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斯德哥尔摩大学研究人员开发首个在单个细胞中研究微小RNA活性的方法 微小RNA是调控基因表达的小分子,通过与基因产生的RNA结合并将其破坏,从而抑制基因表达。估计超过60%的人类基因受微小RNA调控,因此这些小分子参与许多生物过程,包括癌症等疾病。
要揭示微小RNA的功能,必须找到它确切作用的RNA目标。目前存在的方法需要大量材料,通常需数百万个细胞,才能奏效。 现在,斯德哥尔摩大学和SciLifeLab的研究人员开发出一种新方法,可以在单个细胞水平检测微小RNA的目标。这些细胞每个约一百分之一毫米大小,重量不到十亿克,是生物体的基本组成单位。 利用这种灵敏的新方法,研究人员可以在细胞周期或红细胞分化等生物过程中,跟踪数千个RNA上的微小RNA作用。研究发现,在这些过程中,微小RNA在每个细胞中执行的任务出人意料地各不相同。未来,这种方法还可以应用于整个组织的研究,找出组成复杂器官(如大脑)的许多细胞类型中的准确变化。 斯德哥尔摩大学副教授Marc Friedländer表示:“我们团队的研究目标是要在单个细胞水平理解和最终建立基因调控的数学模型。我们的新方法是实现这一目标的重大进步。” 这项工作由Inna Biryukova博士领导,她在实验方法的开发中发挥关键作用;Vaishnovi Sekar博士生则完成大量高级计算分析工作。 Vaishnovi Sekar说:“就计算复杂性而言,这是未知领域,我们缺乏参考点和阈值。我们不得不探索大量方法,才能设计出不仅奏效,而且产生有意义生物学观察结果的方法。” 该研究发表在《自然生物技术》杂志上。 More information: Inna Biryukova et al, Detection of transcriptome-wide microRNA–target interactions in single cells with agoTRIBE, Nature Biotechnology (2023). DOI: 10.1038/s41587-023-01951-0. www.nature.com/articles/s41587-023-01951-0 【免责声明】图文来自网络，版权属于原作者，如有侵权或非授权发布之嫌，请联系我们，我们将及时更正、删除。转载目的在于促进信息交流，并不代表本公众号赞同其观点或对其内容真实性负责。欢迎关注PaperRSS公众号，每天都在更新。 |
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