced-fit) 。 目录 20肽模肽式模羧 2017/3/5 酶的诱导契合 底物 2. 邻近效应与定向排列使诸底物正确定位于酶的活 性中心 ?酶在反应中将诸底物结合到酶的活性中心,使它 们相互接近并形成有利于反应的正确定向关系。 ?这种邻近效应(proximity effect)与定向排列 (orientation arrange)实际上是将分子间的反应变 成类似于分子内的反应,从而提高反应速率。 目录 212017/3/5 ? 邻近效应与定向排列: 目录 3. 表面效应使底物分子去溶剂化 ? ?酶的活性中心多是酶分子内部的疏水 酶的活性中心多是酶分子内部的疏水“ “口袋 口袋” ”, 酶反应在此疏水环境中进行,使底物分子脱溶剂 化 (desolvation),排除周围大量水分子对酶和底 物分子中功能基团的干扰性吸引和排斥,防止水 化膜的形成,利于底物与酶分子的密切接触和结 合。这种现象称为表面效应(surface effect)。 目录 222017/3/5 胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和弹性蛋白酶活性中心“口袋” 目录 (三)酶的催化机制呈多元催化作用 1.酸 酸-碱催化作用 碱催化作用( (general acid-base catalysis) ) 2.亲核催化和亲电子催化作用 1)亲核催化作用(nucleophilic catalysis) 2) )共价催化作用 共价催化作用(covalent catalysis) 3)亲电催化(electrophilic catalysis) 目录 232017/3/5 胰凝乳蛋白酶的共价催化和酸-碱催化机制 目录 第三节 酶促反应动力学 Kinetics Kinetics of of Enzyme Enzyme- -Catalyzed Catalyzed Reaction Reaction 目录 242017/3/5 ? 酶促反应动力学:研究各种因素对酶促反应 速率的影响,并加以定量的阐述。 ? 影响因素包括:酶浓度、底物浓度、pH、温 度、抑制剂、激活剂等。 目录 一、底物浓度对反应速率影响的作图呈 矩形双曲线 在其他因素不变 的情况下,底物浓度 对反应速率的影响呈 矩形双曲线关系。 目录 252017/3/5 V V V V max max [S] [S] ?当底物浓度较低时: 反应速率与底物浓度成正比;反应为 一级反应。 V V V V max max [S] [S] ?随着底物浓度的增高: 反应速率不再成正比例加速;反应为 混合级反应。 262017/3/5 V V V V max max [S] [S] ? ?当底物浓度高达 当底物浓度高达一定程度 定程度: 反应速率不再增加,达最大速率;反 应为零级反应 (一)米-曼氏方程式揭示单底物反应的 (一)米-曼氏方程式揭示单底物反应的 动力学特性 动力学特性 ?解释酶促反应中底物浓度和反应速率关系的 最合理学说是中间产物学说: k 1 k 3 E+S E + S ES ES E+P E + P k 2 中间产物 目录 272017/3/5 ? 1913年Michaelis和Menten提出反应速率与底物 浓度关系的数学方程式,即米-曼氏方程式,简 称 称米氏方程式 米氏方程式 (Michaelis (Michaelis equation) equation)。 V [S] max = V ── K + [S] m [[] S]:底度 底物浓度 V:不同[S]时的反应速率 V :最大反应速率(maximum velocity) max K :米氏常数(Michaelis constant) m 目录 ? 研究前提: ① 在规定的反应条件下,酶促反应速率一般用 单位时间内底物的消耗量和产物的生成量来 单位时间内底物的消耗量和产物的生成量来 表示; ② 单底物、单产物反应; ③ 反应速率取其初速率; ④ 当底物浓度远远大于酶浓度时,在初速率范 围内,底物的消耗量很小(<5﹪),可以忽 略不计。 目录 282017/3/5 ?米-曼氏方程式推导基于两个假设: 1 1. E E与 与S S形成 形成ES ES复合物的反应是快速平衡反应 复合物的反应是快速平衡反应, 而ES分解为E及P的反应为慢反应,反应速率 取决于慢反应即V=k [ES]。 (1) 3 2. S的总浓度远远大于E的总浓度,因此在反应的 初始阶段,S的浓度可认为不变即[S] =[S ]。 t 目录 ? 米-曼氏方程式推导过程: ?当反应处于稳态时: ES ES的生成速率 的生成速率 = ES ES的分解速率 的分解速率 k1 ([Et]-[ES]) [S] = k2 [ES] + k3 [ES] k +k ([E ]-[ES])[S] 2 3 t 整理得: = (2) [ES] k 1 k +k 2 3 令: = K (米氏常数) m k 1 则(2)变为: ([E ]-[ES]) [S] = K [ES] t m 目录 292017/3/5 [E ][S] t (3) [ES] = ─── 整理得: K + [S] m k k [E [E ][S] ][S] 3 3 t t (4) 将(3)代入(1) 得 V = ──── K + [S] m 当底物浓度很高,将酶的活性中心全部饱和时, 即[E ] =[ES],反应达最大速率 t V = k [ES] = k [E ] (5) max 3 3 t V [S] max 将(5)代入(4)得米氏方程式: V = ──── K + [S] m 目录 (二)K 与V 是重要的酶促反应动力学参数 m m 1.Km值等于酶促反应速率为最大反应速率一半 时的底物浓度 时的底物浓度 当反应速率为最大反应速率一半时: 当反应速率为最大反应速率一半时: V V V [S] V V V max max max max = 2 K + [S] m V V /2 /2 max max K = [S] m K K [S] [S] m m 目录 302017/3/5 2.Km值是酶的特征性常数 Km值的大小并非固定不变,它与酶的结 构、底物结构、反应环境的pH、温度和离子 强度有关,而与酶浓度无关。酶的Km值多在 -6 -2 10 ~10 mol/L的范围 范围。 目录 某些酶对其底物的K m 酶底物 K (mol/L) m ?4 己糖激酶(脑) ATP 4 ? 10 ?5 D-葡萄糖 5 ? 10 ?3 D-果糖 1.5 ? 10 ? ?2 碳酸酐酶 HCO 2.6 ? 10 3 ?1 胰凝乳蛋白酶 甘氨酰酪氨酰甘氨酸 1.08 ? 10 ?3 N-苯甲酰酪氨酰胺 2.5 ? 10 ?3 ?-半乳糖苷酶 D-乳糖 4.0 ? 10 ?2 过氧化氢酶 H O 2.5 ? 10 2 2 ?3 溶菌酶 己-N-乙酰氨基葡糖 6.0 ? 10 目录 312017/3/5 3.Km在一定条件下可表示酶对底物的亲和力 K Km越大 越大,表示酶对底物的亲和力越小 表示酶对底物的亲和力越小; Km越小,酶对底物的亲和力越大。 4.Vmax是酶被底物完全饱和时的反应速率 当所有的酶均与底物形成 当所有的酶均与底物形成ES ES时 时( (即 即[ES] [ES] = [Et]),反应速率达到最大,即Vmax = k3 [Et]。 目录 5.酶的转换数 当酶被底物完全饱和时(Vmax),单位 时间内每个酶分子(或活性中心)催化底物转 变成产物的分子数称为酶的转换数(turnover -1 number),单位 单位是s 。 酶的转换数可用来表示酶的催化效率。 目录 322017/3/5 (三)Km值与Vmax常通过林-贝氏作图法求取 1. 双倒数作图法(double reciprocal plot),又称为 林 林-贝氏 贝氏(Linew (Lineweaver eaver- Burk) Burk)作图法 作图法 V V [S] [S] max max 1/ 1/V V V = V = K K +[S] +[S] m m 两边同取倒数 两边同取倒数 1/V 1/V 1/V 1/V ma ma ma max x x x K K m m 1/V= 1/V= 1/V 1/V + + 1/[S] 1/[S] max max 1/ 1/[S] [S] -1/K m V V max max (林-贝氏方程) 目录 2. Hanes作图法 在林-贝氏方程基础上,两边同乘 在林-贝氏方程基础上,两边同乘[S] [S] [S]/V [S]/V 1/V 1/V max max [S]/V= [S]/V=K K /V /V + [S]/V + [S]/V m m max max max max K K /V /V m m m m m m m m [S] [S] -K m 目录 332017/3/5 二、底物足够时 二、底物足够时酶浓度 酶浓度对反应速率的 对反应速率的 影响呈直线关系 影响呈直线关系 ?在酶促反应系统中,当底物浓度大大超过酶的 浓度,酶被底物饱和时,反应速率达最大速率。 此时,反应速率和酶浓度变化呈正比关系。 目录 V ? ?当 当[S] [S]>> >>[E] [E],酶可被 酶可被 底物饱和的情况下,反 应速率与酶浓度成正比。 0 [E] ? ?关系式为 关系式为: :V V = k3 k3 [E] [E] 当[S]>>[E]时,V = k [E] max 3 酶浓度对反应速率的影响 目录 342017/3/5 三、 三、温度 温度对酶促反应速率的影响具有 对酶促反应速率的影响具有 双重性 双重性 ?温度对酶促反应速率具有双重影响。 ?酶促反应速率最快时反应体系的温度称为酶 促反应的最适温度(optimum temperature)。 目录 ? 温度对酶活 性的影响 目录 352017/3/5 ?酶的最适温度不是酶的特征性常数,它与反 应进行的时间有关。 ?酶的活性虽然随温度的下降而降低,但低温 一般不使酶破坏。温度回升后,酶又恢复其 活性。 目录 四、pH通过改变酶和底物分子解离状态 影响酶促反应速率 ? ?酶催化活性最高时反应体系的 酶催化活性最高时反应体系的pH pH称为酶促反应 称为酶促反应 的最适pH (optimum pH)。 ? pH对某些酶 活性的影响 活性的影响 目录 362017/3/5 ? ?最适 最适pH pH不是酶的特征性常数 不是酶的特征性常数,它受底物浓 它受底物浓 度、缓冲液种类与浓度、以及酶纯度等因 素的影响。 目录 五、抑制剂可降低酶促反应速率 ? 酶的抑制剂(inhibitor) 凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白 变性的物质称为酶的抑制剂。 ? 酶的抑制区别于酶的变性 酶的抑制区别于酶的变性: ? 抑制剂对酶有一定选择性 ? 引起变性的因素对酶没有选择性 目录 372017/3/5 ? 抑制作用的类型 根据抑制剂和酶结合的紧密程度不同, 酶的抑制作用分为 酶的抑制作用分为: : ?不可逆性抑制 (irreversible inhibition) ?可逆性抑制 (reversible inhibition) ?竞争性抑制 竞争性抑制(p (competitive inhibition) ) ?非竞争性抑制 (non-competitive inhibition) ?反竞争性抑制 (uncompetitive inhibition) 目录 (一)不可逆性抑制剂与酶共价结合 (一)不可逆性抑制剂与酶共价结合 ? ? 概念 概念 抑制剂通常以共价键与酶活性中心的 必需基团相结合,使酶失活。此类抑制剂 不能用透析、超滤等方法予以去除。 ? 举例 有机磷化合物 有机磷化合物 ? ? 羟基酶 羟基酶 解毒 -- -- -- 解磷定(PAM) 重金属离子及砷化合物 ?? 巯基酶 解毒 -- -- -- 二巯基丙醇(BAL) 目录 382017/3/5 有机磷化合物 有机磷化合物 如:敌百虫、 如:敌百虫、敌敌畏 敌敌畏、 、乐果和马拉硫磷等 乐果和马拉硫磷等 O RO O RO HX HO E + P + P R'' O X R'' O O E 有机磷化合物 羟基酶 失活的酶 酸 胆碱酯酶 解毒剂 如:解磷定(碘化醛肟甲基吡啶,PAM) 阿托品 2017 2017年 年3 3月 月5 5日 日10 10时 时30 30分 分 目录 低浓度重金属离子和砷化合物 低浓度重金属离子和砷化合物 如 如 如 如: :路易斯气 路易斯气 路易斯气 路易斯气 Cl SH S As CH CHCl As CH CHCl 2HCl + E E + SH S Cl 路易士气 巯基酶 失活的酶 酸 路易斯气与糜烂性毒剂 路易斯气与糜烂性毒剂 CH SH CH S 2 2 S SH As CH CHCl CH E CH E As CH CHCl SH S + + SH S CH CH OH 2 OH 2 失活的酶 BAL 巯基酶 BAL 与砷剂结合物 2017 2017年 年3 3月 月5 5日 日10 10时 时30 30分 分 目录 392017/3/5 (二) (二) 可逆性抑制剂与酶非共价结合 可逆性抑制剂与酶非共价结合 ? 概念 抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物 复合物可逆性结合,使酶的活性降低或消失; 抑制剂可用透析、超滤等方法除去。 ? 类型 ?竞争性抑制 ?非竞争性抑制 ?反竞争性抑制 目录 1. 1.竞争性抑制剂与底物竞争结合酶的活性中心 竞争性抑制剂与底物竞争结合酶的活性中心 抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞 争酶的活性中心,从而阻碍酶与底物形成中 间产物 ,这种抑制作用称为竞争性抑制作 用 用。 目录 402017/3/5 E + S E + S ES ES E + P E + P ? 反应模式 + I I I I S S E EI I ES ES E P ++ EI E I + 目录 ? 特点 V[S] max V ? [I] K(1 ? ) ?[S] m K ?I与S结构类似,竞 i 争酶的活性中心 争酶的活性中心; ; K 1 [I] 1 1 m ?? (1 )? VV K[S]V i max max ?抑制程度取决于 抑制剂与酶的相 1/V 抑制剂↑ 对亲和力及底物 浓度 浓度; ; 无抑制剂 ?动力学特点: V 不变,表观 max K 增大。 m 1/[S] 目录 412017/3/5 ? 举例 ?丙二酸与琥珀酸竞争琥珀酸脱氢酶 琥珀酸脱氢酶 琥珀酸 延胡索酸 FAD FADH 2 COOH CH COOH 2 CH CH 2 2 COOH COOH 丙二酸 目录 ?磺胺类药物的抑菌机制 ——与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶 二氢蝶呤啶 + 对氨基苯甲酸 + 谷氨酸 H N COOH 二氢叶酸 2 合成酶 H N SO NHR 2 2 二氢叶酸 磺胺类药物 目录 422017/3/5 2.非竞争性抑制剂结合活性中心之外的调节位点 2.非竞争性抑制剂结合活性中心之外的调节位点 有些抑制剂与酶活性中心外的必需基团相 结合,不影响酶与底物的结合,酶和底物的结 合也不影响酶与抑制剂的结合。底物和抑制剂 之间无竞争关系。但酶-底物-抑制剂复合物 (ESI)不能进一步释放出产物。这种抑制作用 称作非竞争性抑制作用。 目录 E+S E+S ES ES E+P E+P + + + + ? 反应模式 I I I I E EI I+S +S E EI IS S + S ES P E E + - S S + S ESI EI - S 目录 432017/3/5 ? 特点 K ?抑制剂与酶活性中 1 [I] 1 1 [I] m ?? (1 )? (1? ) VV K[S]V K ii 心外的必需基团结 max max 合 合,底物与抑制剂 底物与抑制剂 之间无竞争关系; 抑制剂 ↑ 1 / V ?抑制程度取决于抑 制剂的浓度; 无抑制剂 无抑制剂 ?动力学特点: V 降低,表观 max 1/[S] K 不变。 m 目录 3.反竞争性抑制剂的结合位点由底物诱导产生 ? 定义 抑制剂仅与酶和底物形成的中间产物(ES) 结合,使中间产物ES的量下降。这样,既减少 从中间产物转化为产物的量,也同时减少从中 间产物解离出游离酶和底物的量。这种抑制作 用称为反竞争性抑制作用。 目录 442017/3/5 E+S E+S ES ES E+P E+P ? 反应模式 + + I I I I ES ES ES ESI I I I E S + ES E + P ESI 目录 ? 特点: ?抑制剂只与酶-底 ? 物复合物结合; ?抑制程度取决与 1/V 抑制剂 ↑ 抑制剂的浓度及 底物的浓度; 无抑制剂 无抑制剂 ?动力学特点: V 降低,表观 max 1/[S] K 降低。 m 目录 452017/3/5 各种可逆性抑制作用的比较 作用特征 无抑制剂 竞争性抑制 非竞争性抑制 反竞争性抑制 与I结合的组分 E E、ES ES 动力学参数 表观Km K 增大 不变 减小 m 最大速度 V 不变 降低 降低 max 林 林-贝 贝氏作图 氏作图 斜率 K /V 增大 增大 不变 m max 纵轴截距 1/V 不变 增大 增大 max 横轴截距 -1/K 增大 不变 减小 m 目录 六、激活剂可提高酶促反应速率 ? 定义 定义 使酶由无活性变为有活性或使酶活性 增加的物质称为激活剂(activator)。 ? 种类 ? ?必需激活剂 必需激活剂 (essential activator) (essential activator) ? ?非必需激活剂 非必需激活剂 (non- (non-essential activator) essential activator) 目录 462017/3/5 第四节 第四节 酶的调节 Th The R Regul lati ion of f E Enzyme 目录 ? 调节对象:关键酶 ? 调节方式 ? ?酶活性的调节(快速调节) 酶活性的调节(快速调节) ? ?酶含量的调节(缓慢调节) 酶含量的调节(缓慢调节) 目录 472017/3/5 一、酶活性的调节是对酶促反应速 率的快速调节 (一)别构效应剂通过改变酶的构象而调节酶活性 (一)别构效应剂通过改变酶的构象而调节酶活性 ? 别构调节 别构调节 (allosteric regulation) 一些代谢物可与某些酶分子活性中心外的 某部分可逆地结合,使酶构象改变,从而改变 酶的催化活性,此种调节方式称别构调节。 ? 别构酶 (allosteric enzyme) ? 别构部位 (allosteric site) 别构激活剂 ? 别构效应剂 (allosteric effector) 别构抑制剂 目录 ? 别构酶常为多个亚基构成的寡聚体,具有协同效应。 别构激活 别构激活 V V 无别构效应剂 无别构效应剂 别构抑制 别构抑制 [S] [S] 别构酶的S形曲线 别构酶的S形曲线 酶的别构调节是体内代谢途径的重要快速 调节方式之一。 目录 482017/3/5 (二)酶的化学修饰调节是通过某些化学基团 (二)酶的化学修饰调节是通过某些化学基团 与酶的共价结合与分离实现的 与酶的共价结合与分离实现的 ? 共价修饰(covalent modification) 酶蛋白肽链上的一些基团可在其他酶的催化 下,与某些化学基团共价结合,同时又可在另一种 酶的催化下,去掉已结合的化学基团,从而影响酶 的活性,酶的这种调节方式称为酶的共价修饰或称 酶的化学修饰(chemical modification)调节。 目录 ? 常见类型 ? ?磷酸化与脱磷酸化 磷酸化与脱磷酸化( (最常见 最常见) ) ? ?乙酰化和脱乙酰化 乙酰化和脱乙酰化 ? ?甲基化和脱甲基化 甲基化和脱甲基化 ? ?腺苷化和脱腺苷化 腺苷化和脱腺苷化 ? ? ? ?- -SH SH SH SH与 与 与 与- -SSSS- -SSSS互变 互变 互变 互变 酶的化学修饰是体内快速调节的另一种重要方式。 目录 492017/3/5 ATP ADP 蛋白激酶 Thr Thr Th Thr Ser -OH 2- Ser -O-PO 3 Tyr Tyr 磷蛋白磷酸酶 酶蛋白 酶蛋白 Pi H O 2 酶的磷酸化与脱磷酸化 目录 (三)酶原需要通过激活过程才能产生有活 (三)酶原需要通过激活过程才能产生有活 性的酶 性的酶 ? 酶原 (zymogen) 有些酶在细胞内合成或初分泌、或在其 有些酶在细胞内合成或初分泌、或在其 发挥催化功能前处于无活性状态,这种无活 发挥催化功能前处于无活性状态,这种无活 性的酶前体称为酶原。 性的酶前体称为酶原。 ? 酶原的激活 在一定条件下,酶原向有活性酶转化的过程。 在一定条件下,酶原向有活性酶转化的过程。 目录 502017/3/5 ? 酶原激活的机理 酶原 在特定条件下 在特定条件下 一个或几个特定的肽键断裂,水解 掉一个或几个短肽 分子构象发生改变 分子构象发生改变 形成或暴露出酶的活性中心 目录 512017/3/5 某些酶原的激活需水解掉一个或几个肽段 酶原 激活因素 激活形式 激活部位 + 胃蛋白酶原 H 或胃蛋 胃蛋白酶+六肽 胃腔 白酶 胰凝乳蛋白酶原 胰蛋白酶 胰凝乳蛋白酶+两个二肽 小肠腔 弹性蛋白酶原 胰蛋白酶 弹性蛋白酶+几个肽段 小肠腔 羧基肽酶原A 胰蛋白酶 羧基肽酶A+几个肽段 小肠腔 目录 ? 酶原激活的生理意义 避免细胞产 避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化 的酶对细胞进行自身消化, 并使酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证 体内代谢正常进行。 有的酶原可以视为酶的储存形式。在需要 时 时,酶原适时地转变成有活性的酶 酶原适时地转变成有活性的酶,发挥其催 发挥其催 化作用。 目录 522017/3/5 二、 酶含量的调节是对酶促反应速率的 缓慢调节 (一)酶蛋白合成可被诱导或阻遏 ?诱导作用(induction) :在转录水平上能促进酶合 成的物质称之为诱导物(inducer),诱导物诱发酶蛋 白合成的作用称为诱导作用。 ? ?阻遏作用 阻遏作用(i (repression)) :在转录水平上能减少酶蛋 在转录水平上能减少酶蛋 白合成的物质称为辅阻遏物(co-repressor),辅阻遏 物与无活性的阻遏蛋白结合而影响基因的转录,这种 作用称为阻遏作用。 目录 (二)酶降解与一般蛋白质降解途径相同 (二)酶降解与一般蛋白质降解途径相同 ?溶酶体蛋白酶降解途径(不依赖ATP的降 解途径) ?非溶酶体蛋白酶降解途径(又称依赖ATP 和泛素的降解途径) 目录 532017/3/5 第五节 酶的命名与分类(自学) The Naming and Classification of Enzyme 目录 自学提纲 自学提纲 1. 1.举例说明酶的分类和命名; 举例说明酶的分类和命名; 2. 2.何谓酶的系统名称? 何谓酶的系统名称? 3. 3.何谓酶的推荐名称? 何谓酶的推荐名称? 目录 542017/3/5 一、酶可根据其催化的反应类型予以分类 一、酶可根据其催化的反应类型予以分类 ? 根据酶反应的类型,酶可分为六大类, 其排序如下 其排序如下: : 1. 氧化还原酶类 (oxidoreductases) 2. 转移酶类 (transferases ) 3. 水解酶类 (hydrolases) 4. 裂解酶类 (lyases) 5. 异构酶类 (isomerases) 6. 合成酶类 (synthetases, ligases) 目录 二、每一种酶均有其系统名称和推荐名称 二、每一种酶均有其系统名称和推荐名称 ? ?系统名称 系统名称 (systematic name) (systematic name) ? ?推荐名称 推荐名称 (recommended name) (recommended name) 目录 552017/3/5 一些酶的分类与命名 EC编 催化的化学 推荐名 酶的分类 系统名称 反应举例 号 称 + 氧化还原酶 氧化还原酶 乙醛 乙醛 + + NADH NADH + + 乙醇 乙醇: :NAD NAD 氧化还原 氧化还原 EC EC 乙醇脱氢 乙醇脱氢 + 类 H 酶 1.1.1.1 酶 草酰乙酸 +L-谷 L-天冬氨酸: ?-酮戊二 EC 天冬氨酸 转移酶类 氨酸 酸 氨基转移酶 2.6.1.1 转氨酶 D-葡萄糖 + EC 葡糖6-磷 水解酶类 D-葡糖-6-磷酸水解酶 H PO 3.1.3.9 酸酶 3 4 磷酸二羟丙酮 + EC 裂解酶类 裂解酶类 酮糖 酮糖-1-磷酸裂解 磷酸裂解酶 酶 醛缩酶 醛缩酶 醛 醛 4127 4.1.2.7 D-葡糖-6-磷酸 酮-醇异 EC 磷酸果糖 异构酶类 D-果糖-6-磷酸 构酶 5.3.1.9 异构酶 L-谷氨酰胺 + EC 谷氨酰胺 连接酶类 L-谷氨酸:氨连接酶 ADP + 磷酸 6.3.1.2 合成酶 目录 第六节 第六节 酶与医学的关系(自学) The Relation of Enzyme and Medicine 目录 562017/3/5 自学提纲 自学提纲 1. 1.举例说明酶质和量的异常与疾病的关系。 举例说明酶质和量的异常与疾病的关系。 2. 2.举例说明酶作为疾病诊断指标的作用机制。 举例说明酶作为疾病诊断指标的作用机制。 3. 3.举例说明用于药物治疗的酶。 举例说明用于药物治疗的酶。 4. 4.何谓指示酶?何谓辅助酶? 何谓指示酶?何谓辅助酶? 5. 5.何谓标记酶? 何谓标记酶? 6. 6.举例说明基因工程中常用的工具酶。 举例说明基因工程中常用的工具酶。 目录 一、酶与疾病的发生、诊断及治疗密切相关 (一)许多疾病与酶的质和量的异常相关 1.酶的先天性缺陷是先天性疾病的重要病因之一 现已发现140多种先天性代谢缺陷中,多 数由酶的先天性或遗传性缺损所致;例如酪氨 酸酶缺乏引起白化病。 2.一些疾病可引起酶活性或量的异常 许多疾病引起酶的异常,这种异常又使病 情加重;例如急性胰腺炎时,胰蛋白酶原在胰 腺中被激活,造成胰腺组织被水解破坏。 目录 572017/3/5 (二)体液中酶活性的改变可作为疾病的诊断 (二)体液中酶活性的改变可作为疾病的诊断 指标 指标 组织器官损伤可使其组织特异性的酶释放入 血,有助于对组织器官疾病的诊断。如急性肝炎 时血清丙氨酸转氨酶活性升高;急性胰腺炎时血、 尿淀粉酶活性升高等等。因此,血清中酶的增多 或减少可用于辅助诊断和预后判断 。 目录 (三)某些酶可作为药物用于疾病的治疗 (三)某些酶可作为药物用于疾病的治疗 1.有些酶作为助消化的药物 2.有些酶用于清洁伤口和抗炎 3.有些酶具有溶解血栓的疗效 目录 582017/3/5 (四)药物可通过抑制体内的某些酶来达到治 (四)药物可通过抑制体内的某些酶来达到治 疗目的 疗目的 磺胺类药物是细菌二氢叶酸合成酶的竞争性抑 磺胺类药物是细菌二氢叶酸合成酶的竞争性抑 制剂;氯霉素可抑制某些细菌转肽酶的活性从而抑 制其蛋白质的合成;抗抑郁药通过抑制单胺氧化酶 而减少儿茶酚胺的灭活,治疗抑郁症;洛伐他汀通 过竞争性抑制 过竞争性抑制HMG G-Co CoA还原酶的活性 还原酶的活性。甲氨蝶呤 甲氨蝶呤、 、 5-氟尿嘧啶、6-巯基嘌呤等用于治疗肿瘤也是因为 它们都是核苷酸合成途径中相关酶的竞争性抑制剂。 目录 二、酶作为试剂用于临床检验和科学研究 (一)有些酶可作为酶偶联测定法中的指示酶或辅助酶 (二)有些酶可作为酶标记测定法中的标记酶 ( (三 三) )多种酶成为基因工程常用的工具酶 多种酶成为基因工程常用的工具酶 目录 59 |
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