大家好,今天介绍的一篇题为题为“Establishment and validation of a carbohydrate metabolism- related gene signature for prognostic model and immune response in acute myeloid leukemia”(建立和验证糖代谢相关基因特征用于急性骨髓性白血病的预后模型和免疫反应),急性髓系白血病(AML)患者治疗反应的异质性对风险评分和治疗分层提出了巨大挑战。碳水化合物代谢在 AML 治疗反应中起着至关重要的作用。在这项多队列研究中,我们研究了碳水化合物代谢相关基因(CRG)是否可以改善AML患者的预后分类并预测免疫反应和治疗。 01 研究背景 急性髓系白血病(AML)是一种高度遗传、表观遗传和临床异质性疾病,其特征是未分化髓系前体的克隆扩增,导致造血受损和骨髓衰竭。 AML在中年和老年人中更常见,诊断时的中位年龄为68岁。AML的标准治愈性治疗包括单独化疗和异基因干细胞移植联合化疗。35 岁以下 AML 患者的长期生存概率约为 40%-60%,5 岁以上患者的长期生存概率为 15%-60%。复发在大多数老年AML患者中很常见。 AML的发生、发展和预后复杂,需要不断探索。癌细胞的长期存活和持续增殖是癌症发展的前提。为了满足日益增长的生物能量和生物合成对生存和增殖的需求,癌细胞通过各种代谢途径自主调节代谢物的通量,包括脂肪酸代谢、氨基酸代谢和碳水化合物代谢 。 见图一 研究流程图。 ![]() 图一 (A)鉴别急性髓细胞白血病中与OS相关的CRG。 (B)联合方法用于建立强有力的CRG特征预后。 (C)CRG特征的预后价值在不同的队列中得到验证。 (D)危险组的临床特征和应用。最小绝对收缩和选择算子。 见图二 训练集中 CRG 特征的预后分析。 ![]() 图二 (A)与操作系统有关的CRG的风险比。 (B)基于患者风险评分的风险群体。 (C)患者的生存状态及其风险评分。 (D)10种模式CRG在高危和低危人群中的表达。选择P值小于0.01的CRG。 见图三 CRG信号预测急性髓细胞白血病患者OS的评价。 ![]() 图三 (A)危险组患者OS存活的Kaplan-Meier曲线。 (B)CRG签名1,3和5年的AUC曲线。 (C)风险评分和临床参数的单变量Cox回归分析。 (D)风险评分和年龄的多变量Cox回归分析。 (E)开发CRG特征临床病理列线图,通过纳入风险评分和年龄来预测AML患者的OS。 见图四 CRG签名的验证。 ![]() 图四 (A-C,G-I)GEO队列和我们队列中CRG签名的Kaplan-Meier曲线。 (D-F)在GEO队列中1年,3年和5年的CRG签名的ROC曲线。 (J,K) GEO队列中1年,2年和3年的CRG签名的ROC曲线。 (L)我们研究队列中1年及2年CRG特征的ROC曲线。 见图五 高危和低危人群差异表达基因(DEGs)。 ![]() 图五 (A)DEG火山图。 (B)发电机组的热图。 (C)显著丰富的学位教育专业术语。 (D,E)显著富集的二甘醇途径。 见图六 风险组的免疫细胞比例和相关性分析。 ![]() 图六 (公元至日)基质评分、免疫评分、估计评分和肿瘤纯度为风险组。 (E)高危和低危人群免疫细胞的相对比例。 (F)箱线图说明了TCGA队列中的22个免疫细胞比例。 (G)箱线图说明了高危和低风险组之间的22种免疫细胞比例。统计学显著性在 ∗< 0.05 的水平。 (H)高低高危和低危人群患者的免疫细胞热图。仅保留所有样本中非零比例超过一半的免疫细胞。 (I)风险人群免疫细胞之间的相关性。 见图七 不同风险组的突变特征。 ![]() 图七 (A)AML患者的基因突变。 (B)低危人群基因突变。 (C)高危人群基因突变。 (D)高危人群和低危人群之间的肿瘤突变负担。 见图八 风险组(A-D)碳水化合物代谢抑制剂的潜在药物的结果。 ![]() 图八 IC50表示半个最大抑制浓度。 02 研究结论 高危组的总生存期(OS)明显较短。与低风险组相比,在高风险组中鉴定出差异表达基因(DEG)。GO和GSEA分析表明,DEGs主要参与免疫应答信号通路。肿瘤浸润免疫细胞分析证实,高危人群免疫微环境受到强烈抑制。风险组潜在药物的结果表明,碳水化合物代谢抑制剂是有效的。 |
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