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总体而言,107 例基于肿瘤组织分析的BRAF V600E 突变 mCRC 患者被纳入 FIRE-4.5 研究的完整分析集。在 80 名患者中,收集了 161 份液体活检样本,其中从 66 名患者获得基线样本(BL,治疗前样本),从 51 名患者获得 95 份随访样本(FU)(图))。液体活检患者根据BRAF V600E 在循环肿瘤 DNA(ctDNA)中突变等位基因频率的分组图。白框:治疗开始前基线液体活检,灰框:治疗期间随访样本采集,MAF 突变等位基因频率(%),BRAF V600E MAF 截断值设为 0.17(见图 S2);BL 基线样本;* 纳入了 7 名后续随访样本中 MAF 升高的患者组。在基线(BL、治疗前)采集的 66 名患者的液体活检中,74%发现了预期的BRAF V600E 突变,而 26%的患者未观察到 BRAF 突变(见图。1,无花果。第三季)。两组游离 DNA 的含量无差异(P = 0.753,T 检验加韦尔奇修正;无花果。第三季)。其中一个 BL 样本被归类为主要由 RAS 突变,并被排除在研究之外。无论组织样本中的突变状态如何,BLBRAF V600 野生型状态与显著改善的 PFS 相关(13.2 个月对 6.5 个月;心率 0.47;P = 0.014)和 OS(36.8 个月对比 13.2 个月;心率 0.35;P = 0.02),与 BL BRAF V600E 突变患者比较(见图。2A)。此外,BL BRAF 野生型患者的客观反应率[ORR:60%(9/15)对 55%(24/44)]和疾病控制率[DCR:93%(15 人中的 14 人)对 77%(34 人中的 44 人)]通常更为有利(见图)。2B)。BRAF 基线时 ctDNA 中的 V600E 状态及患者结局。(A)仅含有 BRAF V600 野生型分子的 BL 患者与携带 BL 的 BRAF V600E 突变体(BL mut)变异体患者的生存曲线显示,野生型 BL 患者(BL wt)的结局更佳。(B)根据基线样本 CTDNA BRAF 突变状态分组患者的疾病控制率(DCR)和客观反应率(ORR)。ctDNA,循环肿瘤 DNA;CET、FOLFOXIRI 加 cetuximab;BEV、FOLFOXIRI 加贝伐单抗;PFS,即无进展生存期;OS,总体生存;HR 风险比及 95%置信区间(95%置信区间)采用 Kaplan–Meier 方法计算,P 值通过对数检验;或者,通过费舍尔精确检验计算的赔率比。虚线表示存活概率为 50%。组织活检与液体活检BRAF V600E 突变状态之间的不一致引发了一个问题:液体活检的结果究竟取决于原发肿瘤的位置(侧面性)还是转移模式。在原发肿瘤的侧面性方面,BL 突变状态未见差异(见图。第四季 A)。然而,本研究表明,液体活检所得的发现可能与转移的模式有关(见图。S4B)。如果转移仅发生在肝脏,BL BRAF V600E 突变更易被发现(比值 15.87;P < 0.0001)或多个器官(包括肝脏)(OR 16.12;P < 0.0001),或淋巴结转移(OR 6.11;P = 0.018)。相比之下,腹膜转移时基线检测 BRAF V600E 变异株(BL BRAF 野生型)的可能性较低。有趣的是,ctDNA 状态(BRAF V600E mut vs BRAF V600 wt)的结果影响了结局参数,而按转移部位分层患者时,结局无差异(见图)。第五季)。治疗组结果评估确认,使用头妥昔单抗治疗的患者结局不如贝伐昔单抗(见图)。3)。他们的 PFS 中位数为 5.7 个月,对比 10.4 个月(心率 2.5;P = 0.009),中位数 OS(闭塞率)为 11.6 个月对比 16.6 个月(心率 1.8;P = 0.15)。此外,ORR 为 44%(32 人中的 14 人)对 83%(12 人中的 10 人);P = 0.038]在 BL BRAF 突变患者中似乎较差,DCR 通常更差[72%(32 人中 23 人)对 92%(11 人中 12 人);P = 0.241](图。2B)。相比之下,接受西妥昔单抗治疗和贝伐单抗治疗的野生型患者,其生存参数相当(见图。3C),而 ORR [70%(10 人中的 7 人)对 40%(5 人中的 2 人),P = 0.328]和 DCR [100%(10 人中的 10 人)对比 80%(5 人中的 4 人);P = 0.333] 似乎更倾向于切妥昔单抗组(图。2B)。根据基线液体活检结果分类的患者组治疗效率比较。液体活检样本患者的生存曲线(A),BL 变数 N=49(B)与BL 体重 N=17(C)的比较。 在 PFS 期间,治疗组间存在显著差异:贝伐单抗治疗对 BL 突变组似乎更为有益。相比之下,BL 野生型患者组的效率几乎相同。BL,治疗开始前基线液体活检;CET、FOLFOXIRI 加 cetuximab;BEV、FOLFOXIRI 加贝伐单抗;PFS,即无进展生存期;OS,总体生存;使用 Kaplan–Meier 方法和对数秩检验计算了心率、风险比(95%置信区间)和 P 值;虚线表示存活概率为 50%。治疗期间对突变等位基因频率(MAF)的监测可能反映了肿瘤细胞的重构和克隆进化[35, 36]。作者检查了 BL BRAF 突变体状态(N=39)患者的随访样本,并通过 ddPCR 比较了 BRAF V600E 突变的 MAF(见图)。S1)。MAF 偏差超过 BL 值 30%的变更被视为相关变化(见图)。S1C,D)。折叠变化采用首个可用随访值(MAFFU/MAFBL)确定。0.3 个偏差的限制应确保测量异常值不被视为相关变化。6 例(15%)随访样本的 MAF 升高或稳定,值得注意的是该组所有患者均接受了西妥昔单抗治疗。基线时,39 名BRAF V600E 突变患者中 33 例(84.6%)MAF 下降。其中 18 名患者转为 BRAF V600 野生型(见图)。1 )。该组患者在治疗组中大致分布为 2:1,对应研究的随机分组模式。在 MAF 降低的患者中,6 人(15.4%)后来 MAF 增加(见图)。S1)。其中 5 例患者接受了头妥昔单抗组治疗,观察期内未记录临床进展。MAF 降低的患者(N=33)PFS 较优(7.9 个月对 2.3 个月,心率 0.24;P = 0.0009)和 OS(16.6 个月对 5.1 个月心率 0.13;P < 0.0001)相比于 MAF 稳定或升高的患者(N = 6)(见图)。同样 ,DCR [81%(32 人中 26 人)对 20%(5 人中 1 人);P = 0.013,OR 17.3 95% CI 1.94–217]和 ORR [59%(32 人中的 19 人)对 20%(5 人中 1 人);P = 0.159,OR 5.84(95%置信区间 0.75–74.6)在响应组中显著优越(图。第六季)。对转化为 BRAF 野生型(N=18)的患者,治疗组数据也进行了可比。在随访液体活检中,根据突变等位基因频率(MAF %)的变化对患者进行分组。初始BRAF V600E 突变 ctDNA 状态且 MAF 升高的患者 PFS 和 OS(A,B)最严重。另一方面,MAF 的降低是治疗后 PFS 和 OS 良好反应的指标(C)。OS,总体生存;PFS,即无进展生存期;P 值通过对数秩检验计算,除 + 外。此外,还通过 Gehan-Breslow-Wilcoxon 检验计算了 +P 值,对数秩 P = 0.053。虚线表示存活概率为 50%。头端单抗组中 MAF 升高的患者(N=6)出现最短的 PFS 和 OS(见图 S6 和 S7)。此外,接受西妥昔单抗组且 MAF 降低的患者 PFS 略短(7.7 个月对 10.1 个月,心率 1.62,P=0.212)和 OS(15.0 对 16.6;心率 1.29,P = 0.165),与贝伐单抗治疗患者比较(见图。第七季)。由于组内患者数量较少,统计值的幂性不足不可排除。3.6. 患者在留 BRAFV600E 野生型治疗中在 12 例基线时为BRAF V600 野生型的患者中,11 例(92%)的 ctDNA 状态无变化。一名接受贝伐单抗的患者在随访样本中显示 BRAF V600E 突变。该患者在观察期内病情稳定。因此,两种治疗组的存活率均为良好(见图。3C)。总之,本研究强调了液体活检作为临床工具在 mCRC 一线治疗指导中的作用,并展示了转移性模式化对 ctDNA 释放晚期阶段的影响。检测游离循环肿瘤 DNA 不仅具有预后价值,还能预测抗体联合化疗的使用情况。液体活检可在短周期内使用,从而实现患者低风险的实时方法,包括随访分析 。
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