今天看的一篇文献，里面用到了109种T细胞的特征进行打分，吓我一跳！来看看。文献来自2024年发表的，标题为《Identification of tumor-specific T cell signature predicting cancer immunotherapy response in bladder cancer by multi-omics analysis and experimental verification》。
文献中对应的图：  作者将这些基因集放到了这里：Supplementary Material 1，去下载看看！  109种T细胞特征的基因集TstcSig - 本研究构建的肿瘤特异性T细胞特征 Krishna.ACT.Stem.Like - Krishna团队定义的干细胞样活化T细胞 Krishna.ACT.Term.Diff - Krishna团队定义的终末分化活化T细胞 Li.CD8.DYS - Li团队定义的CD8+功能失调T细胞 TOX_Scott - Scott团队定义的TOX+耗竭T细胞 Wu.8EFF - Wu团队定义的CD8+效应T细胞 Wu.8EM - Wu团队定义的CD8+效应记忆T细胞 Wu.8Trm.1 - Wu团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群1 Wu.8Trm.2 - Wu团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群2 Wu.8Trm.3 - Wu团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群3 Wu.8chrom - Wu团队定义的染色质相关CD8+T细胞 Wu.8Mit - Wu团队定义的线粒体高CD8+T细胞 Wu.8KLRB1 - Wu团队定义的KLRB1+ CD8+T细胞 Oh.CD8.CD39 - Oh团队定义的CD39+ CD8+T细胞 Oh.CD8.Naive - Oh团队定义的CD8+初始T细胞 Oh.CD8.HSP - Oh团队定义的热休克蛋白高CD8+T细胞 Oh.CD8.MAIT - Oh团队定义的黏膜相关恒定T细胞 Oh.CD8.FGFBP2 - Oh团队定义的FGFBP2+ CD8+T细胞 Oh.CD8.RPL - Oh团队定义的核糖体蛋白高CD8+T细胞 Oh.CD8.MITO - Oh团队定义的线粒体相关CD8+T细胞 Oh.CD8.XCL - Oh团队定义的XCL+ CD8+T细胞 Oh.CD8.CM - Oh团队定义的中央记忆CD8+T细胞 Oh.CD8.PRO - Oh团队定义的增殖性CD8+T细胞 Mel_Exhaust_Tirosh - Tirosh团队定义的黑色素瘤耗竭T细胞 CD8_G_Feldman - Feldman团队定义的CD8+G类T细胞 CD8_B_Feldman - Feldman团队定义的CD8+B类T细胞 Exhaust_1_Feldman - Feldman团队定义的耗竭T细胞亚群1 Exhaust_2_Feldman - Feldman团队定义的耗竭T细胞亚群2 Exhaust_3_Feldman - Feldman团队定义的耗竭T细胞亚群3 Mem_Eff_4_Feldman - Feldman团队定义的记忆效应T细胞亚群4 Early.Act_5_Feldman - Feldman团队定义的早期活化T细胞亚群5 Mem_Eff_6_Feldman - Feldman团队定义的记忆效应T细胞亚群6 LCMV_PROG.EX_Miller - Miller团队定义的LCMV感染模型中的进展性耗竭T细胞 LCMV_TERMN.EX_Miller - Miller团队定义的LCMV感染模型中的终末耗竭T细胞 B16_PROG.EX_Miller - Miller团队定义的B16肿瘤模型中的进展性耗竭T细胞 B16_TERMINAL.EX_Miller - Miller团队定义的B16肿瘤模型中的终末耗竭T细胞 Wu.CD4.Trm - Wu团队定义的CD4+组织驻留记忆T细胞 Wu.CD4.RPL32 - Wu团队定义的RPL32+ CD4+T细胞 Wu.CD4.TCF7 - Wu团队定义的TCF7+ CD4+T细胞 Wu.CD4.FOS - Wu团队定义的FOS+ CD4+T细胞 Wu.CD4.IL6ST - Wu团队定义的IL6ST+ CD4+T细胞 Wu.Treg.1 - Wu团队定义的调节性T细胞亚群1 Wu.Treg.2 - Wu团队定义的调节性T细胞亚群2 Oh.CD4.CM - Oh团队定义的CD4+中央记忆T细胞 Oh.CD4IL2RAHI - Oh团队定义的IL2RA高表达CD4+T细胞 Oh.CD4IL2RALO - Oh团队定义的IL2RA低表达CD4+T细胞 Oh.CD4.Activate - Oh团队定义的活化CD4+T细胞 Oh.CD4.GZMB - Oh团队定义的GZMB+ CD4+T细胞 Oh.CD4.GZMK - Oh团队定义的GZMK+ CD4+T细胞 Oh.CD4.TH17 - Oh团队定义的Th17细胞 Oh.CD4.CXCL13 - Oh团队定义的CXCL13+ CD4+T细胞 Oh.CD4.MITO - Oh团队定义的线粒体相关CD4+T细胞 Oh.CD4.HSP - Oh团队定义的热休克蛋白高CD4+T细胞 Oh.CD4.PROLIF - Oh团队定义的增殖性CD4+T细胞 Oh.TIL_CD4IL2RAHI - Oh团队定义的肿瘤浸润IL2RA高表达CD4+T细胞 Oh.TIL_CD4IL2RALO - Oh团队定义的肿瘤浸润IL2RA低表达CD4+T细胞 Oh.TIL_CD4.GZMB - Oh团队定义的肿瘤浸润GZMB+ CD4+T细胞 Oh.TIL_CD4.GZMK - Oh团队定义的肿瘤浸润GZMK+ CD4+T细胞 Oliveira.TEM - Oliveira团队定义的效应记忆T细胞 Oliveira.TAct - Oliveira团队定义的活化T细胞 Oliveira.TPE - Oliveira团队定义的外周耗竭T细胞 Oliveira.TProl - Oliveira团队定义的增殖T细胞 Oliveira.TTE - Oliveira团队定义的终末效应T细胞 Oliveira.Tumor-spec TTE - Oliveira团队定义的肿瘤特异性终末效应T细胞 Oliveira.Tumor spec-TAct - Oliveira团队定义的肿瘤特异性活化T细胞 Oliveira.Tumor spec-TPE - Oliveira团队定义的肿瘤特异性外周耗竭T细胞 Oliveira.Tumor-spec TProl - Oliveira团队定义的肿瘤特异性增殖T细胞 Oliveira.Tumor-spec TEM - Oliveira团队定义的肿瘤特异性效应记忆T细胞 Yost_Naive - Yost团队定义的初始T细胞 Yost_CD8_Memory - Yost团队定义的CD8+记忆T细胞 Yost_CD8 Eff mem - Yost团队定义的CD8+效应记忆T细胞 Yost_CD8 Activated - Yost团队定义的活化CD8+T细胞 Yost_CD8 Act/Exh - Yost团队定义的活化/耗竭CD8+T细胞 Yost_CD8 Exh - Yost团队定义的耗竭CD8+T细胞 Jansen_Stem like - Jansen团队定义的干细胞样T细胞 Jansen_Term diff - Jansen团队定义的终末分化T细胞 Caushi.CD8-TRM(1) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群1 Caushi.CD8-Effector(1) - Caushi团队定义的CD8+效应T细胞亚群1 Caushi.CD4-Th(1) - Caushi团队定义的CD4+辅助T细胞亚群1 Caushi.CD8-Effector(2) - Caushi团队定义的CD8+效应T细胞亚群2 Caushi.CD4-Th(2) - Caushi团队定义的CD4+辅助T细胞亚群2 Caushi.CD4-Treg - Caushi团队定义的CD4+调节性T细胞 Caushi.MAIT - Caushi团队定义的黏膜相关恒定T细胞 Caushi.CD4-Tfh(1) - Caushi团队定义的CD4+滤泡辅助T细胞亚群1 Caushi.Stem-like memory - Caushi团队定义的干细胞样记忆T细胞 Caushi.CD8-TRM(2) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群2 Caushi.CD4-Tfh(2) - Caushi团队定义的CD4+滤泡辅助T细胞亚群2 Caushi.CD8-Effector(3) - Caushi团队定义的CD8+效应T细胞亚群3 Caushi.CD4-Th(3) - Caushi团队定义的CD4+辅助T细胞亚群3 Caushi.CD8-MHCII - Caushi团队定义的MHCII+ CD8+T细胞 Caushi.CD8-Proliferating - Caushi团队定义的增殖性CD8+T细胞 Caushi.CD4CD8(I) - Caushi团队定义的CD4CD8双阳性T细胞亚群1 Caushi.CD4CD8(II) - Caushi团队定义的CD4CD8双阳性T细胞亚群2 Caushi.CD8.Effector(I) - Caushi团队定义的CD8+效应T细胞亚群I Caushi.CD8.Effector(II) - Caushi团队定义的CD8+效应T细胞亚群II Caushi.CD8.Effector(III) - Caushi团队定义的CD8+效应T细胞亚群III Caushi.CD8.TRM(I) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群I Caushi.CD8.TRM(II) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群II Caushi.CD8.TRM(III) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群III Caushi.CD8.TRM(IV) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群IV Caushi.CD8.TRM(V) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群V Caushi.CD8.TRM(VI) - Caushi团队定义的CD8+组织驻留记忆T细胞亚群VI Caushi.CD8.CD4CD8(I) - Caushi团队定义的CD8+CD4CD8双阳性T细胞亚群I Caushi.CD8.CD4CD8(II) - Caushi团队定义的CD8+CD4CD8双阳性T细胞亚群II Caushi.CD8.Stem-like memory - Caushi团队定义的CD8+干细胞样记忆T细胞 Caushi.CD8.MAIT - Caushi团队定义的CD8+黏膜相关恒定T细胞 Caushi.CD8.Proliferating - Caushi团队定义的CD8+增殖性T细胞
真的是个大工程啊！
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