【原】抢发150种皮肤菌群孟德尔随机化

大家都知道肠道菌群可以用来做孟德尔随机化，而且已经发了几百篇SCI，除了肠道菌群以外，皮肤菌群也是可以用来做孟德尔随机化的，而且皮肤菌群与很多疾病都是相关联的，目前还没有什么孟德尔随机化文章出来，特别适合抢发。同样是菌群数据，肠道菌群已经发了几百篇孟德尔随机化文章，而皮肤菌群还是空白的，现在来说，谁的机会更大，这个就不用多说了吧。

这150种皮肤菌群数据来源于这一篇文章，文献也给出了下载的链接，可以轻松下载这些数据：

不过，上天总是将抢发机会留给动手能力、有耐心的或者有经济实力的人，这些数据下载以后是不能直接用的，因为里面没有具体SNP ID，需要自己动手转换，转换ID是一件非常痛苦的事情，需要漫长的等待，少则几天时间，有时候甚至几十天。

转换ID需要一定的编程能力，同时需要强悍的电脑，快的话估计要3天多，慢的话估计要十几天，相当于至少要浪费3天时间在转换ID上：

需要一定的编程能力，同时对电脑配置要求比较高

普通电脑：直接卡死

好一点的电脑：转好一个文件（2小时），一共需要300小时（12.5天）

高端电脑：转好一个文件（1小时），一共需要150小时（6.25天）

大型服务器：转好一个文件（半小时），一共需要169小时（3.125天）

转好了ID，剩下的事情都是非常简单的，批量过滤好数据，就可以直接分析了，整理一下结果就可以发文章了：

这种数据对小白不够友好，因为没有SNP ID，导致很多人没有办法做分析，因为自己的电脑实在转不动，自己不会处理的话或者转不动的话，最好的办法就是用别人转换好的数据，直接分析，大大节省人力物力。

本文只分享数据来源和分析思路，剩下的细节问题需要大家自行摸索。