Nature Reviews Microbiology | 肠道 “菌群地理”

加拿大University of British Columbia Carolina
Tropini和Giselle McCallum近日在nature
reviews microbiology发表综述，总结了近来随着技术的进步，人们对肠道菌群的不同尺度的异质性、互作及其与宿主环境因素关联的进一步了解，并指出了系统综合的
“菌群地理” 研究对理解菌群在正常生理与疾病情况下与宿主互作的重要性(1)。

作者们主要分纵向，也就是随着整个消化道，以及横向，也就是从上皮到黏液层再到消化腔，总结了伴随环境条件改变的肠道菌群代表性微生物、多样性及其互作的变化。并进一步讲述了伴随肠炎与结直肠癌肠道微生物组成分布特征与所在环境（比如黏液层、肿瘤位点等）的改变(1)。

不同尺度的菌群异质性，以及随消化道纵向环境特征与代表细菌的变化(1)。

随消化道横向解析“菌群地理”(1)。

肠炎时肠道黏液层与菌群的变化(1)。

该项工作2023年9月22日发表在nature reviews microbiology(1)。

Comment(s):

视角大总结比较全面的综述；并且在分析菌群异质与多样性的时候时刻考虑数据采集与分析方法潜在带来的偏差。

期待后续该领域总结更多通用的规律和因果关联。

通讯作者简介：

https://scholar.google.com/citations?user=_V-I0aMAAAAJ

参考文献：

1.  G. Mccallum, C. Tropini, The gut microbiota and its biogeography. Nat. Rev. Microbiol., 1–14.

原文链接：

https://www./articles/s41579-023-00969-0