文章概述文章标题：《Mapping the Single Cell Transcriptomic Response of Murine Diabetic Kidney Disease to Therapies》  发表日期和杂志：2022年发表在Cell Metabolism上 在线阅读链接：https:///10.1016/j.cmet.2022.05.010 前情回顾在上一期推文小鼠糖尿病肾病(DKD)的单细胞转录组图谱-1中 整理了文章的部分内容，主要是：
也基于文献中使用plot1cell可视化UMAP结果的分析，使用胃癌数据进行了可视化：plot1cell美化UMAP/TSNE结果 这期一起来看看文章别的分析结果：差异分析探究肾细胞对DKD的反应比较了2天和2周对照小鼠(db/m)与db/db、db/db +肾aav的snRNA-seq谱，分别鉴定出2422、2683和3143个独特的差异表达基因(FDR<0.05, log fold change > 0.5) 所有细胞类型都表现出了基因表达的变化，但差异表达基因的数量在不同细胞类型间差异显著。 
在糖尿病肾病（DKD）中，超过一半的差异表达基因仅在单一细胞类型中表达，这突出了糖尿病对细胞特异性和异质性反应的影响  识别了跨时间点上调和下调的细胞特异性基因，可能为疾病生物标志物的发现提供线索。 
通过使用MAGMA工具使用全基因组关联研究（GWAS），识别慢性肾病（CKD）相关常见变异是否也与特定肾脏细胞类型相关。
DKD治疗的细胞特异性反应不同细胞类型对同一治疗方案的反应各异，这些反应在治疗的第2天和第14天都有所不同。评估了治疗在两个时间点对疾病引起的基因表达变化（上调或下调）的修复百分比 某些细胞类型在第2天的治疗中有较高比例的疾病基因得到修复，如足细胞、集合管细胞（DCT）和连接小管细胞（CNT），第14天，TAL和远端小管（DTL）的疾病基因修复更多。 罗格列酮在第2周治疗时对PEC、TAL、主细胞（PC）和内髓集合管细胞（ICA）有最大的治疗效果。 细胞通讯模式的变化使用CellChat工具分析了糖尿病肾病（DKD）以及不同治疗方案对肾脏细胞间通讯模式的影响和变化
药物引起的肾小球反应通过使用来自最近研究的肾小球单细胞RNA测序图谱的标记基因，区分和识别不同类型的肾小球细胞，包括足细胞（Pod）、系膜细胞（MC）、肾小球内皮细胞（GEC）和远曲小管细胞（PEC） 通过显微镜下切割和bulk RNA-seq分析，研究了人类健康和糖尿病肾小球的基因表达。
使用CellChat工具分析，发现糖尿病进展期间从肾小球内皮细胞（GEC）到足细胞的信号上调，并且这种上调的信号只能通过联合治疗而非单一治疗来正常化。 在糖尿病中由GEC分泌的Bmp6信号在DKD中被强烈诱导，并且这种信号主要通过SGLT2抑制剂单独或联合治疗来减弱。 Bmp6的受体Bmpr1a在足细胞中的表达是恒定的，与Bmp6在糖尿病中特异性上调的模式不同。 SGLT2抑制剂的作用机制重新将近曲小管聚类为S1和S2段，并确认Slc5a2表达仅限于S1段 通过分析每种治疗（单独和联合）在两周时如何改变S1与S2段的基因表达，发现SGLT2i在S1与S2段的独特基因数量（即与其他治疗不共享的）存在显著差异，与S1段作为SGLT2抑制的直接靶标一致。 SGLT2抑制剂能恢复S1段中Srsf7的表达，而ACE抑制剂或Rosi则不能 在RPTEC中通过siRNA敲低Srsf7，实现了mRNA和蛋白的>80%敲低 RPTEC中对照siRNA与Srsf7 siRNA的大量RNA测序揭示了基因表达的戏剧性变化，有近2000个基因发生了变化 基因变化的通路分析显示，在Srsf7敲低后，多种促炎术语上调，表明Srsf7通常促进S1段的健康和抗炎表型 一些被SGLT2i恢复的基因在Srsf7敲低后也表现出差异表达，为我们的模型和体内结果之间提供了机械联系 文章小结
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